Desenvolvimento de sistema de gestão integrada de biotérios apoiado por inteligência artificial

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: Castro, Igor Machado de
Orientador(a): Silva, Klena Sarges Marruaz da
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/61667
Resumo: O desenvolvimento e manutenção de colônias de reprodução de camundongos tem sido parte integrante da pesquisa biomédica por quase um século. A gestão de biotérios, na atualidade, necessita de ferramentas tecnológicas que auxiliem na administração das colônias, com o objetivo de reduzir ou evitar desperdício de animais e de recursos financeiros, além de garantir a produção eficiente de animais com o estado sanitário desejável para utilização em pesquisas biomédicas. Há um crescente uso de modelos computacionais e software livre para aplicação do Princípio dos 3Rs (Replacement, Reduction, Refinement). Sistemas computacionais com auxílio de inteligência artificial podem ajudar na aplicação do Princípio dos 3Rs, ao permitir a redução de animais criados e, ao mesmo tempo, auxiliar no planejamento e logística da criação de animais utilizados em pesquisa, aplicando assim também o refinamento. Embora existam sistemas para gestão de biotérios disponíveis no mercado, estes possuem como desvantagens a cobrança de assinatura a custos elevados para a realidade dos biotérios públicos nacionais, serem sistemas proprietários e de código-fonte fechado, o que inviabiliza customizações para se adaptarem à realidade de cada biotério. O projeto aqui apresentado propõe o desenvolvimento de um software de gestão de biotérios de uso livre, de código-fonte aberto, com aplicação de ferramentas analíticas e preditivas a fim de auxiliar a gestão e a área operacional na criação e fornecimento de animais do Instituto de Ciência e Tecnologia em Biomodelos (ICTB) da Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz) aos pesquisadores e responsáveis técnicos dos demais laboratórios experimentais da instituição, a fim de informatizar os processos de trabalho, planejar os custos, otimizar o cálculo da produção e disponibilizar relatórios gerenciais. Como resultados, foram identificadas necessidades como a previsão da demanda de animais para produção/fornecimento e a medição do nível de risco de descarte animal, disponíveis na versão do protótipo desenvolvido
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Há um crescente uso de modelos computacionais e software livre para aplicação do Princípio dos 3Rs (Replacement, Reduction, Refinement). Sistemas computacionais com auxílio de inteligência artificial podem ajudar na aplicação do Princípio dos 3Rs, ao permitir a redução de animais criados e, ao mesmo tempo, auxiliar no planejamento e logística da criação de animais utilizados em pesquisa, aplicando assim também o refinamento. Embora existam sistemas para gestão de biotérios disponíveis no mercado, estes possuem como desvantagens a cobrança de assinatura a custos elevados para a realidade dos biotérios públicos nacionais, serem sistemas proprietários e de código-fonte fechado, o que inviabiliza customizações para se adaptarem à realidade de cada biotério. O projeto aqui apresentado propõe o desenvolvimento de um software de gestão de biotérios de uso livre, de código-fonte aberto, com aplicação de ferramentas analíticas e preditivas a fim de auxiliar a gestão e a área operacional na criação e fornecimento de animais do Instituto de Ciência e Tecnologia em Biomodelos (ICTB) da Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz) aos pesquisadores e responsáveis técnicos dos demais laboratórios experimentais da instituição, a fim de informatizar os processos de trabalho, planejar os custos, otimizar o cálculo da produção e disponibilizar relatórios gerenciais. Como resultados, foram identificadas necessidades como a previsão da demanda de animais para produção/fornecimento e a medição do nível de risco de descarte animal, disponíveis na versão do protótipo desenvolvidoThe development and maintenance of mouse breeding colonies has been an integral part of biomedical research for nearly a century. The management of a vivarium today requires technological tools that support the administration of the colonies, aiming to avoid waste of financial resources and animals, in addition to guaranteeing the efficient production of animals with the correct genotype and desirable health status for use in biomedical research. . There is a growing use of computational models and software to apply the 3Rs Principle. Computer systems with the aid of artificial intelligence can help in the application of the Principle of the 3Rs, by allowing the reduction of animals raised and, at the same time, assisting in the planning and logistics of raising animals used in research, thus also applying refinement. Although there are systems for the management of vivariums available on the market, these have the disadvantages of charging a subscription at high costs for the reality of national public vivariums, being proprietary and closed-source systems, which makes customizations to adapt to the reality of each vivarium. The project presented here proposes the development of software for the management of vivariums for free use, with open source code, with the application of analytical and predictive tools in order to assist the management and operational area in the creation and supply of animals at the Instituto de Ciência and Technology in Biomodels (ICTB) of the Oswaldo Cruz Foundation (Fiocruz) to the researchers and technicians in charge of the institution's other experimental laboratories, in order to computerize work processes, cost planning, production calculation and management reports. As preliminary results, some needs of the ICTB production vivarium have already been identified, such as forecasting the demand for animals for production and supply, as well as measuring the level of animal disposal, which will receive specific functionalities in the software, already developed and available in the version of the developed prototypeFundação Oswaldo Cruz. Instituto de Ciência e Tecnologia em Biomodelos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porGestão de BiotériosSoftware LivreInteligência ArtificialMachine LearningBiotériosOrganização e AdministraçãoAnimais de LaboratórioSoftwareInteligência ArtificialAprendizado de MáquinaMachine LearningDesenvolvimento de sistema de gestão integrada de biotérios apoiado por inteligência artificialinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2023Instituto de Ciência e Tecnologia em BiomodelosFundação Oswaldo CruzMestrado ProfissionalRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Ciência em Animais de Laboratórioinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/8ff7823c-e011-40d7-987d-cc80dfaf3002/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADORIGINALigor_castro_ictb_mest_2023.pdfapplication/pdf3401997https://arca.fiocruz.br/bitstreams/dd4952e6-2d6a-44c5-a617-1292112767e7/download47092f6ec15e3f0d67ecb2d563f28d3bMD52trueAnonymousREADTEXTigor_castro_ictb_mest_2023.pdf.txtigor_castro_ictb_mest_2023.pdf.txtExtracted texttext/plain103042https://arca.fiocruz.br/bitstreams/839c613a-0b25-4364-95ba-7328942a48c5/download0a41b3b428594e2fe6d9c9c3bcdc9d51MD57falseAnonymousREADTHUMBNAILigor_castro_ictb_mest_2023.pdf.jpgigor_castro_ictb_mest_2023.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg17909https://arca.fiocruz.br/bitstreams/02a7d4e7-0276-4f0d-a337-7f18d3191719/download27ab202fa3de15f080e46a7c6c426b28MD58falseAnonymousREADicict/616672025-12-11 08:46:19.438open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/61667https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:46:19Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)falseTk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=
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