Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos
| Ano de defesa: | 2012 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal da Paraíba
Brasil Biologia Celular e Molecular Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular UFPB |
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654 |
Resumo: | Substrate-binding subunits are very important components of the solute importation system, known as the osmoprotectant system, which consists of a membrane protein belonging to the ABC superfamily. These molecules recognize specific substrates that have different physiological roles in prokaryotes, i.e. roles that contribute to the survival of these organisms in environments with high concentrations of salt. Using MEGA 5.05 software, this study performed a phylogenetic analysis of 431 nucleotide sequences of these subunits, orthologous to each other, collected from the database contained on the website http://www.genome.jp/kegg/. As a result of this analysis, phylogenetic trees were generated that clearly demonstrated that there was a horizontal transfer of some genes due to the sharing by different organisms. Also, two probable ancestral sequences were generated that showed homology with permeases that transport choline, glycine betaine and carnitine, which are trimethylamines currently present in various prokaryotes. Therefore, this system probably arose in prokaryotic organisms with the basic function of capturing nutrients, and by performing this basal function of being shared with other organisms, was fixed to the genome. However, because of the diversification of habitats by the prokaryotes, this system contributed decisively to the adaptation of these organisms to different environments, especially environments that had a high salt concentration; thus, acting and being currently characterized as a system of osmoprotection. |
| id |
UFPB_80e7beb2abd028c20a39a38dbc5f6567 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufpb.br:tede/3654 |
| network_acronym_str |
UFPB |
| network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotosTransporteAnálise filogenéticaGlicina betaínaOsmoadaptaçãoTransportPhylogenetic analysisGlycine betaineOsmoadaptationCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALSubstrate-binding subunits are very important components of the solute importation system, known as the osmoprotectant system, which consists of a membrane protein belonging to the ABC superfamily. These molecules recognize specific substrates that have different physiological roles in prokaryotes, i.e. roles that contribute to the survival of these organisms in environments with high concentrations of salt. Using MEGA 5.05 software, this study performed a phylogenetic analysis of 431 nucleotide sequences of these subunits, orthologous to each other, collected from the database contained on the website http://www.genome.jp/kegg/. As a result of this analysis, phylogenetic trees were generated that clearly demonstrated that there was a horizontal transfer of some genes due to the sharing by different organisms. Also, two probable ancestral sequences were generated that showed homology with permeases that transport choline, glycine betaine and carnitine, which are trimethylamines currently present in various prokaryotes. Therefore, this system probably arose in prokaryotic organisms with the basic function of capturing nutrients, and by performing this basal function of being shared with other organisms, was fixed to the genome. However, because of the diversification of habitats by the prokaryotes, this system contributed decisively to the adaptation of these organisms to different environments, especially environments that had a high salt concentration; thus, acting and being currently characterized as a system of osmoprotection.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESAs subunidades ligadoras de substrato são componentes muito importantes do sistema de importação de soluto conhecido, como sistema de osmoproteção, que consiste em uma proteína de membrana pertencente à superfamlía ABC. Estas moléculas reconhecem substratos específicos que apresentam papéis fisiológicos diversos em procariotos, incluindo a colaboração para a sobrevivência destes organismos em ambientes com elevada concentração de sal. Utilizando o software MEGA 5.05, foi realizada uma análise filogenética de 431 sequências nucleotídicas destas subunidades, ortólogas entre si, coletadas a partir do banco de dados contido no site ttp://www.genome.jp/kegg/. Como resultado desta análise, foram geradas árvores filogenéticas que demonstraram claramente que houve a transferência horizontal de alguns dos genes devido ao ompartilhamento por organismos diferentes. Foram geradas também duas prováveis sequências ancestrais que apresentam homologia com permeases que transportam colina, glicina betaína e carnitina, que são aminas trimetiladas, presentes atualmente em diversos procariotos. Portanto, este sistema provavelmente surgiu em organismos procarióticos com a função básica de captura de nutrientes e por desempenhar esta função basal, ao ser compartilhado com outros organismos, foi fixado aos genomas. No entanto, a partir da diversificação de habitats, por parte dos procariotos, este sistema colaborou de forma decisiva para a adaptação destes organismos aos mais diversos ambientes, incluindo, especialmente os ambientes que apresentavam uma elevada concentração de sal, atuando e sendo caracterizado atualmente como um sistema de osmoproteção.Universidade Federal da ParaíbaBrasilBiologia Celular e MolecularPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularUFPBFarias, Sávio Torres dehttp://lattes.cnpq.br/6717736083103462Coutinho, Tarcisio José Domingos2015-04-01T14:16:04Z2018-07-20T23:35:53Z2014-05-292018-07-20T23:35:53Z2012-12-13info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfCOUTINHO, Tarcisio José Domingos. Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos. 2012. 79 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, 2012.https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPBinstname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB)instacron:UFPB2018-09-05T23:11:25Zoai:repositorio.ufpb.br:tede/3654Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://repositorio.ufpb.br/PUBhttp://tede.biblioteca.ufpb.br:8080/oai/requestdiretoria@ufpb.br|| bdtd@biblioteca.ufpb.bropendoar:2018-09-05T23:11:25Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos |
| title |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos |
| spellingShingle |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos Coutinho, Tarcisio José Domingos Transporte Análise filogenética Glicina betaína Osmoadaptação Transport Phylogenetic analysis Glycine betaine Osmoadaptation CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
| title_short |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos |
| title_full |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos |
| title_fullStr |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos |
| title_full_unstemmed |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos |
| title_sort |
Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos |
| author |
Coutinho, Tarcisio José Domingos |
| author_facet |
Coutinho, Tarcisio José Domingos |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Farias, Sávio Torres de http://lattes.cnpq.br/6717736083103462 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Coutinho, Tarcisio José Domingos |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Transporte Análise filogenética Glicina betaína Osmoadaptação Transport Phylogenetic analysis Glycine betaine Osmoadaptation CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
| topic |
Transporte Análise filogenética Glicina betaína Osmoadaptação Transport Phylogenetic analysis Glycine betaine Osmoadaptation CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
| description |
Substrate-binding subunits are very important components of the solute importation system, known as the osmoprotectant system, which consists of a membrane protein belonging to the ABC superfamily. These molecules recognize specific substrates that have different physiological roles in prokaryotes, i.e. roles that contribute to the survival of these organisms in environments with high concentrations of salt. Using MEGA 5.05 software, this study performed a phylogenetic analysis of 431 nucleotide sequences of these subunits, orthologous to each other, collected from the database contained on the website http://www.genome.jp/kegg/. As a result of this analysis, phylogenetic trees were generated that clearly demonstrated that there was a horizontal transfer of some genes due to the sharing by different organisms. Also, two probable ancestral sequences were generated that showed homology with permeases that transport choline, glycine betaine and carnitine, which are trimethylamines currently present in various prokaryotes. Therefore, this system probably arose in prokaryotic organisms with the basic function of capturing nutrients, and by performing this basal function of being shared with other organisms, was fixed to the genome. However, because of the diversification of habitats by the prokaryotes, this system contributed decisively to the adaptation of these organisms to different environments, especially environments that had a high salt concentration; thus, acting and being currently characterized as a system of osmoprotection. |
| publishDate |
2012 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2012-12-13 2014-05-29 2015-04-01T14:16:04Z 2018-07-20T23:35:53Z 2018-07-20T23:35:53Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
COUTINHO, Tarcisio José Domingos. Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos. 2012. 79 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, 2012. https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654 |
| identifier_str_mv |
COUTINHO, Tarcisio José Domingos. Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos. 2012. 79 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, 2012. |
| url |
https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/tede/3654 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Paraíba Brasil Biologia Celular e Molecular Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular UFPB |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Paraíba Brasil Biologia Celular e Molecular Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular UFPB |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB instname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB) instacron:UFPB |
| instname_str |
Universidade Federal da Paraíba (UFPB) |
| instacron_str |
UFPB |
| institution |
UFPB |
| reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB |
| collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB) |
| repository.mail.fl_str_mv |
diretoria@ufpb.br|| bdtd@biblioteca.ufpb.br |
| _version_ |
1831315239843397632 |