Aspectos epidemiológicos e moleculares da transmissão da dengue no estado da Bahia
Ano de defesa: | 2009 |
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Tipo de documento: | Dissertação |
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Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz
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Resumo: | Neste trabalho foram avaliados três importantes aspectos da dengue na Bahia. Inicialmente, determinamos a distribuição dos sorotipos do vírus no estado da Bahia durante 2001, 2002 e 2003 baseando-se nos isolamentos virais realizados pelo Laboratório Central do Estado (LACEN). Em 2001, houve 169 isolamentos de DENV-1 e 53 de DENV-2. Em 2002, foram isolados 123 DENV-1, 50 DENV-2, além do aparecimento do DENV-3 (273 isolamentos). Em janeiro de 2002, com DENV-1 e DENV-2 sendo isolados em todo o estado, 95% de todos os isolamentos de DENV-3 foram de amostras da capital, Salvador, e os 5% restantes foram do município de Lauro de Freitas conurbado à mesma, onde se situa o aeroporto de Salvador. Em fevereiro de 2002, a epidemia estava distribuída em cidades onde as três principais rodovias dão acesso. A distribuição do DENV-3 em 2002 foi distintamente diferente dos sorotipos circulantes na Bahia refletindo a introdução de um novo sorotipo no estado provavelmente por Salvador. A fim de obter informações sobre as cepas de DENV circulantes foi realizada entre 2006 e 2007 vigilância molecular a partir das amostras isoladas pelo LACEN. Baseado nos resultados de sequenciamento da junção das proteínas E/NS1 de 32 amostras foram demonstrados os genótipos Indiano e Asiático para os sorotipos DENV-3 e DENV-2, respectivamente. DENV-2 apesar de em toda a América ter sido relacionado com a ocorrência de FHD, na Bahia sua introdução não causou aparecimento dessa forma da doença. Interessantemente, as amostras estudadas para DENV-3 agruparam-se com isolados de anos muito diferentes apesar de os valores de bootstrap significativos (acima de 70%), adicionalmente, amostras de diferentes locais do Brasil e América do Sul agruparam-se muito próximas das testadas, confirmando o potencial epidêmico deste genótipo vira/. Finalmente, foi aplicada uma abordagem no estudo da estrutura genética da população de Aedes aegypti em Salvador através da utilização de marcadores de microssatélites. Após primers previamente publicados terem sido testados e falharem com nossas amostras, novos marcadores foram testados e desenvolvidos. Amostras de Aedes aegypti foram coletadas no entorno da Baía de Todos os Santos. Foram definidas três regiões geográficas, Norte, Central e Sul de Salvador a fim de testarmos a hipótese de isolamento geográfico das populações de Aedes aegypti através do valor de Fst. Os valores de Fst foram determinados entre Norte-Central 0,0073; Sul-Norte entre 0,0182 e Central-Sul 0,0011. Apesar de um pequeno valor de Fst, encontrou-se uma relação direta entre distância geográfica e estes valores, indicando que distância pode ser um fator limitante para fluxo gênico desse vetar em Salvador. Os resultados indicam que outros obstáculos além da distância podem existir na cidade de Salvador evidenciado pelo valor de Fst entre Norte-Central. Os novos marcadores de microssatélites descritos em nosso trabalho poderão ser utilizados na composição de uma ferramenta de entomologia molecular para estudos de estrutura genética de população de Aedes aegypti no ambiente urbano em diferentes localidades. |
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Melo, Paulo Roberto Santana deOliveira, Ricardo Lourenço deAlmeida, Maria da Conceição Chagas deMoreira Júnior, Edson DuarteCosta, Jackson Maurício LopesReis, Mitermayer Galvão dosReis, Mitermayer Galvão dos2019-08-19T16:46:53Z2019-08-19T16:46:53Z2009MELO, Paulo Roberto Santana de. Aspectos epidemiológicos e moleculares da transmissão da dengue no estado da Bahia. 2009. 102 f. Tese (Doutorado em Patologia) - Universidade Federal da Bahia; Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2009.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34879Neste trabalho foram avaliados três importantes aspectos da dengue na Bahia. Inicialmente, determinamos a distribuição dos sorotipos do vírus no estado da Bahia durante 2001, 2002 e 2003 baseando-se nos isolamentos virais realizados pelo Laboratório Central do Estado (LACEN). Em 2001, houve 169 isolamentos de DENV-1 e 53 de DENV-2. Em 2002, foram isolados 123 DENV-1, 50 DENV-2, além do aparecimento do DENV-3 (273 isolamentos). Em janeiro de 2002, com DENV-1 e DENV-2 sendo isolados em todo o estado, 95% de todos os isolamentos de DENV-3 foram de amostras da capital, Salvador, e os 5% restantes foram do município de Lauro de Freitas conurbado à mesma, onde se situa o aeroporto de Salvador. Em fevereiro de 2002, a epidemia estava distribuída em cidades onde as três principais rodovias dão acesso. A distribuição do DENV-3 em 2002 foi distintamente diferente dos sorotipos circulantes na Bahia refletindo a introdução de um novo sorotipo no estado provavelmente por Salvador. A fim de obter informações sobre as cepas de DENV circulantes foi realizada entre 2006 e 2007 vigilância molecular a partir das amostras isoladas pelo LACEN. Baseado nos resultados de sequenciamento da junção das proteínas E/NS1 de 32 amostras foram demonstrados os genótipos Indiano e Asiático para os sorotipos DENV-3 e DENV-2, respectivamente. DENV-2 apesar de em toda a América ter sido relacionado com a ocorrência de FHD, na Bahia sua introdução não causou aparecimento