tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
| Ano de defesa: | 2012 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Não Informado pela instituição
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Link de acesso: | https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843 |
Resumo: | Doenças neligenciadas são definidas como um grupo de doenças infecciosas crônicas relacionadas com a pobreza que ocorrem principalmente em populações da América Latina, África e Ásia. Entre elas estão a Doença de Chagas, Doença do Sono e Leishmaniose, transmitidas por insetos e causadas pelos protozoários Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania sp., respectivamente. Em busca de conhecimento básico sobre a biologia do tRNA destes tripanossomatídeos e prevendo a possibilidade de descoberta de novos alvos terapêuticos foi estudado o pouco conhecido mecanismo de editoração de tRNAs em tripanossomatídeos. Dentre as enzimas envolvidas na maturação de tRNAs, estão as tRNA ligases, que efetuam a ligação dos éxons gerados após retirada do íntron pela ação de uma tRNA endonuclease. O produto do gene da putativa tRNA ligase dos tripanossomatídeos (trl1-like) não possui homologia com o gene da tRNA ligase humana, sendo um promissor alvo para droga. O gene trl1 (tRNA ligase) é essencial para a levedura S. cerevisiae, dessa forma, esse trabalho procurou caracterizar funcionalmente a tRNA ligase de tripanossomatídeos, analisando os domínios da enzima dos parasitos, investigando a essencialidade do gene trl1-like em T. brucei e observando a atividade da enzima de T. brucei in vitro. O alinhamento das sequências da tRNA ligase de classe I de tripanossomatídeos e leveduras confirmou que as sequências tratam-se de tRNA ligases, apresentando os três domínios: ligase, polinucleotídeo quinase e fosfodiesterase cíclica assim como os motivos conservados essenciais para o funcionamento da enzima. Para os ensaios in vivo, foi construído o plasmídeo pLew100-trl1-2 e transfectado em T. brucei procíclicos, para os ensaios de RNAi. Durante a indução do RNAi pode-se observar a inibição do crescimento do T. brucei, sempre a partir do quarto dia de indução. No entanto, nenhuma alteração no ciclo celular e na viabilidade dos parasitos foi verificada. O silenciamento gênico foi confirmado por qPCR, demonstrando diminuição da expressão do mRNA a partir de 48 h de indução. A enzima Trl1-like foi expressa e purificada in vitro sob diversas condições experimentais, no entanto não foi possível testar sua atividade devido a sua instabilidade in vitro. Esse trabalho permitiu demonstrar a importância da Trl1-like para a sobrevivência do T. brucei contribuindo para um maior entendimento da biologia dos tripanossomatídeos. |
| id |
CRUZ_3d3311f469e6e8c9b606f02bf3985508 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:arca.fiocruz.br:icict/61843 |
| network_acronym_str |
CRUZ |
| network_name_str |
Repositório Institucional da Fiocruz (ARCA) |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Bruno, Roberta EitlerFernandes, José Roberto MeyerSantos, André Luis Souza dosLevy, Claudia Mansini d’AvilaFantappié, Marcelo RosadoRodrigues, Juliany Cola FernandesPolycarpo, Carla Ribeiro2023-12-18T14:14:55Z2023-12-18T14:14:55Z2012BRUNO, Roberta Eitler. RNA ligase (trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vitro. 2012. 110 f. Dissertação (Mestrado) – Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica, 2012.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843Doenças neligenciadas são definidas como um grupo de doenças infecciosas crônicas relacionadas com a pobreza que ocorrem principalmente em populações da América Latina, África e Ásia. Entre elas estão a Doença de Chagas, Doença do Sono e Leishmaniose, transmitidas por insetos e causadas pelos protozoários Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania sp., respectivamente. Em busca de conhecimento básico sobre a biologia do tRNA destes tripanossomatídeos e prevendo a possibilidade de descoberta de novos alvos terapêuticos foi estudado o pouco conhecido mecanismo de editoração de tRNAs em tripanossomatídeos. Dentre as enzimas envolvidas na maturação de tRNAs, estão as tRNA ligases, que efetuam a ligação dos éxons gerados após retirada do íntron pela ação de uma tRNA endonuclease. O