Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2023
Autor(a) principal: ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Pernambuco
UFPE
Brasil
Programa de Pos Graduacao em Ciencia da Computacao
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/52277
Resumo: Riscos relacionados a exposição excessiva de pacientes à radiação durante a aquisição de to- mografias computadorizadas são motivo de preocupação crescente na comunidade médica. Tomografias obtidas com menores quantidade de radiação ou redução de projeções poderiam aliviar o problema, mas resultam em artefatos, ruídos e distorções na imagem reconstruída. Sendo assim, diversos métodos baseados na aplicação de Redes Neurais Convolucionais (CNNs, do inglês Convolucional Neural Networks) para recuperação das tomografias obtidas com baixa dosagem (LDCTs, do inglês Low-dose Computed Tomography ), apresentaram bons resulta- dos. Métodos baseados em CNNs 3D obtiveram resultados ainda mais promissores, visto que exploram melhor as relações entre os pixeis das visões ortogonais dos volumes CT. CNNs 3D possuem, no entanto, um custo computacional maior associado. Além disso, são mais sensí- veis ao problema do desbalanceamento de classes, que consiste na aprendizagem enviesada em favor de uma classe de pixeis mais abundante. Ao mesmo tempo, métodos baseados em CNNs 2D não exploram tão bem as relações entre pixeis das visões ortogonais, visto que processam cada fatia do volume tomográfico separadamente, o que leva a uma demanda computacional menor. Neste trabalho, é apresentado um método que busca explorar as relações entre os pixeis dos eixos Axial, Coronal e Sagittal dos volumes LDCT utilizando-se de um ensemble de quatro CNNs 2D, onde, três delas processam os eixos ortogonais do volume LDCT de forma separada, e a quarta faz a fusão das saídas das três redes anteriores. Dessa forma, resultados tão bons quanto ou superiores aos oriundos do uso de CNNs 3D, podem ser obtidos sem os custos computacionais associados as mesmas. Para os experimentos, foram utilizados duas ba- ses de dados, uma simulando tomografias computadorizadas com projeções-esparsas, e a outra com dados reais de tomografias computadorizadas obtidas com redução direta de radiação. O método proposto apresentou resultados majoritariamente superiores aos modelos 2D e 3D.
id UFPE_c456f8ab2eff2480dfe0a090b000d887
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpe.br:123456789/52277
network_acronym_str UFPE
network_name_str Repositório Institucional da UFPE
repository_id_str
spelling Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiaçãoInteligência computacionalTomografias computadorizadasRedes Neurais ConvolucionaisRiscos relacionados a exposição excessiva de pacientes à radiação durante a aquisição de to- mografias computadorizadas são motivo de preocupação crescente na comunidade médica. Tomografias obtidas com menores quantidade de radiação ou redução de projeções poderiam aliviar o problema, mas resultam em artefatos, ruídos e distorções na imagem reconstruída. Sendo assim, diversos métodos baseados na aplicação de Redes Neurais Convolucionais (CNNs, do inglês Convolucional Neural Networks) para recuperação das tomografias obtidas com baixa dosagem (LDCTs, do inglês Low-dose Computed Tomography ), apresentaram bons resulta- dos. Métodos baseados em CNNs 3D obtiveram resultados ainda mais promissores, visto que exploram melhor as relações entre os pixeis das visões ortogonais dos volumes CT. CNNs 3D possuem, no entanto, um custo computacional maior associado. Além disso, são mais sensí- veis ao problema do desbalanceamento de classes, que consiste na aprendizagem enviesada em favor de uma classe de pixeis mais abundante. Ao mesmo tempo, métodos baseados em CNNs 2D não exploram tão bem as relações entre pixeis das visões ortogonais, visto que processam cada fatia do volume tomográfico separadamente, o que leva a uma demanda computacional menor. Neste trabalho, é apresentado um método que busca explorar as relações entre os pixeis dos eixos Axial, Coronal e Sagittal dos volumes LDCT utilizando-se de um ensemble de quatro CNNs 2D, onde, três delas processam os eixos ortogonais do volume LDCT de forma separada, e a quarta faz a fusão das saídas das três redes anteriores. Dessa forma, resultados tão bons quanto ou superiores aos oriundos do uso de CNNs 3D, podem ser obtidos sem os custos computacionais associados as mesmas. Para os experimentos, foram utilizados duas ba- ses de dados, uma simulando tomografias computadorizadas com projeções-esparsas, e a outra com dados reais de tomografias computadorizadas obtidas com redução direta de radiação. O método proposto apresentou resultados majoritariamente superiores aos modelos 2D e 3D.FACEPERisks related to the excessive exposure of patients to radiation during the acquisition of com- puterized tomography’s (CT) are a growing concern over the medical community. CT scans obtained with radiation levels reduced or sparse projections may relief the problem, but re- sults in noisier volumes. Several methods based on the use of Convolutional Neural Networks (CNNs) for low-dose CT scans recovery (LDCTs, Low-dose Computed Tomography ), have shown good results. Methods based on 3D CNNs resulted in even more promising outputs, since they better explore the intra-voxial relationships between the orthogonal CT volumes views. 