Seleção genômica em arroz irrigado para tolerância ao frio no Sul do Brasil
| Ano de defesa: | 2019 |
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| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Tese |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Pelotas
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| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Agronomia
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| Departamento: |
Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel
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| País: |
Brasil
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| Palavras-chave em Português: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/4959 |
Resumo: | O arroz é uma cultura de grande importância social e econômica e baixas temperaturas no desenvolvimento da cultura podem ser extremamente prejudiciais, principalmente no período reprodutivo causando aumento na esterilidade das espiguetas e consequente redução na produção de grãos. Esse trabalho tem como objetivo estimar a predição de valores genéticos para dados fenotípicos e genotípicos de uma população F6 de Linha Puras Recombinates (RILs) provenientes do cruzamento entre a cultivar sensível ao frio, BRS Atalanta e a cultivar tolerante ao frio, Nipponbare e verificar a eficiência da população e dos marcadores utilizados para seleção genômica para tolerância ao frio no Sul do Brasil. A população foi fenotipada para as características altura de planta, comprimento de panícula, número de espiguetas por panícula, porcentagem de esterilidade de espiguetas, grau de exerção da panícula e número de dias até 50% de floração. Foram estimados as variâncias e parâmetros genéticos para obtenção dos valores genéticos preditos para todas características em todas famílias da população. Foram realizadas análise de médias e agrupamento das famílias, possibilitando evidenciar a presença de variabilidade genética para as características de estudo, pela formação de distintos grupos entre as famílias e consequentemente para tolerância ao frio. Foi realizada a genotipagem por sequenciamento de 195 famílias e das cultivares BRS Atalanta e Nipponbare, totalizando 27430 marcadores SNPs identificados na população. As acurácias obtidas através dos valores genéticos preditos baseados nos marcadores confirmam a eficiência do uso dessa população e dos marcadores para seleção genômica para tolerância ao frio (acurácia de 0,80 para valores genéticos preditos para porcentagem de esterilidade de espiguetas). |
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2020-02-03T12:50:30Z2020-02-03T12:50:30Z2019-08-09AHLERT, Renata Juliana. Seleção genômica em arroz irrigado para tolerância ao frio no Sul do Brasil. 2019. 150p. Tese (Doutorado) – Programa de Pós-graduação em Agronomia. Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2019.http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/4959O arroz é uma cultura de grande importância social e econômica e baixas temperaturas no desenvolvimento da cultura podem ser extremamente prejudiciais, principalmente no período reprodutivo causando aumento na esterilidade das espiguetas e consequente redução na produção de grãos. Esse trabalho tem como objetivo estimar a predição de valores genéticos para dados fenotípicos e genotípicos de uma população F6 de Linha Puras Recombinates (RILs) provenientes do cruzamento entre a cultivar sensível ao frio, BRS Atalanta e a cultivar tolerante ao frio, Nipponbare e verificar a eficiência da população e dos marcadores utilizados para seleção genômica para tolerância ao frio no Sul do Brasil. A população foi fenotipada para as características altura de planta, comprimento de panícula, número de espiguetas por panícula, porcentagem de esterilidade de espiguetas, grau de exerção da panícula e número de dias até 50% de floração. Foram estimados as variâncias e parâmetros genéticos para obtenção dos valores genéticos preditos para todas características em todas famílias da população. Foram realizadas análise de médias e agrupamento das famílias, possibilitando evidenciar a presença de variabilidade genética para as características de estudo, pela formação de distintos grupos entre as famílias e consequentemente para tolerância ao frio. Foi realizada a genotipagem por sequenciamento de 195 famílias e das cultivares BRS Atalanta e Nipponbare, totalizando 27430 marcadores SNPs identificados na população. As acurácias obtidas através dos valores genéticos preditos baseados nos marcadores confirmam a eficiência do uso dessa população e dos marcadores para seleção genômica para tolerância ao frio (acurácia de 0,80 para valores genéticos preditos para porcentagem de esterilidade de espiguetas).Rice is a crop of great social and economic importance and low temperatures in crop development can be extremely harmful, especially in the reproductive period causing increased spikelet sterility and consequent reduction in grain yield. This work aimed to estimate the prediction of genetic values for phenotypic and genotypic data of an F6 population of Recombinant Inbreed Lines (RILs) from a cross between the cold sensitive cultivar, BRS Atalanta and the cold tolerant cultivar, Nipponbare, to verify the genomic selection efficiency from population and markers for cold tolerance in southern Brazil. Population was phenotyped for traits: plant height, panicle length, number of spikelets per panicle, percentage of spikelet sterility, degree of panicle exertion and number of days to 50% flowering. Variances and genetic parameters were estimated to obtain the predicted genetic values for all traits in all families of the population. Means analysis and family grouping were performed, making it possible to highlight the presence of genetic variability for the studied traits, by the formation of distinct groups between families and consequently, for cold tolerance. Genotyping by sequencing of 195 families and BRS Atalanta and Nipponbare cultivars was performed and 27430 SNPs markers were identified in the population. Accuracies obtained through the marker-based predicted genetic values confirm the efficiency to use this population and markers for genomic selection for cold tolerance (accuracy of 0.80 for predicted genetic values for spikelet sterility percentage).porUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIAOryza sativa LBaixas temperaturasHerdabilidadeBLUPLow temperaturesHeritabilitySeleção genômica em arroz irrigado para tolerância ao frio no Sul do BrasilGenomic selection in irrigated rice for cold tolerance in Southern Brazil.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://lattes.cnpq.br/4561548986098290CV: http://lattes.cnpq.br/2717555680999191Jackson, Scott AllenMagalhães Junior, Ariano Martins dehttp://lattes.cnpq.br/7042859921458132Oliveira, Antônio Costa deAhlert, Renata Julianainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTRenata_Ahlert.pdf.txtRenata_Ahlert.pdf.txtExtracted texttext/plain244373http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4959/6/Renata_Ahlert.pdf.txt7e3b6da7471cfa11e895926e38595922MD56open accessTHUMBNAILRenata_Ahlert.pdf.jpgRenata_Ahlert.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1325http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4959/7/Renata_Ahlert.pdf.jpgb7d7421a76f42540b59cba0325f1274fMD57open accessORIGINALRenata_Ahlert.pdfRenata_Ahlert.pdfapplication/pdf16961282http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4959/1/Renata_Ahlert.pdf13ed79e649f63a42dde485e797df8074MD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4959/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4959/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4959/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4959/5/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD55open accessprefix/49592023-07-17 23:15:07.396open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/4959VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-18T02:15:07Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
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