Papel e regulação da via de processamento de pequenos RNAs em células somáticas do nematoide Caenorhabditis elegans
| Ano de defesa: | 2016 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
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Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
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Resumo: | o envelhecimento aumenta o risco de doenças crônicas, podendo ser retardado pela restrição calórica. Anteriormente, nosso grupo e colaboradores identificaram que, de forma conservada, a síntese de microRNAs diminui com o envelhecimento - sendo revertida pela restrição calórica. Esse fenômeno é decorrente da regulação da expressão de enzimas chave no processamento de microRNAs, principalmente de Dicer, que cliva o pre-miRNA em microRNA maduro. Buscamos nesse trabalho identificar como componentes dessa via são reguladas em C. elegans em situações que afetam a longevidade. Para isso, utilizamos linhagens integradas ao genoma do C. elegans em que o gene de Dicer ou Argonauta-I , sob controle de seus respectivos promotores codificam uma proteína fusionada à GFP. Com a análise microscópica, monitoramos a expressão dessas proteínas em diferentes situações, como restrição calórica, envelhecimento e vermes longevos sem linhagem germinativa. Identificamos que na ausência da linhagem gerrninati va há ativação 'da via de síntese de microRNAs cm células somáticas. Além disso, o aumento na longevidade desses vermes depende de Dicer. Para identificar reguladores de expressão de Dicer e Argonauta-l , realizamos uma varredura genética a partir de análise do modENCODE (banco de dados de experimentos de ChIP-Seq). Para Argonauta-L, conseguimos identificar que há regulação por um fator de transcrição conservado, PE-:li\-4/foxA, que atua na restrição calórica. Por fim, obtivemos um conjunto de resultados que são uma nota de cautela do uso irrestrito do vetor controle de RNAi L4440 para o estudo de transgenes em vermes, onde este produz um RNA dupla-fita que silencia in vivo o transgene GFP |
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http://lattes.cnpq.br/3425809117024031Souza, Evandro Araujo de [UNIFESP]http://lattes.cnpq.br/5256743517401619Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Mori, Marcelo Alves da Silva [UNIFESP]São Paulo2018-07-27T15:49:42Z2018-07-27T15:49:42Z2016-08-31o envelhecimento aumenta o risco de doenças crônicas, podendo ser retardado pela restrição calórica. Anteriormente, nosso grupo e colaboradores identificaram que, de forma conservada, a síntese de microRNAs diminui com o envelhecimento - sendo revertida pela restrição calórica. Esse fenômeno é decorrente da regulação da expressão de enzimas chave no processamento de microRNAs, principalmente de Dicer, que cliva o pre-miRNA em microRNA maduro. Buscamos nesse trabalho identificar como componentes dessa via são reguladas em C. elegans em situações que afetam a longevidade. Para isso, utilizamos linhagens integradas ao genoma do C. elegans em que o gene de Dicer ou Argonauta-I , sob controle de seus respectivos promotores codificam uma proteína fusionada à GFP. Com a análise microscópica, monitoramos a expressão dessas proteínas em diferentes situações, como restrição calórica, envelhecimento e vermes longevos sem linhagem germinativa. Identificamos que na ausência da linhagem gerrninati va há ativação 'da via de síntese de microRNAs cm células somáticas. Além disso, o aumento na longevidade desses vermes depende de Dicer. Para identificar reguladores de expressão de Dicer e Argonauta-l , realizamos uma varredura genética a partir de análise do modENCODE (banco de dados de experimentos de ChIP-Seq). Para Argonauta-L, conseguimos identificar que há regulação por um fator de transcrição conservado, PE-:li\-4/foxA, que atua na restrição calórica. Por fim, obtivemos um conjunto de resultados que são uma nota de cautela do uso irrestrito do vetor controle de RNAi L4440 para o estudo de transgenes em vermes, onde este produz um RNA dupla-fita que silencia in vivo o transgene GFPAging increases the risk of chronic diseases, and may be delayed by restrictions Caloric. Previously, our group and collaborators have identified that conserved form, the microRNAs synthesis decreases with age - being reversed by the restriction Caloric. This phenomenon is due to the regulation of the expression of key enzymes in processing microRNAs, especially Dicer, which cleaves the