Desenvolvimento de Escore de Risco Poligênico para Fenótipos Complexos: Pressão Arterial Sistólica
| Ano de defesa: | 2022 |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5166/tde-10102022-113334/ |
Resumo: | A hipertensão arterial é uma doença complexa com alta prevalência e representa o principal fator de risco para doenças cardiovasculares. A contribuição genética é importante e se reflete em estimativas de herdabilidade de 25 a 68% em todo o mundo, embora os determinantes genéticos individuais permaneçam desconhecidos, dificultando a estratificação de risco e o manejo clínico racional. Os estudos de associação ampla no genoma (Genome-Wide Association Studies) identificam milhares de marcadores que vêm sendo testados em escores de risco poligênicos, no entanto, a maioria dos estudos são de populações europeias e a generalização dos resultados é limitada. Derivamos e validamos um escore de risco poligênico para pressão arterial sistólica (PAS) com os dados do UK Biobank usando 423 mil variantes que são comuns às encontradas na população brasileira. Encontramos aumento significativo da PAS no decil superior da distribuição de risco para a população de origem e para duas amostras populacionais brasileiras. Além disso, esses indivíduos apresentam risco duas e quatro vezes maior para hipertensão estágio I e II, respectivamente, independentemente da ancestralidade genética e da idade. Em contraste, quando utilizamos as 156 ou 17 variantes genéticas significantes com algum critério de evidência funcional os algoritmos gerados (Genetic Risk Scores) mostraram baixa capacidade preditiva. Em conjunto, demonstramos que a utilização de um conjunto de marcadores comuns a populações com estrutura genética distinta resulta em algoritmos de risco informativos e generalizáveis |
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Desenvolvimento de Escore de Risco Poligênico para Fenótipos Complexos: Pressão Arterial SistólicaDevelopment of a polygenic risk score for complex phenotypes: systolic blood pressureBlood pressureBlood pressure determinationComponentes genômicosDeterminação da pressão arterialGenomic componentesHerança multifatorialHipertensãoHypertensionMetabolismMetabolismoMultifactorial inheritancePressão arterialA hipertensão arterial é uma doença complexa com alta prevalência e representa o principal fator de risco para doenças cardiovasculares. A contribuição genética é importante e se reflete em estimativas de herdabilidade de 25 a 68% em todo o mundo, embora os determinantes genéticos individuais permaneçam desconhecidos, dificultando a estratificação de risco e o manejo clínico racional. Os estudos de associação ampla no genoma (Genome-Wide Association Studies) identificam milhares de marcadores que vêm sendo testados em escores de risco poligênicos, no entanto, a maioria dos estudos são de populações europeias e a generalização dos resultados é limitada. Derivamos e validamos um escore de risco poligênico para pressão arterial sistólica (PAS) com os dados do UK Biobank usando 423 mil variantes que são comuns às encontradas na população brasileira. Encontramos aumento significativo da PAS no decil superior da distribuição de risco para a população de origem e para duas amostras populacionais brasileiras. Além disso, esses indivíduos apresentam risco duas e quatro vezes maior para hipertensão estágio I e II, respectivamente, independentemente da ancestralidade genética e da idade. Em contraste, quando utilizamos as 156 ou 17 variantes genéticas significantes com algum critério de evidência funcional os algoritmos gerados (Genetic Risk Scores) mostraram baixa capacidade preditiva. Em conjunto, demonstramos que a utilização de um conjunto de marcadores comuns a populações com estrutura genética distinta resulta em algoritmos de risco informativos e generalizáveisArterial hypertension is a complex disease with a high prevalence and represents the main risk factor for cardiovascular diseases. The genetic contribution is important and is reflected in heritability estimates of 25 to 68% worldwide, but individual genetic determinants remain unknown, making risk stratification and rational clinical management difficult. The genome-wide association studies (Genome-Wide Association Studies) identified thousands of markers that have been tested in polygenic risk scores, however, most studies are from European populations and the generalizability of the results is limited. We derived and validated a polygenic risk score for systolic blood pressure (SBP) with data from the UK Biobank, but using 423 thousand variants that are common to those found in the Brazilian population. We found a significant increase in SBP in the upper decile of the risk distribution for the population of origin and for two Brazilian population samples. In addition, these individuals presented twofold and fourfold increased risk for hypertension stage I and II, respectively, independently of ancestry and age. In contrast, when we used the 156 or 17 significant genetic variants with some criterion of functional evidence, the generated algorithms (Genetic Risk Scores) showed low predictive capacity. Together, we demonstrate that the use of a set of markers common to populations with distinct genetic structure results in informative polygenic risk algorithmsBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPKrieger, Jose EduardoSouza, Vinicius de2022-06-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5166/tde-10102022-113334/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2022-10-27T13:58:26Zoai:teses.usp.br:tde-10102022-113334Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212022-10-27T13:58:26Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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