3D CNNs, however, have a higher computational cost associated with them, along with being more sensitive to the class imbalance problem, which consists in a biased learning in favor of a more abundant pixel class, while 2D CNNs based methods, are unable to explore the intra-voxial relationships on the orthoghonal axis efficiently, sice each slice from the CT volume are processed separately, which lead to a lower computational demand. In this work, a method is presented that seeks to explore the intra-voxial relationships of the Axial, Coronal and Sagittal axes of the LDCT volumes using an ensemble of four 2D CNNs, where three of them process the orthogonal axes of the LDCT volume separately, and the fourth merges the outputs of the previous three networks. In this way, results that are as good or superior to those referring to the use of 3D CNNs, can be obtained without the computational costs associated with them. For the experiments, two datasets were used, one simulating computed tomography scans with sparse-projection and the other, with real data from computed tomog- raphy scans obtained with direct radiation reduction. The proposed method showed results that were mostly superior to the 2D and 3D models.Universidade Federal de PernambucoUFPEBrasilPrograma de Pos Graduacao em Ciencia da ComputacaoREN, Tsang IngPEREIRA, Luis Filipe Alveshttp://lattes.cnpq.br/7424794943228328http://lattes.cnpq.br/3084134533707587http://lattes.cnpq.br/7320714889983490ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio2023-09-15T14:08:15Z2023-09-15T14:08:15Z2023-08-09info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfALVES JÚNIOR, Carlos Antônio. Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação. 2023. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) – Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2023.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/52277porAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPE2023-09-16T05:17:51Zoai:repositorio.ufpe.br:123456789/52277Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212023-09-16T05:17:51Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
dc.title.none.fl_str_mv Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
title Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
spellingShingle Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio
Inteligência computacional
Tomografias computadorizadas
Redes Neurais Convolucionais
title_short Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
title_full Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
title_fullStr Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
title_full_unstemmed Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
title_sort Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação
author ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio
author_facet ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv REN, Tsang Ing
PEREIRA, Luis Filipe Alves
http://lattes.cnpq.br/7424794943228328
http://lattes.cnpq.br/3084134533707587
http://lattes.cnpq.br/7320714889983490
dc.contributor.author.fl_str_mv ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio
dc.subject.por.fl_str_mv Inteligência computacional
Tomografias computadorizadas
Redes Neurais Convolucionais
topic Inteligência computacional
Tomografias computadorizadas
Redes Neurais Convolucionais
description Riscos relacionados a exposição excessiva de pacientes à radiação durante a aquisição de to- mografias computadorizadas são motivo de preocupação crescente na comunidade médica. Tomografias obtidas com menores quantidade de radiação ou redução de projeções poderiam aliviar o problema, mas resultam em artefatos, ruídos e distorções na imagem reconstruída. Sendo assim, diversos métodos baseados na aplicação de Redes Neurais Convolucionais (CNNs, do inglês Convolucional Neural Networks) para recuperação das tomografias obtidas com baixa dosagem (LDCTs, do inglês Low-dose Computed Tomography ), apresentaram bons resulta- dos. Métodos baseados em CNNs 3D obtiveram resultados ainda mais promissores, visto que exploram melhor as relações entre os pixeis das visões ortogonais dos volumes CT. CNNs 3D possuem, no entanto, um custo computacional maior associado. Além disso, são mais sensí- veis ao problema do desbalanceamento de classes, que consiste na aprendizagem enviesada em favor de uma classe de pixeis mais abundante. Ao mesmo tempo, métodos baseados em CNNs 2D não exploram tão bem as relações entre pixeis das visões ortogonais, visto que processam cada fatia do volume tomográfico separadamente, o que leva a uma demanda computacional menor. Neste trabalho, é apresentado um método que busca explorar as relações entre os pixeis dos eixos Axial, Coronal e Sagittal dos volumes LDCT utilizando-se de um ensemble de quatro CNNs 2D, onde, três delas processam os eixos ortogonais do volume LDCT de forma separada, e a quarta faz a fusão das saídas das três redes anteriores. Dessa forma, resultados tão bons quanto ou superiores aos oriundos do uso de CNNs 3D, podem ser obtidos sem os custos computacionais associados as mesmas. Para os experimentos, foram utilizados duas ba- ses de dados, uma simulando tomografias computadorizadas com projeções-esparsas, e a outra com dados reais de tomografias computadorizadas obtidas com redução direta de radiação. O método proposto apresentou resultados majoritariamente superiores aos modelos 2D e 3D.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-09-15T14:08:15Z
2023-09-15T14:08:15Z
2023-08-09
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio. Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação. 2023. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) – Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2023.
https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/52277
identifier_str_mv ALVES JÚNIOR, Carlos Antônio. Combinação de redes neurais convolucionais para reconstrução de tomografias computadorizadas com baixas dosagens de radiação. 2023. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) – Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2023.
url https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/52277
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
UFPE
Brasil
Programa de Pos Graduacao em Ciencia da Computacao
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
UFPE
Brasil
Programa de Pos Graduacao em Ciencia da Computacao
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPE
instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron:UFPE
instname_str Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron_str UFPE
institution UFPE
reponame_str Repositório Institucional da UFPE
collection Repositório Institucional da UFPE
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
repository.mail.fl_str_mv attena@ufpe.br
_version_ 1856042054472171520