Ensaio de PCR multiplex para detecção de Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum e Neisseria gonorrhoeae em amostras vaginais auto coletadas de mulheres ribeirinhas no município de COARI/AM

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Mendes, Cleiton de Souza
Outros Autores: https://lattes.cnpq.br/2157220487242385
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/9786
Resumo: As Infecções Sexualmente Transmissíveis (IST) configuram-se como um importante problema de Saúde Pública, pois se não diagnosticadas e tratadas corretamente podem resultar em severas complicações, tais como câncer de colo de útero, gravidez ectópica, abortos espontâneos, infertilidade, parto prematuro, dentre outros. Estima-se que a cada dia no mundo todo, um milhão de pessoas são infectadas com algum tipo de IST e 357 milhões de pessoas a cada ano. Para a identificação dessas infecções os testes moleculares têm se mostrado uma boa alternativa, pois apresentam alta sensibilidade e especificidade em relação aos demais testes. Este estudo tem como finalidade desenvolver um ensaio de PCR Multiplex para pesquisar a presença de Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum e Neisseria gonorrhoeae em amostras cervico-vaginais obtidas por autocoleta de mulheres ribeirinhas do município de Coari, no Amazonas, e correlacionar os índices de prevalência com características sociodemográficas, clínicas e comportamentais. A autocoleta vaginal foi realizada com o auxílio da escova COARI®, da Kolplast®. A extração de DNA foi realizada com kit ReliaPrep™ (Promega®) e à amplificação DNA genômico humano com os primers PCO3/PCO4. Para a detecção dos três patógenos foi desenvolvido um sistema de PCR multiplex usando primers específicos para cada patógeno. Os dados epidemiológicos, clínicos e comportamentais de risco para essas infecções foram analisados no programa SPSS. Foram autocoletadas 420 amostras vaginais, em 78 comunidades da zona rural do município de Coari. Nossos resultados mostraram que a idade das mulheres amostradas variou de 18 a 70, sendo a maioria (85,3%) casadas ou vivendo em união estável. Os resultados moleculares apresentaram 100% de positividade para DNA genômico humano; a mPCR detectou a presença do DNA de T. vaginalis em 1,9% das mulheres amostradas. Essas, apresentavam média de idade de 27,7 (DP= 6,4) e baixo nível educacional. A presença de DNA de T. pallidum e N. gonorrhoeae não foi detectado em nenhuma das amostras analisadas.
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spelling Ensaio de PCR multiplex para detecção de Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum e Neisseria gonorrhoeae em amostras vaginais auto coletadas de mulheres ribeirinhas no município de COARI/AMBiologia molecularDoenças sexualmente transmissíveis - DetecçãoCIENCIAS BIOLOGICASInfecções sexualmente transmissíveisDiagnóstico molecularCoariAmazonasPCR multiplexAs Infecções Sexualmente Transmissíveis (IST) configuram-se como um importante problema de Saúde Pública, pois se não diagnosticadas e tratadas corretamente podem resultar em severas complicações, tais como câncer de colo de útero, gravidez ectópica, abortos espontâneos, infertilidade, parto prematuro, dentre outros. Estima-se que a cada dia no mundo todo, um milhão de pessoas são infectadas com algum tipo de IST e 357 milhões de pessoas a cada ano. Para a identificação dessas infecções os testes moleculares têm se mostrado uma boa alternativa, pois apresentam alta sensibilidade e especificidade em relação aos demais testes. Este estudo tem como finalidade desenvolver um ensaio de PCR Multiplex para pesquisar a presença de Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum e Neisseria gonorrhoeae em amostras cervico-vaginais obtidas por autocoleta de mulheres ribeirinhas do município de Coari, no Amazonas, e correlacionar os índices de prevalência com características sociodemográficas, clínicas e comportamentais. A autocoleta vaginal foi realizada com o auxílio da escova COARI®, da Kolplast®. A extração de DNA foi realizada com kit ReliaPrep™ (Promega®) e à amplificação DNA genômico humano com os primers PCO3/PCO4. Para a detecção dos três patógenos foi desenvolvido um sistema de PCR multiplex usando primers específicos para cada patógeno. Os dados epidemiológicos, clínicos e comportamentais de risco para essas infecções foram analisados no programa SPSS. Foram autocoletadas 420 amostras vaginais, em 78 comunidades da zona rural do município de Coari. Nossos resultados mostraram que a idade das mulheres amostradas variou de 18 a 70, sendo a maioria (85,3%) casadas ou vivendo em união estável. Os resultados moleculares apresentaram 100% de positividade para DNA genômico humano; a mPCR detectou a presença do DNA de T. vaginalis em 1,9% das mulheres amostradas. Essas, apresentavam média de idade de 27,7 (DP= 6,4) e baixo nível educacional. A presença de DNA de T. pallidum e N. gonorrhoeae não foi detectado em nenhuma das amostras analisadas.Sexually Transmitted Infections (STIs) are an important public health problem, because if not properly diagnosed and treated, they can result in severe complications, such as cervical cancer, ectopic pregnancy, spontaneous abortions, infertility, premature birth, among others. It is estimated that every day worldwide, one million people are infected with some type of STI and 357 million people each year. For the identification of these infections, molecular tests have shown to be a good alternative, as they present high sensitivity and specificity in relation to other tests. This study aims to develop a Multiplex PCR assay to search for the presence of Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum and Neisseria gonorrhoeae in cervico-vaginal samples obtained by self-collection from riverside women in the municipality of Coari in Amazonas and to correlate the prevalence rates with sociodemographic characteristics, clinical and behavioral. The vaginal self-collection was performed with the aid of the KARPLAST® COARI® brush. DNA extraction was performed with QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN) and human genomic DNA amplification with PCO4 / GH20 primers. For the detection of the three pathogens, a multiplex PCR system was developed using specific primers for each pathogen. Epidemiological, clinical and behavioral data at risk for these infections were analyzed in the SPSS program. 420 vaginal samples were self-collected from 78 rural communities in the municipality of Coari. Our results showed that the age of the women sampled ranged from 18 to 70, with the majority (85.3%) being married or living in a stable relationship. The molecular results showed 100% positivity for human genomic DNA; mPCR detected the presence of T. vaginalis DNA in 1.9% of the women sampled. These had a mean age of 27.7 (SD = 6.4) and a low educational level. The presence of T. pallidum and N. gonorrhoeae DNA was not detected in any of the analyzed samples.FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasUniversidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBrasilUFAMPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaOliveira, Cintia Mara Costa dehttp://lattes.cnpq.br/8188087361251251Souza, Antonia Queiroz Lima deSadahiro, AyaMendes, Cleiton de Souzahttps://lattes.cnpq.br/21572204872423852023-11-02T00:59:37Z2020-02-18info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfMENDES, Cleiton de Souza. Ensaio de PCR multiplex para detecção de Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum e Neisseria gonorrhoeae em amostras vaginais auto coletadas de mulheres ribeirinhas no município de COARI/AM. 2020. 111 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus (AM), 2020.https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/9786porhttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2023-11-02T05:03:42Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/9786Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922023-11-02T05:03:42Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
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