Caracterização molecular dos vírus dengue circulantes em Pernambuco: implicações epidemiológicas
Ano de defesa: | 2013 |
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Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães
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Link de acesso: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/10514 |
Resumo: | Dengue (DENV) é a arbovirose de maior prevalência em humanos no mundo. Estudos moleculares são necessários para melhor entendimento de sua origem e história evolucionária. Análises filogenéticas e epidemiológicas sugerem que genótipos mais virulentos estão substituindo os de menor impacto epidemiológico. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar geneticamente os sorotipos 1, 2 e 3 do DENV isolados no estado de Pernambuco, de 1995 a 2010, através do sequenciamento e análise de variações do genoma completo do vírus. Os isolados de DENV-1 foram incluídos no genótipo V e três linhagens foram observadas: a linhagem I se relacionou com a cepa BR-90, oriunda do Rio de Janeiro; a linhagem II com isolados da Colômbia e Venezuela; a linhagem III mostrou relação com cepas das Ilhas Virgens e de Cingapura, sugerindo possível origem a partir do Caribe e/ou Ásia. Para o DENV -2 foi identificado o genótipo Sudeste Asiático/Americano. Duas linhagens foram observadas, a linhagem I teve sua origem provável a partir da Venezuela e foi substi tuída pela linhagem II, que possivelmente se originou da Jamaica. Os isolados de DENV-3 foram incluídos no genótipo III cuja origem possivelmente se deu pela introdução de uma cepa do Rio de Janeiro, oriunda das ilhas do Caribe. Substituições em nucleotídeos e aminoácidos foram encontradas ao longo dos genomas, as quais podem estar envolvidas em importantes alterações em funções das proteínas virais, mas nenhuma associação com a forma clínica da doença ou tipo de infecção foi identificada. Apenas alterações nucleotídicas em 5´UTR de DENV-3 previu estrutura secundária diferente. Alterações nucleotídicas e estruturais em 3´UTR não se relacionaram com a gravidade da doença. A pressão evolucionária observada foi seleção purificadora. Foram identificadas mutações que são específicas dos isolados e/ou linhagens de Pernambuco, que podem ser elementos virais genéticos que contribuem para sua contínua circulação na região e seu potencial epidêmico |
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O presente trabalho teve como objetivo caracterizar geneticamente os sorotipos 1, 2 e 3 do DENV isolados no estado de Pernambuco, de 1995 a 2010, através do sequenciamento e análise de variações do genoma completo do vírus. Os isolados de DENV-1 foram incluídos no genótipo V e três linhagens foram observadas: a linhagem I se relacionou com a cepa BR-90, oriunda do Rio de Janeiro; a linhagem II com isolados da Colômbia e Venezuela; a linhagem III mostrou relação com cepas das Ilhas Virgens e de Cingapura, sugerindo possível origem a partir do Caribe e/ou Ásia. Para o DENV -2 foi identificado o genótipo Sudeste Asiático/Americano. Duas linhagens foram observadas, a linhagem I teve sua origem provável a partir da Venezuela e foi substi tuída pela linhagem II, que possivelmente se originou da Jamaica. Os isolados de DENV-3 foram incluídos no genótipo III cuja origem possivelmente se deu pela introdução de uma cepa do Rio de Janeiro, oriunda das ilhas do Caribe. Substituições em nucleotídeos e aminoácidos foram encontradas ao longo dos genomas, as quais podem estar envolvidas em importantes alterações em funções das proteínas virais, mas nenhuma associação com a forma clínica da doença ou tipo de infecção foi identificada. Apenas alterações nucleotídicas em 5´UTR de DENV-3 previu estrutura secundária diferente. Alterações nucleotídicas e estruturais em 3´UTR não se relacionaram com a gravidade da doença. A pressão evolucionária observada foi seleção purificadora. Foram identificadas mutações que são específicas dos isolados e/ou linhagens de Pernambuco, que podem ser elementos virais genéticos que contribuem para sua contínua circulação na região e seu potencial epidêmicoFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, BrasilporCentro de Pesquisas Aggeu MagalhãesCaracterização molecular dos vírus dengue circulantes em Pernambuco: implicações epidemiológicasMolecular characterization of dengue circulating in Pernambuco: epidemiological implicationsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2013-03-25Centro de Pesquisas Aggeu MagalhãesRecife/PEDengueEpidemiologia MolecularGenótipoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINAL172.pdfapplication/pdf4084743https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/10514/1/172.pdfa14b960291b86dfd51452b5c15a760c6MD51LICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/10514/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXT172.pdf.txt172.pdf.txtExtracted texttext/plain228262https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/10514/3/172.pdf.txtf522326dd9c544a9ca715a2784a0ef79MD53icict/105142019-05-06 12:14:36.014oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-05-06T15:14:36Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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