tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2012
Autor(a) principal: Bruno, Roberta Eitler
Orientador(a): Polycarpo, Carla Ribeiro
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843
Resumo: Doenças neligenciadas são definidas como um grupo de doenças infecciosas crônicas relacionadas com a pobreza que ocorrem principalmente em populações da América Latina, África e Ásia. Entre elas estão a Doença de Chagas, Doença do Sono e Leishmaniose, transmitidas por insetos e causadas pelos protozoários Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania sp., respectivamente. Em busca de conhecimento básico sobre a biologia do tRNA destes tripanossomatídeos e prevendo a possibilidade de descoberta de novos alvos terapêuticos foi estudado o pouco conhecido mecanismo de editoração de tRNAs em tripanossomatídeos. Dentre as enzimas envolvidas na maturação de tRNAs, estão as tRNA ligases, que efetuam a ligação dos éxons gerados após retirada do íntron pela ação de uma tRNA endonuclease. O produto do gene da putativa tRNA ligase dos tripanossomatídeos (trl1-like) não possui homologia com o gene da tRNA ligase humana, sendo um promissor alvo para droga. O gene trl1 (tRNA ligase) é essencial para a levedura S. cerevisiae, dessa forma, esse trabalho procurou caracterizar funcionalmente a tRNA ligase de tripanossomatídeos, analisando os domínios da enzima dos parasitos, investigando a essencialidade do gene trl1-like em T. brucei e observando a atividade da enzima de T. brucei in vitro. O alinhamento das sequências da tRNA ligase de classe I de tripanossomatídeos e leveduras confirmou que as sequências tratam-se de tRNA ligases, apresentando os três domínios: ligase, polinucleotídeo quinase e fosfodiesterase cíclica assim como os motivos conservados essenciais para o funcionamento da enzima. Para os ensaios in vivo, foi construído o plasmídeo pLew100-trl1-2 e transfectado em T. brucei procíclicos, para os ensaios de RNAi. Durante a indução do RNAi pode-se observar a inibição do crescimento do T. brucei, sempre a partir do quarto dia de indução. No entanto, nenhuma alteração no ciclo celular e na viabilidade dos parasitos foi verificada. O silenciamento gênico foi confirmado por qPCR, demonstrando diminuição da expressão do mRNA a partir de 48 h de indução. A enzima Trl1-like foi expressa e purificada in vitro sob diversas condições experimentais, no entanto não foi possível testar sua atividade devido a sua instabilidade in vitro. Esse trabalho permitiu demonstrar a importância da Trl1-like para a sobrevivência do T. brucei contribuindo para um maior entendimento da biologia dos tripanossomatídeos.
id CRUZ_3d3311f469e6e8c9b606f02bf3985508
oai_identifier_str oai:arca.fiocruz.br:icict/61843
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da Fiocruz (ARCA)
repository_id_str
spelling Bruno, Roberta EitlerFernandes, José Roberto MeyerSantos, André Luis Souza dosLevy, Claudia Mansini d’AvilaFantappié, Marcelo RosadoRodrigues, Juliany Cola FernandesPolycarpo, Carla Ribeiro2023-12-18T14:14:55Z2023-12-18T14:14:55Z2012BRUNO, Roberta Eitler. RNA ligase (trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vitro. 2012. 110 f. Dissertação (Mestrado) – Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica, 2012.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843Doenças neligenciadas são definidas como um grupo de doenças infecciosas crônicas relacionadas com a pobreza que ocorrem principalmente em populações da América Latina, África e Ásia. Entre elas estão a Doença de Chagas, Doença do Sono e Leishmaniose, transmitidas por insetos e causadas pelos protozoários Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania sp., respectivamente. Em busca de conhecimento básico sobre a biologia do tRNA destes tripanossomatídeos e prevendo a possibilidade de descoberta de novos alvos terapêuticos foi estudado o pouco conhecido mecanismo de editoração de tRNAs em tripanossomatídeos. Dentre as enzimas envolvidas na maturação de tRNAs, estão as tRNA ligases, que efetuam a ligação dos éxons gerados após retirada do íntron pela ação de uma tRNA endonuclease. O produto do gene da putativa tRNA ligase dos tripanossomatídeos (trl1-like) não possui homologia com o gene da tRNA ligase humana, sendo um promissor alvo para droga. O gene trl1 (tRNA ligase) é essencial para a levedura S. cerevisiae, dessa forma, esse trabalho procurou caracterizar funcionalmente a tRNA ligase de tripanossomatídeos, analisando os domínios da enzima dos parasitos, investigando a essencialidade do gene trl1-like em T. brucei e observando a atividade da enzima de T. brucei in vitro. O alinhamento das sequências da tRNA ligase de classe I de tripanossomatídeos e leveduras confirmou que as sequências tratam-se de tRNA ligases, apresentando os três domínios: ligase, polinucleotídeo quinase e fosfodiesterase cíclica assim como os motivos conservados essenciais para o funcionamento da enzima. Para os ensaios in vivo, foi construído o plasmídeo pLew100-trl1-2 e transfectado em T. brucei procíclicos, para os ensaios de RNAi. Durante a indução do RNAi pode-se observar a inibição do crescimento do T. brucei, sempre a partir do quarto dia de indução. No entanto, nenhuma alteração no ciclo celular e na viabilidade dos parasitos foi verificada. O silenciamento gênico foi confirmado por qPCR, demonstrando diminuição da expressão do mRNA a partir de 48 h de indução. A enzima Trl1-like foi expressa e purificada in vitro sob diversas condições experimentais, no entanto não foi possível testar sua atividade devido a sua instabilidade in vitro. Esse trabalho permitiu demonstrar a importância da Trl1-like para a sobrevivência do T. brucei contribuindo para um maior entendimento da biologia dos tripanossomatídeos.