Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Schiavo, Mauricio
Orientador(a): Echeverrigaray, Sergio
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Link de acesso: https://repositorio.ucs.br/11338/4858
Resumo: 2,3-butanodiol (BDO) é um composto orgânico de fórmula C4H10O2 que possui três estereoisômeros e que vem sendo amplamente utilizado na fabricação de 1,3-butanodieno, anticongelantes, espumas de poliuretano, polímeros plásticos, combustíveis líquidos e outras matérias-primas químicas normalmente produzidas a partir de derivados de gás natural e petróleo bruto. Devido às suas diversas aplicações na indústria, a demanda por BDO aumenta a cada ano sendo que o mercado potencial global de BDO é de cerca de 32 milhões de toneladas por ano. Todos os três estereoisômeros de BDO podem ser produzidos por microrganismos em processos fermentativos, sendo que alguns microorganismos são capazes de produzir BDO utilizando glicerol como fonte de carbono e energia. Dentre estes microrganismos destaca-se E. aerogenes, capaz de produzir BDO em grande quantidade a partir de glicerol, sendo o glicerol uma alternativa de interesse econômico por ser o principal resíduo da produção de biodiesel e que atualmente é exportado como matéria prima com baixo valor agregado. O objetivo deste projeto foi identificar os recursos genéticos de Klebsiella aerogenes KCTC 2190 (cepa sinônimo de E. aerogenes ATCC 13048) para consumo de glicerol e sua conversão em diidroxiacetona e produção de BDO e a organização destes genes em operons e proximidade com outros genes relacionados com estas vias metabólicas e desenvolver estratégias de aumento na produção de BDO a partir de glicerol pela construção de uma enzima quimérica utilizando biologia sintética, que seja capaz de atribuir vantagem em três gargalos para aumento da capacidade de conversão de glicerol em BDO, sendo estes: o aumento da conversão de glicerol em DHA; o aumento da conversão de acetoína em BDO; e o reciclo mútuo de cofatores NAD e NADH utilizados em ambas as vias. O gene para a enzima quimérica desenvolvida foi clonado em Escherichia coli DH5α para de glicerol e formação de biomassa e formação de BDO a partir de acetoína. Os extratos brutos de Escherichia coli contendo a enzima quimérica foram avaliados em reação enzimática para investigar sua atividade sobre a conversão de glicerol e conversão de acetoína em BDO. O gene para a enzima quimérica desenvolvida pode ser utilizada em estudos futuros envolvendo sua clonagem em cepas bacterianas produtoras de acetoína e BDO como as espécies da família Enterobacteriaceae. O plasmídeo construído para expressão do gene para a enzima quimérica também permite a clonagem de genes em operon com a enzima quimérica e em promotor individual, ampliando as possibilidades de seu uso na engenharia metabólica de microrganismos para consumo de glicerol e produção de BDO.
id UCS_b8c6d72d047b69ad20d12d5cc3cc0f43
oai_identifier_str oai:repositorio.ucs.br:11338/4858
network_acronym_str UCS
network_name_str Repositório Institucional da UCS
repository_id_str
spelling Schiavo, MauricioCamassola, MarliPaesi, Suelen OsmarinaAyub, Marco Antônio ZáchiaZaha, ArnaldoEcheverrigaray, Sergio2019-08-05T15:55:00Z2019-08-05T15:55:00Z2019-08-052019-04-25https://repositorio.ucs.br/11338/48582,3-butanodiol (BDO) é um composto orgânico de fórmula C4H10O2 que possui três estereoisômeros e que vem sendo amplamente utilizado na fabricação de 1,3-butanodieno, anticongelantes, espumas de poliuretano, polímeros plásticos, combustíveis líquidos e outras matérias-primas químicas normalmente produzidas a partir de derivados de gás natural e petróleo bruto. Devido às suas diversas aplicações na indústria, a demanda por BDO aumenta a cada ano sendo que o mercado potencial global de BDO é de cerca de 32 milhões de toneladas por ano. Todos os três estereoisômeros de BDO podem ser produzidos por microrganismos em processos fermentativos, sendo que alguns microorganismos são capazes de produzir BDO utilizando glicerol como fonte de carbono e energia. Dentre estes microrganismos destaca-se E. aerogenes, capaz de produzir BDO em grande quantidade a partir de glicerol, sendo o glicerol uma alternativa de interesse econômico por ser o principal resíduo da produção de biodiesel e que atualmente é exportado como matéria prima com baixo valor agregado. O objetivo deste projeto foi identificar os recursos genéticos de Klebsiella aerogenes KCTC 2190 (cepa sinônimo de E. aerogenes ATCC 13048) para consumo de glicerol e sua conversão em diidroxiacetona e produção de BDO e a organização destes genes em operons e proximidade com outros genes relacionados com estas vias metabólicas e desenvolver estratégias de aumento na produção de BDO a partir de glicerol pela construção de uma enzima quimérica utilizando biologia sintética, que seja capaz de atribuir vantagem em três gargalos para aumento da capacidade de conversão de glicerol em BDO, sendo estes: o aumento da conversão de glicerol em DHA; o aumento da conversão de acetoína em BDO; e o reciclo mútuo de cofatores NAD e NADH utilizados em ambas as vias. O gene para a enzima quimérica desenvolvida foi clonado em Escherichia coli DH5α para de glicerol e