SAMPA (System for Comparative Analysis of Metabolic PAthways) - uma comparação de vias metabólicas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2008
Autor(a) principal: Cunha, Oberdam de Lima lattes
Orientador(a): Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro lattes
Banca de defesa: Zaha, Arnaldo lattes, Lima, Priscila Machado Vieira lattes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Laboratório Nacional de Computação Científica
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Modelagem Computacional
Departamento: Serviço de Análise e Apoio a Formação de Recursos Humanos
País: BR
Palavras-chave em Português:
Metabolismo - Modelagem computacional
Comparação
Microplasmas
Grafos
Algoritmos
Palavras-chave em Inglês:
Metabolism-Modeling Computational
Comparison
Mycoplasma
Graphs
Algorithms
Área do conhecimento CNPq:
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO::TEORIA DA COMPUTACAO::COMPUTABILIDADE E MODELOS DE COMPUTACAO
Link de acesso: https://tede.lncc.br/handle/tede/91
Resumo: The advent of genome sequencing technology and complete genome analysis has provided new data on prokaryote and eukaryote metabolic pathways. The comparative analysis of metabolic pathways from different organisms can help us understand inter and intra species organizational relationships. Having this in mind, this work focused on building a system that allows for comparing the bacterial metabolic pathways, according to a set of pre-established criteria. SAMPA (System for comparative Analysis of Metabolic PAthways) comprises a database containing information on metabolic pathways in many organisms, and a set of five tools that can be used to compare these metabolic pathways and to group organisms carrying metabolic pathways that are related. As a case study to validate the tool, we the Mycoplasmataceae family of organisms was used.
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