dessa forma da doença. Interessantemente, as amostras estudadas para DENV-3 agruparam-se com isolados de anos muito diferentes apesar de os valores de bootstrap significativos (acima de 70%), adicionalmente, amostras de diferentes locais do Brasil e América do Sul agruparam-se muito próximas das testadas, confirmando o potencial epidêmico deste genótipo vira/. Finalmente, foi aplicada uma abordagem no estudo da estrutura genética da população de Aedes aegypti em Salvador através da utilização de marcadores de microssatélites. Após primers previamente publicados terem sido testados e falharem com nossas amostras, novos marcadores foram testados e desenvolvidos. Amostras de Aedes aegypti foram coletadas no entorno da Baía de Todos os Santos. Foram definidas três regiões geográficas, Norte, Central e Sul de Salvador a fim de testarmos a hipótese de isolamento geográfico das populações de Aedes aegypti através do valor de Fst. Os valores de Fst foram determinados entre Norte-Central 0,0073; Sul-Norte entre 0,0182 e Central-Sul 0,0011. Apesar de um pequeno valor de Fst, encontrou-se uma relação direta entre distância geográfica e estes valores, indicando que distância pode ser um fator limitante para fluxo gênico desse vetar em Salvador. Os resultados indicam que outros obstáculos além da distância podem existir na cidade de Salvador evidenciado pelo valor de Fst entre Norte-Central. Os novos marcadores de microssatélites descritos em nosso trabalho poderão ser utilizados na composição de uma ferramenta de entomologia molecular para estudos de estrutura genética de população de Aedes aegypti no ambiente urbano em diferentes localidades.In this work were evaluated three important issues of the dengue in Bahia. It was deternnined the serotypes distribution between 2001, 2002 and 2003 based in the viral isolation for the State Central Laboratory (LACEN). In 2001, 169 DENV-1 were isolated and 53 of DENV-2. In 2002 123 DENV-1, 50 DENV-2 and the new appearance of the DENV-3 (273 isolating) were isolated. In January of 2002, with DENV-1 and DENV-2 been detected in all state, 95% of all isolating was from Salvador, and only 5% were from Lauro de Freitas close to the capital, where the airport is located. In February of 2002, the outbreak occurred in different cities following the main roads pattern. The DENV-3 distribution in this period was very different of the previous serotypes circulating indicating the introduction of a new virus probably through Salvador. To investigate DENV strains circulating in Bahia state, we did molecular surveillance between 2006 and 2007 of the samples analyzed by LACEN. Based in the sequencing results of the junction of the E/NS1 proteins of 32 samples were determined that Indian and Asia West genotypes for the DENV-3 and DENV-2 respectively. The relationship between this DENV-2 genotype and FHD found in all America Continent was not present in Bahia state. In other hand, of the DENV-3 samples studied were clustered with isolates from different years with high bootstrap values (higher than 70%), Additionally, samples from different places in Brazil and South America were closely related, confirming that this strain have a very high epidemic power causing outbreaks since of its introduction. Finally, was applied a strategy to study the genetic structure of Abstract Aedes aegypti in Salvador applying microsatellite markers. After test markers previously published which failed in our hands, new markers were tested and developed and samples of Aedes aegypti were collected around the All Saints Bay. Three regions were defined as North, Central and South of Salvador, and the hypothesis of geographic isolation was tested based in the Fst values. These values were determined between North-Central 0.0073; South-North 0.018, and Central-South 0.0011, respectively. The results indicate that obstacles further distance could be present in Salvador showed by the Fst values. The potential of these new microsatellite markers to be applied as a molecular entomological tool in population genetic studies of Aedes aegypti in urban landscape like Salvador in future studies.FIOCRUZ, CNPq e a FAPESB.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.porCentro de Pesquisas Gonçalo MonizDengueEpidemiologia MolecularFilogeniaVirus da DengueDengueMolecular EpidemiologyPhylogenyDengue virusAspectos epidemiológicos e moleculares da transmissão da dengue no estado da Bahiainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2009Coordenação de EnsinoUniversidade Federal da Bahia. Centro de Pesquisas Goncalo MonizMestrado AcadêmicoSalvador/BAPós-Graduação em Patologiainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34879/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALPaulo Roberto Santana de Melo Aspectos...2009.pdfPaulo Roberto Santana de Melo Aspectos...2009.pdfapplication/pdf47870568https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34879/2/Paulo%20Roberto%20Santana%20de%20Melo%20Aspectos...2009.pdfe7134f39fffa8a8b2931b5f8fe897d36MD52TEXTPaulo Roberto Santana de Melo Aspectos...2009.pdf.txtPaulo Roberto Santana de Melo Aspectos...2009.pdf.txtExtracted texttext/plain215372https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34879/3/Paulo%20Roberto%20Santana%20de%20Melo%20Aspectos...2009.pdf.txtc898a58692c825a6441e44c762a04c5fMD53icict/348792019-08-22 00:11:15.08oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-08-22T03:11:15Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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