formação de biomassa e formação de BDO a partir de acetoína. Os extratos brutos de Escherichia coli contendo a enzima quimérica foram avaliados em reação enzimática para investigar sua atividade sobre a conversão de glicerol e conversão de acetoína em BDO. O gene para a enzima quimérica desenvolvida pode ser utilizada em estudos futuros envolvendo sua clonagem em cepas bacterianas produtoras de acetoína e BDO como as espécies da família Enterobacteriaceae. O plasmídeo construído para expressão do gene para a enzima quimérica também permite a clonagem de genes em operon com a enzima quimérica e em promotor individual, ampliando as possibilidades de seu uso na engenharia metabólica de microrganismos para consumo de glicerol e produção de BDO.2,3-butanediol (BDO) is an organic compound with formula C4H10O2 which has three stereoisomers, and that has been widely used in the manufacture of 1,3-butadiene, antifreeze additives, polyurethane foams, plastic polymers, liquid fuels and other chemicals usually produced from natural gas and crude petrol derivatives. Due to its diverse applications in the industry, the demand for BDO increases every year, and the overall potential market of BDO is around 32 million tonnes per year. All three stereoisomers of BDO can be produced by microorganisms consuming different reduced carbon sources as substrate. These microorganisms, especially E. aerogenes ATCC 13048, are capable of using other carbon sources for fermentation and BDO formation, with glycerol being of economic interest for it is the major residue of biodiesel production and currently is exported as a low-value compound. This project aims to identify genetic resources for consumption of glycerol and its conversion to dihydroxyacetone and production of 2,3-butanediol from pyruvate. The genes identified, present in the genome of Klebsiella aerogenes KCTC 2190 (synonym strain of E. aerogenes ATCC 13048) and its organization in operons and proximity to other related genes and metabolic pathways were used to develop a strategy of increasing the production of 2,3-butanediol from glycerol by constructing a fusion enzyme using synthetic biology. The fusion enzyme designed aims to confer an advantage on three bottlenecks for increasing the fermentative capacity of glycerol in BDO, the solutions for those bottlenecks being the increased consumption of glycerol in DHA, increased conversion of acetoin to BDO and the mutual recycle of NAD and NADH cofactors used in both pathways. The developed fusion enzyme was cloned in Escherichia coli DH5α to evaluate its effect on glycerol consumption and biomass formation and production of BDO from acetoin. The crude extracts of Escherichia coli containing the fusion enzyme were evaluated in an enzymatic reaction to investigate their activity on the conversion of glycerol and conversion of acetoin to BDO. The developed fusion enzyme can be used in future studies involving its cloning in bacterial strains what already produce acetoin and BDO as the species of the family Enterobacteriaceae. The plasmid constructed for the fusion enzyme expression also allows the cloning of genes in the operon with the fusion enzyme and under an individual promoter, expanding the possibilities of its use in the metabolic engineering of microorganisms for consumption of glycerol and production of BDOFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul, FAPERGSBactérias anaeróbicasFermentaçãoMicroorganismosAnaerobic bacteriaFermentationMicroorganismsUtilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutaseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UCSinstname:Universidade de Caxias do Sul (UCS)instacron:UCSinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://lattes.cnpq.br/8056589161420803SCHIAVO, M.Programa de Pós-Graduação em BiotecnologiaSilveira, Mauricio Moura daORIGINALDissertacao Mauricio Schiavo.pdfDissertacao Mauricio Schiavo.pdfapplication/pdf2396970https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/1/Dissertacao%20Mauricio%20Schiavo.pdf25d477449a8aa25f1d7272c8de7c5b8aMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8510https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/2/license.txt0bfdaf5679b458f1c173109e3e8d8e40MD52TEXTDissertacao Mauricio Schiavo.pdf.txtDissertacao Mauricio Schiavo.pdf.txtExtracted texttext/plain268226https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/3/Dissertacao%20Mauricio%20Schiavo.pdf.txt2785e4a21f02a560263c53e8a08b514bMD53THUMBNAILDissertacao Mauricio Schiavo.pdf.jpgDissertacao Mauricio Schiavo.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1257https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/4/Dissertacao%20Mauricio%20Schiavo.pdf.jpgef547e1615a3f7c72bb84f0012c92b77MD5411338/48582023-06-16 17:39:06.899oai:repositorio.ucs.br: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ório de Publicaçõeshttp://repositorio.ucs.br/oai/requestopendoar:2023-06-16T17:39:06Repositório Institucional da UCS - Universidade de Caxias do Sul (UCS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
title Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
spellingShingle Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
Schiavo, Mauricio