produto do gene da putativa tRNA ligase dos tripanossomatídeos (trl1-like) não possui homologia com o gene da tRNA ligase humana, sendo um promissor alvo para droga. O gene trl1 (tRNA ligase) é essencial para a levedura S. cerevisiae, dessa forma, esse trabalho procurou caracterizar funcionalmente a tRNA ligase de tripanossomatídeos, analisando os domínios da enzima dos parasitos, investigando a essencialidade do gene trl1-like em T. brucei e observando a atividade da enzima de T. brucei in vitro. O alinhamento das sequências da tRNA ligase de classe I de tripanossomatídeos e leveduras confirmou que as sequências tratam-se de tRNA ligases, apresentando os três domínios: ligase, polinucleotídeo quinase e fosfodiesterase cíclica assim como os motivos conservados essenciais para o funcionamento da enzima. Para os ensaios in vivo, foi construído o plasmídeo pLew100-trl1-2 e transfectado em T. brucei procíclicos, para os ensaios de RNAi. Durante a indução do RNAi pode-se observar a inibição do crescimento do T. brucei, sempre a partir do quarto dia de indução. No entanto, nenhuma alteração no ciclo celular e na viabilidade dos parasitos foi verificada. O silenciamento gênico foi confirmado por qPCR, demonstrando diminuição da expressão do mRNA a partir de 48 h de indução. A enzima Trl1-like foi expressa e purificada in vitro sob diversas condições experimentais, no entanto não foi possível testar sua atividade devido a sua instabilidade in vitro. Esse trabalho permitiu demonstrar a importância da Trl1-like para a sobrevivência do T. brucei contribuindo para um maior entendimento da biologia dos tripanossomatídeos.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porTrypanosoma bruceitRNA ligaseEditoração de tRNAtRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2012Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Mestrado AcadêmicoRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Química Biológicainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdfCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdfapplication/pdf1924149https://arca.fiocruz.br/bitstreams/93358ce5-b892-492c-83b6-639ac2b4d466/download734137733c96171ca5c1b2632f3527b7MD52trueAnonymousREADLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/518588fc-7a14-41cf-9f42-86ee1c4e9677/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADTEXTCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.txtCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.txtExtracted texttext/plain102835https://arca.fiocruz.br/bitstreams/c8441c76-6cab-4097-9aa5-9dc8cf45dd6c/downloadfa08f74ebac78c325ab2d3a0fdafa06bMD57falseAnonymousREADTHUMBNAILCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.jpgCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg17604https://arca.fiocruz.br/bitstreams/d9eb2fb7-2455-4e20-84c7-2e63aea27579/download3871a2c9f168562de36a3e1ac78a59e4MD58falseAnonymousREADicict/618432025-12-11 08:22:56.582open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/61843https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:22:56Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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 |
| dc.title.none.fl_str_mv |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo |
| title |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo |
| spellingShingle |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo Bruno, Roberta Eitler Trypanosoma brucei tRNA ligase Editoração de tRNA |
| title_short |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo |
| title_full |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo |
| title_fullStr |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo |
| title_full_unstemmed |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo |
| title_sort |
tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo |
| author |
Bruno, Roberta Eitler |
| author_facet |
Bruno, Roberta Eitler |
| author_role |
author |
| dc.contributor.member.none.fl_str_mv |
Fernandes, José Roberto Meyer Santos, André Luis Souza dos Levy, Claudia Mansini d’Avila Fantappié, Marcelo Rosado Rodrigues, Juliany Cola Fernandes |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Bruno, Roberta Eitler |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Polycarpo, Carla Ribeiro |
| contributor_str_mv |
