Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Souza, Dilair Camargo de
Orientador(a): Rosário Filho, Nelson Augusto, 1949-
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Staphylococcus aureus
Fibrose cistica
Timidina
Clínica Médica
Link de acesso: https://hdl.handle.net/1884/80361
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Nelson Augusto Rosario Filho
id UFPR_2021159e32b6da2f92cf83e06b460dfe
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/80361
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str
spelling Cogo, Laura Lúcia, 1969-Palmeiro, Jussara Kasuko, 1980-Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências da Saúde. Programa de Pós-Graduação em Medicina Interna e Ciências da SaúdeRosário Filho, Nelson Augusto, 1949-Souza, Dilair Camargo de2022-12-01T19:53:46Z2022-12-01T19:53:46Z2020https://hdl.handle.net/1884/80361Orientador: Prof. Dr. Nelson Augusto Rosario FilhoCoorientadoras: Dra. Laura Lúcia Cogo, Profa. Dra. Jussara Kasuko PalmeiroTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Medicina Interna e Ciências da Saúde. Defesa : Curitiba, 26/11/2020Inclui referênciasResumo: A exacerbação pulmonar é uma das manifestações graves em pacientes com Fibrose Cística (FC) que está relacionada a muitos microrganismos, entre eles Staphylococcus aureus. O surgimento de colônias pequenas de S. aureus dependente de timidina (TD-SCVs) estáveis e reversíveis está associado às infecções crônicas. Também tem sido relatado que o isolamento de TD-SCVs com outros microrganismos, está relacionado com perda da função pulmonar. Para avaliar as características moleculares de TD-SCVs, assim como as alterações clínicas associadas ao seu isolamento em pacientes com FC, foi realizado um estudo retrospectivo no período de julho de 2013 a julho de 2018. Amostras respiratórias foram coletadas de todos os pacientes atendidos neste período nos ambulatórios de FC do Hospital de Clínicas da UFPR. Os isolados de S. aureus foram identificados por métodos microbiológicos convencionais, e as colônias SCVs testados para dependência de menadiona, hemina e timidina. As colônias identificadas como TD-SCVs foram caracterizadas por reação da cadeia de polimerase (PCR) e sequenciamento de DNA para a análise do gene thyA e da genotipagem de sequências de múltiplos locos (MLST). Além disso, foram coletados dados clínicos em prontuários de 57 pacientes com FC para avaliação dos mesmos em um estudo de caso controle 1:2. Dos 246 pacientes atendidos em 208 (85%) se isolou S. aureus, destes em 23 (11%) foi isolado TDSCVs, com o fenótipo SCV estável em 18 (78%), e não estáveis em 5 (21,7%). As análises do sequenciamento do gene thyA mostraram que os isolados apresentaram diversos tipos de mutações, predominando a mutação por indels nos isolados SCV estáveis. Os clones mais encontrados foram ST5 e ST398. Dos 57 pacientes incluídos no estudo de caso-controle, 19 casos (com TD-SCVs) e 38 controles (sem TD-SCVs), 58% eram do gênero masculino e mediana de 11 anos. As análises estatísticas mostraram associações significativas entre o uso de sulfametaxazol-trimetoprim e surgimento de TD-SCVs (p < 0,001); internações e isolamento de TD-SCVs (p = 0,004); isolamento de TD-SCVs e S. maltophilia (p = 0,03); isolamento de TDSCVs e Distúrbio Ventilatório Obstrutivo (DVO) alterado, com Volume Expiratório Forçado em 1 segundo, VEF1 /L (p = 0,03) e VEF1% do previsto (p = 0,05). O estado nutricional e de função pulmonar mostrou que 18,5% dos pacientes com TD-SCVs tinham baixo peso, e função pulmonar em estado grave em relação a 3% dos pacientes controle. O diagnóstico laboratorial da identificação de TD-SCVs demonstrou grande relevância clínica, uma vez que a presença deste fenótipo está associada com a piora da função pulmonar e estado nutricional, impactando em aumento das hospitalizações e na qualidade de vida dos pacientes com FC.Abstract: Pulmonary exacerbation is one of the serious manifestations in patients with Cystic Fibrosis (CF), which is related to many microorganisms, including Staphylococcus aureus. The appearance of small colonies of thymidine dependent S. aureus (TD-SCVs) stable and reversible (not stable) is associated with chronic infections. It has also been reported that the isolation of TD-SCVs with other microorganisms is related to loss of lung function. To evaluate the molecular characteristics of TD-SCVs, as well as the clinical changes associated with isolation in CF patients, a retrospective study was carried out from July 2013 to July 2018. Respiratory samples were collected from all patients treated during this period at the outpatient clinics of the Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná. The