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porTrypanosoma bruceitRNA ligaseEditoração de tRNAtRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2012Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Mestrado AcadêmicoRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Química Biológicainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdfCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdfapplication/pdf1924149https://arca.fiocruz.br/bitstreams/93358ce5-b892-492c-83b6-639ac2b4d466/download734137733c96171ca5c1b2632f3527b7MD52trueAnonymousREADLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/518588fc-7a14-41cf-9f42-86ee1c4e9677/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADTEXTCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.txtCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.txtExtracted texttext/plain102835https://arca.fiocruz.br/bitstreams/c8441c76-6cab-4097-9aa5-9dc8cf45dd6c/downloadfa08f74ebac78c325ab2d3a0fdafa06bMD57falseAnonymousREADTHUMBNAILCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.jpgCCS_M_RobertaEitlerBruno.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg17604https://arca.fiocruz.br/bitstreams/d9eb2fb7-2455-4e20-84c7-2e63aea27579/download3871a2c9f168562de36a3e1ac78a59e4MD58falseAnonymousREADicict/618432025-12-11 08:22:56.582open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/61843https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:22:56Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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
dc.title.none.fl_str_mv tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
title tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
spellingShingle tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
Bruno, Roberta Eitler
Trypanosoma brucei
tRNA ligase
Editoração de tRNA
title_short tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
title_full tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
title_fullStr tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
title_full_unstemmed tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
title_sort tRNA ligase (Trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vivo
author Bruno, Roberta Eitler
author_facet Bruno, Roberta Eitler
author_role author
dc.contributor.member.none.fl_str_mv Fernandes, José Roberto Meyer
Santos, André Luis Souza dos
Levy, Claudia Mansini d’Avila
Fantappié, Marcelo Rosado
Rodrigues, Juliany Cola Fernandes
dc.contributor.author.fl_str_mv Bruno, Roberta Eitler
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Polycarpo, Carla Ribeiro
contributor_str_mv Polycarpo, Carla Ribeiro
dc.subject.other.none.fl_str_mv Trypanosoma brucei
tRNA ligase
Editoração de tRNA
topic Trypanosoma brucei
tRNA ligase
Editoração de tRNA
description Doenças neligenciadas são definidas como um grupo de doenças infecciosas crônicas relacionadas com a pobreza que ocorrem principalmente em populações da América Latina, África e Ásia. Entre elas estão a Doença de Chagas, Doença do Sono e Leishmaniose, transmitidas por insetos e causadas pelos protozoários Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania sp., respectivamente. Em busca de conhecimento básico sobre a biologia do tRNA destes tripanossomatídeos e prevendo a possibilidade de descoberta de novos alvos terapêuticos foi estudado o pouco conhecido mecanismo de editoração de tRNAs em tripanossomatídeos. Dentre as enzimas envolvidas na maturação de tRNAs, estão as tRNA ligases, que efetuam a ligação dos éxons gerados após retirada do íntron pela ação de uma tRNA endonuclease. O produto do gene da putativa tRNA ligase dos tripanossomatídeos (trl1-like) não possui homologia com o gene da tRNA ligase humana, sendo um promissor alvo para droga. O gene trl1 (tRNA ligase) é essencial para a levedura S. cerevisiae, dessa forma, esse trabalho procurou caracterizar funcionalmente a tRNA ligase de tripanossomatídeos, analisando os domínios da enzima dos parasitos, investigando a essencialidade do gene trl1-like em T. brucei e observando a atividade da enzima de T. brucei in vitro. O alinhamento das sequências da tRNA ligase de classe I de tripanossomatídeos e leveduras confirmou que as sequências tratam-se de tRNA ligases, apresentando os três domínios: ligase, polinucleotídeo quinase e fosfodiesterase cíclica assim como os motivos conservados essenciais para o funcionamento da enzima. Para os ensaios in vivo, foi construído o plasmídeo pLew100-trl1-2 e transfectado em T. brucei procíclicos, para os ensaios de RNAi. Durante a indução do RNAi pode-se observar a inibição do crescimento do T. brucei, sempre a partir do quarto dia de indução. No entanto, nenhuma alteração no ciclo celular e na viabilidade dos parasitos foi verificada. O silenciamento gênico foi confirmado por qPCR, demonstrando diminuição da expressão do mRNA a partir de 48 h de indução. A enzima Trl1-like foi expressa e purificada in vitro sob diversas condições experimentais, no entanto não foi possível testar sua atividade devido a sua instabilidade in vitro. Esse trabalho permitiu demonstrar a importância da Trl1-like para a sobrevivência do T. brucei contribuindo para um maior entendimento da biologia dos tripanossomatídeos.
publishDate 2012
dc.date.issued.fl_str_mv 2012
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-12-18T14:14:55Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-12-18T14:14:55Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv BRUNO, Roberta Eitler. RNA ligase (trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vitro. 2012. 110 f. Dissertação (Mestrado) – Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica, 2012.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843
identifier_str_mv BRUNO, Roberta Eitler. RNA ligase (trl1) -like de Trypanosoma brucei: efeitos do RNAi in vitro. 2012. 110 f. Dissertação (Mestrado) – Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica, 2012.
url https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61843
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://arca.fiocruz.br/bitstreams/93358ce5-b892-492c-83b6-639ac2b4d466/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/518588fc-7a14-41cf-9f42-86ee1c4e9677/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/c8441c76-6cab-4097-9aa5-9dc8cf45dd6c/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/d9eb2fb7-2455-4e20-84c7-2e63aea27579/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 734137733c96171ca5c1b2632f3527b7
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
fa08f74ebac78c325ab2d3a0fdafa06b
3871a2c9f168562de36a3e1ac78a59e4
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1855588571288698880