Diversidade genética de isolados de Mycobacterium tuberculosis resistentes a fármacos, circulantes em Salvador, Bahia, Brasil

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Carneiro, Rita Terezinha de Oliveira
Orientador(a): Bessa, Theolis Costa Barbosa
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/50138
Resumo: INTRODUÇÃO: Tuberculose (TB) persiste como um grave problema de saúde pública mundial. A resistência aos fármacos anti-TB, adquirida evolutivamente por linhagens mutantes de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) atua como um agravante no enfretamento da doença pois prolonga, onera e dificulta seu tratamento. O Brasil se mantem como um dos países de alta carga de TB em todo o mundo e a subnotificação de suas formas resistentes impacta de maneira negativa no controle da doença em território nacional. Salvador, capital da Bahia-Brasil reporta expressiva taxa de morbimortalidade por TB e ocupa a 5ª posição entre as capitais brasileiras em número absoluto da doença, até o presente momento. OBJETIVO: Descrever o padrão de distribuição espacial e caracterizar genotipicamente os isolados de Mtb resistentes aos fármacos circulantes em Salvador e no estado da Bahia. MATERIAL E MÉTODO: Informações clínicas e sociodemográficas dos casos de TB multidroga resistente (TBMDR) registrados no período de Janeiro de 2008 a Dezembro de 2011 foram extraídas de prontuários e analisadas por estatística descritiva. Dados de longitude e latitude das residências dos casos foram georreferenciados no programa QGis (v 2.18) e pelo software R. Os isolados de Mtb foram caracterizados por genotipagem clássica e pelo sequenciamento completo de genoma; seus perfis de resistência aos fármacos anti-TB empregados nas 1ª e 2ª linhas de tratamento foram respectivamente descritos pelos métodos de proporção e automatizado. RESULTADOS: Foram registradas 204 notificações de TBMDR em todo o estado da Bahia durante o período supracitado. Um percentual de 7% (N=14/204) dos casos foi caracterizado como TB extensivamente resistente (TBXDR). O perfil sociodemográfico dos pacientes com TBMDR foi constituído predominantemente por: homens; cor negra/parda; baixo nível instrucional e baixa renda per capita. Foi observada alta taxa de falência terapêutica (67%, N N=137/204), e adicionalmente o registro de abandono ao tratamento anti-TB (41%, N=83/204) e baixa adesão ao tratamento diretamente observado (TOD) (65%, N=133/204). Confirmação de atraso na emissão dos laudos sobre perfis de resistência dos isolados de Mtb e a má qualidade na informação prestada pelos municípios sugere subnotificação dos casos de TB resistente, especialmente no interior do estado. Os casos de TBMDR apresentaram dependência espacial nos bairros periféricos e com \201Cbolsões de pobreza\201D na cidade de Salvador. Análise por core genome MSLT dos 92 (45%, N=92/204) isolados revelou ocorrência de transmissão ativa de TBMDR em Salvador, Bahia no período em que os isolados foram coletados. Dados genotípicos identificaram dois clusters genéticos, os quais não apresentaram dependência espacial nos bairros de Salvador com alta carga de TB. Os isolados pertencem predominantemente às famílias: LAM e Haarlem. Destaque para presença de isolados da família/subfamília LAM-Cameroon com frequência maior aos demais registros nacionais. CONCLUSÕES: Os resultados reforçam a necessidade da efetivação do TOD e da urgência na adoção dos testes rápidos para caracterização de resistência das linhagens infectantes. Confirma-se o endemismo de TB na cidade de Salvador, Bahia e que a ocorrência dos casos de TBMDR registrados no período desse estudo se deve a transmissão ativa das linhagens já resistentes aos fármacos.