pre-miRNA in mature microRNA. We seek this work to identify how this pathway components are in C. elegans regulated in situations that affect longevity. Therefore, we use strains integrated into the genome of C. elegans in which Dicer or Argonaut gene-I under control of their respective promoters encode a protein fused to GFP. With the microscopic analysis, we monitored the expression of these proteins in different situations, as caloric restriction, aging and long-lived worms without germline. We found that in the absence of gerrninati va line's activation 'of the route of synthesis microRNAs cm somatic cells. Furthermore, the increase in longevity of these worms dependent on Dicer. To identify regulators of expression of Dicer and Argonaut-l We conducted a genetic scan from analysis of modENCODE (database ChIP-Seq experiments). For Argonauta-L, we can identify that there is regulation by a transcription factor conserved, PE: li \ -4 / FOXA, which operates in calorie restriction. Lastly, we obtained a set of results that are a note of caution vector unrestricted use L4440 control for RNAi transgene study worms where it produces an RNA double-stranded silencing in vivo transgene GFPDados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016)86 f.https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=3686551SOUZA, Evandro Araujo de. Papel e regulação da via de processamento de pequenos RNAs em células somáticas do nematoide Caenorhabditis elegans. 2016. 86 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas: Biologia Molecular) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2016.2016-0130.pdfhttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/46185ark:/48912/001300002rx8dporUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)EnvelhecimentoCaenorhabdifis elegansLinhagem germinativa dicerRnaiAgingCaenorhabdifis elegansLineGerm dicerRnaiPapel e regulação da via de processamento de pequenos RNAs em células somáticas do nematoide Caenorhabditis elegansinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPSão Paulo, Escola Paulista de Medicina (EPM)Ciências Biológicas (Biologia Molecular)Ciências biológicasBioquímicaORIGINALEVANDRO ARAÚJO DE SOUZA dis - PDF A.pdfapplication/pdf1782811https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/fea37720-e926-42c4-b55c-7aaf377c555c/downloada928ae6ee6a9ded3179b5ee5e70167a2MD5111600/461852025-04-07 14:26:04.873oai:repositorio.unifesp.br:11600/46185https://repositorio.unifesp.brRepositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestbiblioteca.csp@unifesp.bropendoar:34652025-04-07T14:26:04Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false |
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o envelhecimento aumenta o risco de doenças crônicas, podendo ser retardado pela restrição calórica. Anteriormente, nosso grupo e colaboradores identificaram que, de forma conservada, a síntese de microRNAs diminui com o envelhecimento - sendo revertida pela restrição calórica. Esse fenômeno é decorrente da regulação da expressão de enzimas chave no processamento de microRNAs, principalmente de Dicer, que cliva o pre-miRNA em microRNA maduro. Buscamos nesse trabalho identificar como componentes dessa via são reguladas em C. elegans em situações que afetam a longevidade. Para isso, utilizamos linhagens integradas ao genoma do C. elegans em que o gene de Dicer ou Argonauta-I , sob controle de seus respectivos promotores codificam uma proteína fusionada à GFP. Com a análise microscópica, monitoramos a expressão dessas proteínas em diferentes situações, como restrição calórica, envelhecimento e vermes longevos sem linhagem germinativa. Identificamos que na ausência da linhagem gerrninati va há ativação 'da via de síntese de microRNAs cm células somáticas. Além disso, o aumento na longevidade desses vermes depende de Dicer. Para identificar reguladores de expressão de Dicer e Argonauta-l , realizamos uma varredura genética a partir de análise do modENCODE (banco de dados de experimentos de ChIP-Seq). Para Argonauta-L, conseguimos identificar que há regulação por um fator de transcrição conservado, PE-:li\-4/foxA, que atua na restrição calórica. Por fim, obtivemos um conjunto de resultados que são uma nota de cautela do uso irrestrito do vetor controle de RNAi L4440 para o estudo de transgenes em vermes, onde este produz um RNA dupla-fita que silencia in vivo o transgene GFP |
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