Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2012
Autor(a) principal: Coutinho, Tarcisio José Domingos
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal da Paraí­ba
Brasil
Biologia Celular e Molecular
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
UFPB
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654
Resumo: Substrate-binding subunits are very important components of the solute importation system, known as the osmoprotectant system, which consists of a membrane protein belonging to the ABC superfamily. These molecules recognize specific substrates that have different physiological roles in prokaryotes, i.e. roles that contribute to the survival of these organisms in environments with high concentrations of salt. Using MEGA 5.05 software, this study performed a phylogenetic analysis of 431 nucleotide sequences of these subunits, orthologous to each other, collected from the database contained on the website http://www.genome.jp/kegg/. As a result of this analysis, phylogenetic trees were generated that clearly demonstrated that there was a horizontal transfer of some genes due to the sharing by different organisms. Also, two probable ancestral sequences were generated that showed homology with permeases that transport choline, glycine betaine and carnitine, which are trimethylamines currently present in various prokaryotes. Therefore, this system probably arose in prokaryotic organisms with the basic function of capturing nutrients, and by performing this basal function of being shared with other organisms, was fixed to the genome. However, because of the diversification of habitats by the prokaryotes, this system contributed decisively to the adaptation of these organisms to different environments, especially environments that had a high salt concentration; thus, acting and being currently characterized as a system of osmoprotection.
id UFPB_80e7beb2abd028c20a39a38dbc5f6567
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpb.br:tede/3654
network_acronym_str UFPB
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
repository_id_str
spelling Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotosTransporteAnálise filogenéticaGlicina betaínaOsmoadaptaçãoTransportPhylogenetic analysisGlycine betaineOsmoadaptationCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALSubstrate-binding subunits are very important components of the solute importation system, known as the osmoprotectant system, which consists of a membrane protein belonging to the ABC superfamily. These molecules recognize specific substrates that have different physiological roles in prokaryotes, i.e. roles that contribute to the survival of these organisms in environments with high concentrations of salt. Using MEGA 5.05 software, this study performed a phylogenetic analysis of 431 nucleotide sequences of these subunits, orthologous to each other, collected from the database contained on the website http://www.genome.jp/kegg/. As a result of this analysis, phylogenetic trees were generated that clearly demonstrated that there was a horizontal transfer of some genes due to the sharing by different organisms. Also, two probable ancestral sequences were generated that showed homology with permeases that transport choline, glycine betaine and carnitine, which are trimethylamines currently present in various prokaryotes. Therefore, this system probably arose in prokaryotic organisms with the basic function of capturing nutrients, and by performing this basal function of being shared with other organisms, was fixed to the genome. However, because of the diversification of habitats by the prokaryotes, this system contributed decisively to the adaptation of these organisms to different environments, especially environments that had a high salt concentration; thus, acting and being currently characterized as a system of osmoprotection.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESAs subunidades ligadoras de substrato são componentes muito importantes do sistema de importação de soluto conhecido, como sistema de osmoproteção, que consiste em uma proteína de membrana pertencente à superfamlía ABC. Estas moléculas reconhecem substratos específicos que apresentam papéis fisiológicos diversos em procariotos, incluindo a colaboração para a sobrevivência destes organismos em ambientes com elevada concentração de sal. Utilizando o software MEGA 5.05, foi realizada uma análise filogenética de 431 sequências nucleotídicas destas subunidades, ortólogas entre si, coletadas a partir do banco de dados contido no site ttp://www.genome.jp/kegg/. Como resultado desta análise, foram geradas árvores filogenéticas que demonstraram claramente que houve a transferência horizontal de alguns dos genes devido ao ompartilhamento por organismos diferentes. Foram geradas também duas prováveis sequências ancestrais que apresentam homologia com permeases que transportam colina, glicina betaína e carnitina, que são aminas trimetiladas, presentes atualmente em diversos procariotos. Portanto, este sistema provavelmente surgiu em organismos procarióticos com a função básica de captura de nutrientes e por desempenhar esta função basal, ao ser compartilhado com outros organismos, foi fixado aos genomas. No entanto, a partir da diversificação de habitats, por parte dos procariotos, este sistema colaborou de forma decisiva para a adaptação destes organismos aos mais diversos ambientes, incluindo, especialmente os ambientes que apresentavam uma elevada concentração de sal, atuando e sendo caracterizado atualmente como um sistema de osmoproteção.Universidade Federal da Paraí­baBrasilBiologia Celular e MolecularPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularUFPBFarias, Sávio Torres dehttp://lattes.cnpq.br/6717736083103462Coutinho, Tarcisio José Domingos2015-04-01T14:16:04Z2018-07-20T23:35:53Z2014-05-292018-07-20T23:35:53Z2012-12-13info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfCOUTINHO, Tarcisio José Domingos. Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos. 2012. 79 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraí­ba, João Pessoa, 2012.https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPBinstname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB)instacron:UFPB2018-09-05T23:11:25Zoai:repositorio.ufpb.br:tede/3654Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://repositorio.ufpb.br/PUBhttp://tede.biblioteca.ufpb.br:8080/oai/requestdiretoria@ufpb.br|| bdtd@biblioteca.ufpb.bropendoar:2018-09-05T23:11:25Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
title Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
spellingShingle Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
Coutinho, Tarcisio José Domingos
Transporte
Análise filogenética
Glicina betaína
Osmoadaptação
Transport
Phylogenetic analysis
Glycine betaine
Osmoadaptation
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
title_short Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
title_full Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
title_fullStr Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
title_full_unstemmed Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
title_sort Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
author Coutinho, Tarcisio José Domingos
author_facet Coutinho, Tarcisio José Domingos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Farias, Sávio Torres de
http://lattes.cnpq.br/6717736083103462
dc.contributor.author.fl_str_mv Coutinho, Tarcisio José Domingos
dc.subject.por.fl_str_mv Transporte
Análise filogenética
Glicina betaína
Osmoadaptação
Transport
Phylogenetic analysis
Glycine betaine
Osmoadaptation
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
topic Transporte
Análise filogenética
Glicina betaína
Osmoadaptação
Transport
Phylogenetic analysis
Glycine betaine
Osmoadaptation
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
description Substrate-binding subunits are very important components of the solute importation system, known as the osmoprotectant system, which consists of a membrane protein belonging to the ABC superfamily. These molecules recognize specific substrates that have different physiological roles in prokaryotes, i.e. roles that contribute to the survival of these organisms in environments with high concentrations of salt. Using MEGA 5.05 software, this study performed a phylogenetic analysis of 431 nucleotide sequences of these subunits, orthologous to each other, collected from the database contained on the website http://www.genome.jp/kegg/. As a result of this analysis, phylogenetic trees were generated that clearly demonstrated that there was a horizontal transfer of some genes due to the sharing by different organisms. Also, two probable ancestral sequences were generated that showed homology with permeases that transport choline, glycine betaine and carnitine, which are trimethylamines currently present in various prokaryotes. Therefore, this system probably arose in prokaryotic organisms with the basic function of capturing nutrients, and by performing this basal function of being shared with other organisms, was fixed to the genome. However, because of the diversification of habitats by the prokaryotes, this system contributed decisively to the adaptation of these organisms to different environments, especially environments that had a high salt concentration; thus, acting and being currently characterized as a system of osmoprotection.
publishDate 2012
dc.date.none.fl_str_mv 2012-12-13
2014-05-29
2015-04-01T14:16:04Z
2018-07-20T23:35:53Z
2018-07-20T23:35:53Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv COUTINHO, Tarcisio José Domingos. Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos. 2012. 79 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraí­ba, João Pessoa, 2012.
https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654
identifier_str_mv COUTINHO, Tarcisio José Domingos. Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos. 2012. 79 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraí­ba, João Pessoa, 2012.
url https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal da Paraí­ba
Brasil
Biologia Celular e Molecular
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
UFPB
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal da Paraí­ba
Brasil
Biologia Celular e Molecular
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
UFPB
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
instname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
instacron:UFPB
instname_str Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
instacron_str UFPB
institution UFPB
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
repository.mail.fl_str_mv diretoria@ufpb.br|| bdtd@biblioteca.ufpb.br
_version_ 1831315239843397632