isolates of S. aureus were identified by conventional microbiological methods, and the colonies SCVs tested for dependence on menadione, hemine and thymidine. The colonies identified as TD-SCVs were characterized by molecular biology techniques for the analysis of the thyA gene and the genotyping of multi-locus sequences (MLST). In addition, clinical data were collected from the medical records of 57 patients to evaluate them in a 1:2 control case study. Of the 246 patients attended in 208 (85%) patients, S. aureus was isolated from a respiratory sample, of these in 23 (11%) TD-SCVs were isolated, with the SCV phenotype stable in 18 (78%), and non-stable (reversible) in 5 (21.7%) patients. Sequencing analyses of the thyA gene showed that the isolates presented several types of mutations, predominantly the mutation by indels in stable SCV isolates. The most common clones were ST5 and ST398. Of the 57 patients included in the case-control study, 19 cases (with TD-SCVs) and 38 controls (without TD-SCVs), 58% were male and median 11 years. Statistical analyses showed significant associations between the use of sulfametaxazole-trimethoprim (TMP-SMX) and the appearance of TD-SCVs (p < 0.001); hospitalizations and isolation of TD-SCVs (p = 0.004); isolation of TD-SCVs and S. maltophilia (p = 0.03); isolation of TD-SCVs and altered Obstructive Ventilatory Disorder (OVD), with Forced Expiratory Volume in 1 second, VEF1 /L (p = 0.03) and VEF1% of the predicted (p = 0.05). Nutritional status and pulmonary function showed that 18.5% of patients with TD-SCVs had low weight, and pulmonary function was severely in relation to 3.0% of control patients. The identification of TD-SCVs demonstrated clinical relevance, since the presence of this phenotype was associated with worsening lung function and nutritional status, impacting the increase in hospitalizations and interfering with the quality of life of CF patients.1 recurso online : PDF.application/pdfStaphylococcus aureusFibrose cisticaTimidinaClínica MédicaCaracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose císticainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - T - DILAIR CAMARGO DE SOUZA.pdfapplication/pdf4719053https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/80361/1/R%20-%20T%20-%20DILAIR%20CAMARGO%20DE%20SOUZA.pdff3d7d1c9da046a750a9624e3034d180bMD51open access1884/803612022-12-01 16:53:46.093open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/80361Repositório InstitucionalPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestinformacaodigital@ufpr.bropendoar:3082022-12-01T19:53:46Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
title Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
spellingShingle Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
Souza, Dilair Camargo de
Staphylococcus aureus
Fibrose cistica
Timidina
Clínica Médica
title_short Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
title_full Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
title_fullStr Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
title_full_unstemmed Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
title_sort Caracterização molecular de auxotrofismo por timidina em colônias variantes pequenas de Staphylococcus aureus e seu impacto clínico em pacientes com fibrose cística
author Souza, Dilair Camargo de
author_facet Souza, Dilair Camargo de
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Cogo, Laura Lúcia, 1969-
Palmeiro, Jussara Kasuko, 1980-
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências da Saúde. Programa de Pós-Graduação em Medicina Interna e Ciências da Saúde
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Rosário Filho, Nelson Augusto, 1949-
dc.contributor.author.fl_str_mv Souza, Dilair Camargo de
contributor_str_mv Rosário Filho, Nelson Augusto, 1949-
dc.subject.por.fl_str_mv Staphylococcus aureus
Fibrose cistica
Timidina
Clínica Médica
topic Staphylococcus aureus
Fibrose cistica
Timidina
Clínica Médica
description Orientador: Prof. Dr. Nelson Augusto Rosario Filho
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-12-01T19:53:46Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-12-01T19:53:46Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/80361
url https://hdl.handle.net/1884/80361
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 1 recurso online : PDF.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/80361/1/R%20-%20T%20-%20DILAIR%20CAMARGO%20DE%20SOUZA.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv f3d7d1c9da046a750a9624e3034d180b
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv informacaodigital@ufpr.br
_version_ 1847526244469440512

Registros relacionados