Delimitação de espécies no complexo Physalaemus ephippifer (Anura: Leptodactylidae)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2021
Autor(a) principal: Silva, Izadora Emanuelle [UNIFESP]
Orientador(a): Sturaro, Marcelo José [UNIFESP]
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
dARK ID: ark:/48912/00130000296w3
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Diversidade; Amazônia; Conservação; Taxonomia Integrativa; Anuros.
Amazônia
Conservação
Taxonomia integrativa
Anuros
Palavras-chave em Inglês:
Diversity
Amazonia
Conservation
Integrative taxonomy
Anuran
Link de acesso: https://hdl.handle.net/11600/62654
Resumo: Embora ameaçada, a região Neotropical abriga uma riqueza ainda subestimada, pois diversas espécies novas vêm sendo descritas para a região. Nesta região é muito comum a ocorrência de espécies morfologicamente crípticas e nestes casos, o uso de várias fontes de evidências e análises de delimitação têm sido recomendados para investigar a diversidade de táxons, concedendo estabilidade taxonômica aos grupos estudados. Physalaemus ephippifer está amplamente distribuída na região norte do Neotrópico (Amazônia e nordeste brasileiro) e recentemente foi indicada como um possível complexo de espécies. Portanto, empregando uma abordagem integrativa utilizando dados morfológicos e moleculares em análises de delimitação baseadas em locus único (ABGD, mPTP e GMYC) e nos modelos coalescente multiespécies (BPP e iBPP), busquei inferir as possíveis linhagens e suas relações dentro do complexo P. ephippifer e testar hipóteses de delimitação de espécies. A análise filogenética recuperou cinco linhagens distintas dentro do complexo P. ephippifer, estruturadas geograficamente por rios e/ou biomas. Os métodos de delimitação baseados num locus único divergiram em relação ao número e configuração das espécies candidatas (1–3 possíveis espécies). Entretanto, através de testes de hipóteses de delimitação com métodos coalescentes de multiespécies (dados moleculares e/ou morfológicos) foram recuperadas cinco possíveis espécies candidatas em P. ephippifer.
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spelling http://lattes.cnpq.br/2776090230754156Silva, Izadora Emanuelle [UNIFESP]http://lattes.cnpq.br/7512323633571570Sturaro, Marcelo José [UNIFESP]Diadema2022-02-04T17:31:59Z2022-02-04T17:31:59Z2021-12-17Embora ameaçada, a região Neotropical abriga uma riqueza ainda subestimada, pois diversas espécies novas vêm sendo descritas para a região. Nesta região é muito comum a ocorrência de espécies morfologicamente crípticas e nestes casos, o uso de várias fontes de evidências e análises de delimitação têm sido recomendados para investigar a diversidade de táxons, concedendo estabilidade taxonômica aos grupos estudados. Physalaemus ephippifer está amplamente distribuída na região norte do Neotrópico (Amazônia e nordeste brasileiro) e recentemente foi indicada como um possível complexo de espécies. Portanto, empregando uma abordagem integrativa utilizando dados morfológicos e moleculares em análises de delimitação baseadas em locus único (ABGD, mPTP e GMYC) e nos modelos coalescente multiespécies (BPP e iBPP), busquei inferir as possíveis linhagens e suas relações dentro do complexo P. ephippifer e testar hipóteses de delimitação de espécies. A análise filogenética recuperou cinco linhagens distintas dentro do complexo P. ephippifer, estruturadas geograficamente por rios e/ou biomas. Os métodos de delimitação baseados num locus único divergiram em relação ao número e configuração das espécies candidatas (1–3 possíveis espécies). Entretanto, através de testes de hipóteses de delimitação com métodos coalescentes de multiespécies (dados moleculares e/ou morfológicos) foram recuperadas cinco possíveis espécies candidatas em P. ephippifer.The Neotropics harbors underestimated fauna diversity due to the ongoing description of novel species, albeit current threats to its conservation. Morphologically cryptic species are frequent in the Neotropics, while such a scenario implies using multiple data types and species delimitation analyses to determine taxon diversity and stability. The widespread distribution of Physalaemus ephippifer in northern Neotropics (i.e., Amazon and northeastern Brazil) is