Polycarpo, Carla Ribeiro |
| dc.subject.other.none.fl_str_mv |
Trypanosoma brucei tRNA ligase Editoração de tRNA |
| topic |
Trypanosoma brucei tRNA ligase Editoração de tRNA |
| description |
Doenças neligenciadas são definidas como um grupo de doenças infecciosas crônicas relacionadas com a pobreza que ocorrem principalmente em populações da América Latina, África e Ásia. Entre elas estão a Doença de Chagas, Doença do Sono e Leishmaniose, transmitidas por insetos e causadas pelos protozoários Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania sp., respectivamente. Em busca de conhecimento básico sobre a biologia do tRNA destes tripanossomatídeos e prevendo a possibilidade de descoberta de novos alvos terapêuticos foi estudado o pouco conhecido mecanismo de editoração de tRNAs em tripanossomatídeos. Dentre as enzimas envolvidas na maturação de tRNAs, estão as tRNA ligases, que efetuam a ligação dos éxons gerados após retirada do íntron pela ação de uma tRNA endonuclease. O produto do gene da putativa tRNA ligase dos tripanossomatídeos (trl1-like) não possui homologia com o gene da tRNA ligase humana, sendo um promissor alvo para droga. O gene trl1 (tRNA ligase) é essencial para a levedura S. cerevisiae, dessa forma, esse trabalho procurou caracterizar funcionalmente a tRNA ligase de tripanossomatídeos, analisando os domínios da enzima dos parasitos, investigando a essencialidade do gene trl1-like em T. brucei e observando a atividade da enzima de T. brucei in vitro. O alinhamento das sequências da tRNA ligase de classe I de tripanossomatídeos e leveduras confirmou que as sequências tratam-se de tRNA ligases, apresentando os três domínios: ligase, polinucleotídeo quinase e fosfodiesterase cíclica assim como os motivos conservados essenciais para o funcionamento da enzima. Para os ensaios in vivo, foi construído o plasmídeo pLew100-trl1-2 e transfectado em T. brucei procíclicos, para os ensaios de RNAi. Durante a indução do RNAi pode-se observar a inibição do crescimento do T. brucei, sempre a partir do quarto dia de indução. No entanto, nenhuma alteração no ciclo celular e na viabilidade dos parasitos foi verificada. O silenciamento gênico foi confirmado por qPCR, demonstrando diminuição da expressão do mRNA a partir de 48 h de indução. A enzima Trl1-like foi expressa e purificada in vitro sob diversas condições experimentais, no entanto não foi possível testar sua atividade devido a sua instabilidade in vitro. Esse trabalho permitiu demonstrar a importância da Trl1-like para a sobrevivência do T. brucei contribuindo para um maior entendimento da biologia dos tripanossomatídeos. |
| publishDate |
2012 |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2012 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2023-12-18T14:14:55Z |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2023-12-18T14:14:55Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
BRUNO, Roberta Eitler. RNA ligase (trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vitro. 2012. 110 f. Dissertação (Mestrado) – Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica, 2012. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843 |
| identifier_str_mv |
BRUNO, Roberta Eitler. RNA ligase (trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vitro. 2012. 110 f. Dissertação (Mestrado) – Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica, 2012. |
| url |
https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) instacron:FIOCRUZ |
| instname_str |
Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
| instacron_str |
FIOCRUZ |
| institution |
FIOCRUZ |
| reponame_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
| collection |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/93358ce5-b892-492c-83b6-639ac2b4d466/download https://arca.fiocruz.br/bitstreams/518588fc-7a14-41cf-9f42-86ee1c4e9677/download https://arca.fiocruz.br/bitstreams/c8441c76-6cab-4097-9aa5-9dc8cf45dd6c/download https://arca.fiocruz.br/bitstreams/d9eb2fb7-2455-4e20-84c7-2e63aea27579/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
734137733c96171ca5c1b2632f3527b7 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 fa08f74ebac78c325ab2d3a0fdafa06b 3871a2c9f168562de36a3e1ac78a59e4 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.arca@fiocruz.br |
| _version_ |
1855588571288698880 |