Bactérias anaeróbicas
Fermentação
Microorganismos
Anaerobic bacteria
Fermentation
Microorganisms
title_short Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
title_full Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
title_fullStr Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
title_full_unstemmed Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
title_sort Utilização dos recursos genéticos de Enterobacter aerogenes ATCC 13048 para o desenvolvimento de enzima quimérica glicerol desidrogenase-acetoína redutase
author Schiavo, Mauricio
author_facet Schiavo, Mauricio
author_role author
dc.contributor.other.none.fl_str_mv Camassola, Marli
Paesi, Suelen Osmarina
Ayub, Marco Antônio Záchia
Zaha, Arnaldo
dc.contributor.author.fl_str_mv Schiavo, Mauricio
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Echeverrigaray, Sergio
contributor_str_mv Echeverrigaray, Sergio
dc.subject.por.fl_str_mv Bactérias anaeróbicas
Fermentação
Microorganismos
topic Bactérias anaeróbicas
Fermentação
Microorganismos
Anaerobic bacteria
Fermentation
Microorganisms
dc.subject.eng.fl_str_mv Anaerobic bacteria
Fermentation
Microorganisms
description 2,3-butanodiol (BDO) é um composto orgânico de fórmula C4H10O2 que possui três estereoisômeros e que vem sendo amplamente utilizado na fabricação de 1,3-butanodieno, anticongelantes, espumas de poliuretano, polímeros plásticos, combustíveis líquidos e outras matérias-primas químicas normalmente produzidas a partir de derivados de gás natural e petróleo bruto. Devido às suas diversas aplicações na indústria, a demanda por BDO aumenta a cada ano sendo que o mercado potencial global de BDO é de cerca de 32 milhões de toneladas por ano. Todos os três estereoisômeros de BDO podem ser produzidos por microrganismos em processos fermentativos, sendo que alguns microorganismos são capazes de produzir BDO utilizando glicerol como fonte de carbono e energia. Dentre estes microrganismos destaca-se E. aerogenes, capaz de produzir BDO em grande quantidade a partir de glicerol, sendo o glicerol uma alternativa de interesse econômico por ser o principal resíduo da produção de biodiesel e que atualmente é exportado como matéria prima com baixo valor agregado. O objetivo deste projeto foi identificar os recursos genéticos de Klebsiella aerogenes KCTC 2190 (cepa sinônimo de E. aerogenes ATCC 13048) para consumo de glicerol e sua conversão em diidroxiacetona e produção de BDO e a organização destes genes em operons e proximidade com outros genes relacionados com estas vias metabólicas e desenvolver estratégias de aumento na produção de BDO a partir de glicerol pela construção de uma enzima quimérica utilizando biologia sintética, que seja capaz de atribuir vantagem em três gargalos para aumento da capacidade de conversão de glicerol em BDO, sendo estes: o aumento da conversão de glicerol em DHA; o aumento da conversão de acetoína em BDO; e o reciclo mútuo de cofatores NAD e NADH utilizados em ambas as vias. O gene para a enzima quimérica desenvolvida foi clonado em Escherichia coli DH5α para de glicerol e formação de biomassa e formação de BDO a partir de acetoína. Os extratos brutos de Escherichia coli contendo a enzima quimérica foram avaliados em reação enzimática para investigar sua atividade sobre a conversão de glicerol e conversão de acetoína em BDO. O gene para a enzima quimérica desenvolvida pode ser utilizada em estudos futuros envolvendo sua clonagem em cepas bacterianas produtoras de acetoína e BDO como as espécies da família Enterobacteriaceae. O plasmídeo construído para expressão do gene para a enzima quimérica também permite a clonagem de genes em operon com a enzima quimérica e em promotor individual, ampliando as possibilidades de seu uso na engenharia metabólica de microrganismos para consumo de glicerol e produção de BDO.
publishDate 2019
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2019-04-25
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-08-05T15:55:00Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-08-05T15:55:00Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2019-08-05
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ucs.br/11338/4858
url https://repositorio.ucs.br/11338/4858
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UCS
instname:Universidade de Caxias do Sul (UCS)
instacron:UCS
instname_str Universidade de Caxias do Sul (UCS)
instacron_str UCS
institution UCS
reponame_str Repositório Institucional da UCS
collection Repositório Institucional da UCS
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/1/Dissertacao%20Mauricio%20Schiavo.pdf
https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/2/license.txt
https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/3/Dissertacao%20Mauricio%20Schiavo.pdf.txt
https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/4858/4/Dissertacao%20Mauricio%20Schiavo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 25d477449a8aa25f1d7272c8de7c5b8a
0bfdaf5679b458f1c173109e3e8d8e40
2785e4a21f02a560263c53e8a08b514b
ef547e1615a3f7c72bb84f0012c92b77
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UCS - Universidade de Caxias do Sul (UCS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1798309146255163392