Montagem e anotação do genoma de Xylella fastidiosa: identificação dos genes responsáveis pela síntese da goma fastidiana
| Ano de defesa: | 2001 |
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Resumo: | A bactéria Gram-negativa Xylella fastidiosa foi o primeiro fitopatógeno a ser completamente sequenciado. Esta bactéria causa uma série de doenças em plantas de importância econômica, incluindo a Clorose Variegada dos Cítrus (CVC), também conhecida como amarelinho. Esta tese descreve a participação do autor na montagem e anotação deste genoma, com especial ênfase à descrição do sistema de produção de um composto provavelmente ligado à patogenicidade da bactéria: a goma fastídiana. A análise da sequência genômica de Xylella fastidiosa revelou um fragmento de 12 Kb contendo um operon muito semelhante ao operon gum de Xanthomonas campestris. A presença de genes ligados à síntese de precursores de açúcares, a existência de reguladores da produção de exopolissacarídeos (EPS) em seu genoma e a ausência de 3 dos genes gum de Xanthomonas campestris sugerem que Xylella fastidiosa é capaz de sintetizar um EPS diferente da goma xantana. Este novo EPS seria fruto da polimerização de unidades repetidas de um tetrassacarídeo formado pela adição seqüencial de glicose-1-fosfato, glicose, manose e ácido glicurônico a um poliprenol carreador. |
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Silva, Felipe Rodrigues daLeite, AdilsonMenck, Carlos Frederico MartinsNóbrega, Francisco Gorgonio daKitajima, João PauloArruda, PauloSilva, Aline Maria daVincentz, Michel G. A.Leite, Adilson2023-10-04T19:13:36Z2023-10-04T19:13:36Z2001SILVA, F. R. Montagem e anotação do genoma de Xylella fastidiosa: identificação dos genes responsáveis pela síntese da goma fastidiana. 2001. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP, 2001.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/60696A bactéria Gram-negativa Xylella fastidiosa foi o primeiro fitopatógeno a ser completamente sequenciado. Esta bactéria causa uma série de doenças em plantas de importância econômica, incluindo a Clorose Variegada dos Cítrus (CVC), também conhecida como amarelinho. Esta tese descreve a participação do autor na montagem e anotação deste genoma, com especial ênfase à descrição do sistema de produção de um composto provavelmente ligado à patogenicidade da bactéria: a goma fastídiana. A análise da sequência genômica de Xylella fastidiosa revelou um fragmento de 12 Kb contendo um operon muito semelhante ao operon gum de Xanthomonas campestris. A presença de genes ligados à síntese de precursores de açúcares, a existência de reguladores da produção de exopolissacarídeos (EPS) em seu genoma e a ausência de 3 dos genes gum de Xanthomonas campestris sugerem que Xylella fastidiosa é capaz de sintetizar um EPS diferente da goma xantana. Este novo EPS seria fruto da polimerização de unidades repetidas de um tetrassacarídeo formado pela adição seqüencial de glicose-1-fosfato, glicose, manose e ácido glicurônico a um poliprenol carreador.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porGenomaBiopolímerosEngenharia GenéticaMontagem e anotação do genoma de Xylella fastidiosa: identificação dos genes responsáveis pela síntese da goma fastidianainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2001Universidade Estadual de Campinas.Campinas/SPinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/67b16e06-8b71-4fd3-b598-e498fdc5f666/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADORIGINALve_felipe_rodrigues_da_silva_biomanguinhos_2002.pdfapplication/pdf4547318https://arca.fiocruz.br/bitstreams/025201a5-7ffb-415c-bece-52b13ebe3729/download371a21a5faca32c285ee8bbdd3d47760MD52trueAnonymousREADTEXTve_felipe_rodrigues_da_silva_biomanguinhos_2002.pdf.txtve_felipe_rodrigues_da_silva_biomanguinhos_2002.pdf.txtExtracted texttext/plain152https://arca.fiocruz.br/bitstreams/abdaaf21-0c25-4e00-b7c4-96cf39d740cc/download6465350839c05bcfb50b779100d2bbd1MD55falseAnonymousREADTHUMBNAILve_felipe_rodrigues_da_silva_biomanguinhos_2002.pdf.jpgve_felipe_rodrigues_da_silva_biomanguinhos_2002.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4951https://arca.fiocruz.br/bitstreams/2d9624fb-4144-4c2f-bb21-9f8494bfadf6/download8e525dccbfcc509b88fab04aecf62a2aMD56falseAnonymousREADicict/606962025-07-29 21:56:36.476open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/60696https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-07-30T00:56:36Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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 |
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