suggested as a potential species complex. Herein, I infer the relationships of different lineages in the P. ephippifer species complex and further test multiple species delimitation hypotheses. Moreover, this hypothesis testing relied on employing an integrative approach using morphological and molecular data under single-locus delimitation analyses (e.g., ABGD, mPTP, GMYC) and on the multispecies coalescent model (e.g., BPP and iBPP). The phylogenetic analysis recovered five distinct lineages within the P. ephippifer species complex, which are geographically structured by rivers and/or biomes. Delimitation methods based on a single locus diverged in the number and configuration of candidate species (from one to three potentially novel species). However, testing delimitation hypotheses with multi-species coalescent methods (molecular and/or morphological data) revealed five potentially novel species.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)CAPES: 88882.430861/2019-0174 f.https://hdl.handle.net/11600/62654ark:/48912/00130000296w3porUniversidade Federal de São Pauloinfo:eu-repo/semantics/openAccessDiversidade; Amazônia; Conservação; Taxonomia Integrativa; Anuros.AmazôniaConservaçãoTaxonomia integrativaAnurosDiversityAmazoniaConservationIntegrative taxonomyAnuranDelimitação de espécies no complexo Physalaemus ephippifer (Anura: Leptodactylidae)Integrative species delimitation in the Physalaemus ephippifer complex (Anura: Leptodactylidae)info:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPInstituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas (ICAQF)Ecologia e EvoluçãoSistemática, biogeografia e diversidade genéticaSistemáticaORIGINALDissertacao_Delimitacao_P_ephippifer_Izadora_Silva_02_02.pdfDissertacao_Delimitacao_P_ephippifer_Izadora_Silva_02_02.pdfDissertação de mestradoapplication/pdf2996909https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/487c7f28-3ae7-4563-80e3-0e49654a8344/download5831a5e64e28379ce21e8d4125375e6eMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-85838https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/a254fb10-87b5-492c-8d2e-6eebc7e40548/download7dcd89f5c639c13f38862637c781ab6eMD52TEXTDissertacao_Delimitacao_P_ephippifer_Izadora_Silva_02_02.pdf.txtDissertacao_Delimitacao_P_ephippifer_Izadora_Silva_02_02.pdf.txtExtracted texttext/plain101377https://repositorio.unifesp.br/bitstreams/f590d931-a8ff-4ad3-b158-decb1966eb63/downloadda8e51e55d73cd04b4b531c9e32e6823MD511THUMBNAILDissertacao_Delimitacao_P_ephippifer_Izadora_Silva_02_02.pdf.jpgDissertacao_Delimitacao_P_ephippifer_Izadora_Silva_02_02.pdf.jpgGenerated 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(UNIFESP)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Integrative taxonomy
Anuran
description Embora ameaçada, a região Neotropical abriga uma riqueza ainda subestimada, pois diversas espécies novas vêm sendo descritas para a região. Nesta região é muito comum a ocorrência de espécies morfologicamente crípticas e nestes casos, o uso de várias fontes de evidências e análises de delimitação têm sido recomendados para investigar a diversidade de táxons, concedendo estabilidade taxonômica aos grupos estudados. Physalaemus ephippifer está amplamente distribuída na região norte do Neotrópico (Amazônia e nordeste brasileiro) e recentemente foi indicada como um possível complexo de espécies. Portanto, empregando uma abordagem integrativa utilizando dados morfológicos e moleculares em análises de delimitação baseadas em locus único (ABGD, mPTP e GMYC) e nos modelos coalescente multiespécies (BPP e iBPP), busquei inferir as possíveis linhagens e suas relações dentro do complexo P. ephippifer e testar hipóteses de delimitação de espécies. A análise filogenética recuperou cinco linhagens distintas dentro do complexo P. ephippifer, estruturadas geograficamente por rios e/ou biomas. Os métodos de delimitação baseados num locus único divergiram em relação ao número e configuração das espécies candidatas (1–3 possíveis espécies). Entretanto, através de testes de hipóteses de delimitação com métodos coalescentes de multiespécies (dados moleculares e/ou morfológicos) foram recuperadas cinco possíveis espécies candidatas em P. ephippifer.
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