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O Brasil se mantem como um dos países de alta carga de TB em todo o mundo e a subnotificação de suas formas resistentes impacta de maneira negativa no controle da doença em território nacional. Salvador, capital da Bahia-Brasil reporta expressiva taxa de morbimortalidade por TB e ocupa a 5ª posição entre as capitais brasileiras em número absoluto da doença, até o presente momento. OBJETIVO: Descrever o padrão de distribuição espacial e caracterizar genotipicamente os isolados de Mtb resistentes aos fármacos circulantes em Salvador e no estado da Bahia. MATERIAL E MÉTODO: Informações clínicas e sociodemográficas dos casos de TB multidroga resistente (TBMDR) registrados no período de Janeiro de 2008 a Dezembro de 2011 foram extraídas de prontuários e analisadas por estatística descritiva. Dados de longitude e latitude das residências dos casos foram georreferenciados no programa QGis (v 2.18) e pelo software R. Os isolados de Mtb foram caracterizados por genotipagem clássica e pelo sequenciamento completo de genoma; seus perfis de resistência aos fármacos anti-TB empregados nas 1ª e 2ª linhas de tratamento foram respectivamente descritos pelos métodos de proporção e automatizado. RESULTADOS: Foram registradas 204 notificações de TBMDR em todo o estado da Bahia durante o período supracitado. Um percentual de 7% (N=14/204) dos casos foi caracterizado como TB extensivamente resistente (TBXDR). O perfil sociodemográfico dos pacientes com TBMDR foi constituído predominantemente por: homens; cor negra/parda; baixo nível instrucional e baixa renda per capita. Foi observada alta taxa de falência terapêutica (67%, N N=137/204), e adicionalmente o registro de abandono ao tratamento anti-TB (41%, N=83/204) e baixa adesão ao tratamento diretamente observado (TOD) (65%, N=133/204). Confirmação de atraso na emissão dos laudos sobre perfis de resistência dos isolados de Mtb e a má qualidade na informação prestada pelos municípios sugere subnotificação dos casos de TB resistente, especialmente no interior do estado. Os casos de TBMDR apresentaram dependência espacial nos bairros periféricos e com \201Cbolsões de pobreza\201D na cidade de Salvador. Análise por core genome MSLT dos 92 (45%, N=92/204) isolados revelou ocorrência de transmissão ativa de TBMDR em Salvador, Bahia no período em que os isolados foram coletados. Dados genotípicos identificaram dois clusters genéticos, os quais não apresentaram dependência espacial nos bairros de Salvador com alta carga de TB. Os isolados pertencem predominantemente às famílias: LAM e Haarlem. Destaque para presença de isolados da família/subfamília LAM-Cameroon com frequência maior aos demais registros nacionais. CONCLUSÕES: Os resultados reforçam a necessidade da efetivação do TOD e da urgência na adoção dos testes rápidos para caracterização de resistência das linhagens infectantes. Confirma-se o endemismo de TB na cidade de Salvador, Bahia e que a ocorrência dos casos de TBMDR registrados no período desse estudo se deve a transmissão ativa das linhagens já resistentes aos fármacos.INTRODUCTION: Tuberculosis (TB) persists as a serious public health problem worldwide. Resistance to anti-TB drugs, acquired evolutionarily by mutant strains of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) acts as an aggravating factor in control of the disease because it prolongs, burdens and makes treatment difficult. Brazil remains one of the countries with a high burden of TB worldwide and the underreporting of its resistant forms has a negative impact on the control of the disease in national territory. Salvador, capital of Bahia-Brazil reports an expressive TB morbidity and mortality rate and ranks 5th among Brazilian capitals in absolute number of the disease, until the present moment. OBJECTIVE: To describe the spatial distribution pattern and characterize genotypically the Mtb isolates resistant to circulating drugs in Salvador and the state of Bahia. MATERIAL AND METHOD: Clinical and sociodemographic information on cases of multidrug-resistant TB (MDR-TB) recorded from January 2008 to December 2011 were extracted from medical records and analyzed using descriptive statistics. Longitude and latitude data of the case residences were geo-referenced in the QGis program (v 2.18) and by the software R. Mtb isolates were characterized by classical genotyping and by complete genome sequencing; their resistance profiles to anti-TB drugs used in the 1st and 2nd treatment lines were described by proportion and automated methods, respectively. RESULTS: 204 MDR-TB notifications were recorded throughout the state of Bahia during the aforementioned period. A percentage of 7% (N=14/204) of the cases was characterized as extensively resistant TB (XDR-TB). The sociodemographic profile of patients with MDR-TB was constituted predominantly by: men; not white color; low educational level and low income per capita. There was a high rate of therapeutic failure (67%, N 137/204), in addition to the record of abandoning anti-TB treatment (41%, N=83/204) and low adherence to the directly observed treatment (DOT) ( 65%, N=133/204). Confirmation of delay in issuing reports on resistance profiles of Mtb isolates and the poor quality of information provided by municipalities suggests underreporting of cases of resistant TB, especially in the interior of the state. MDR-TB cases showed spatial dependence in peripheral neighborhoods and with poverty status in the city of Salvador. Analysis by MSLT core genome of the 92 (45%, N=92/204) isolates revealed the occurrence of active transmission of MDR-TB in Salvador, Bahia during the period in which the isolates were collected. Genotypic data identified two genetic clusters, which did not show spatial dependence in neighborhoods in Salvador with a high TB load. The isolates predominantly belong to the families: LAM and Haarlem. Highlight for the presence of isolates from the LAM-Cameroon family/subfamily with greater frequency than other national registries. CONCLUSIONS: The results reinforce the need for effective DOT and the urgency in adopting rapid tests to characterize the resistance of infectious strains. TB endemism in the city of Salvador, Bahia, is confirmed, and that the occurrence of MDR-TB cases recorded during the period of this study is due to the active transmission of strains already resistant to drugs.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.porEpidemiologia molecularGeorreferenciamentoResistência antimicrobianaMolecular epidemiologyGeoreferencingAntimicrobial resistanceEpidemiologia MolecularResistência MicrobianaMycobacterium TuberculosisPatogenDiversidade genética de isolados de Mycobacterium tuberculosis resistentes a fármacos, circulantes em Salvador, Bahia, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2020-12-09Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo MunizSalvador, BAPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/50138/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALRitaTerezinha Oliveira Carneiro. Diversidade genetica...2020 Tese.pdfRitaTerezinha Oliveira Carneiro. 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