Análises evolutivas em Spondias L.: uma abordagem genômica do gênero.

• Ano de defesa: 2019
• Autor(a) principal: Martins, Gleica Maria Correia
• Orientador(a): Almeida, Cícero Carlos de Souza
• Banca de defesa: Silva, André Seco Marques da , Souza, Luiz Gustavo Rodrigues de , Broetto, Leonardo
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Alagoas
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Agronomia
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: Mitogenoma; Tamanho do genoma; Fração repetitiva; Evolução genômica; Anacardiaceae; Genome size; Repetitive fraction; Genomic evolution
• Área do conhecimento CNPq: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA
• Link de acesso: http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/5918

O gênero Spondias é um grupo de árvores frutíferas da família Anacardiaceae que compreende espécies de importância econômica, com distribuição nas regiões neotropiciais. Estudos de caracterização genômica no gênero tem potencial de fornecer importantes informações para a compreensão da origem e evolução das espécies. Nessa perspectiva, neste estudo objetivou-se sequenciar os mitogenomas, avaliar o conteúdo de DNA e caracterizar a fração repetitiva do genoma de espécies do gênero Spondias, a fim de descrever a composição das sequências repetitivas nos genomas e estabelecer relações evoluitvas com a fiogenia no gênero Spondias. Para isso foi feita extração de DNA de S. tuberosa, S. mombim, S. bahiensis, Spondias sp.(S. tuberosa x S.bahiensis) e Spondias dulcis e preparadas bibliotecas de single-end e paired-end reads e feita análises de bioinformática em softwares para montagem de genomas mitocondriais e caracterização da fração repetitiva dos genomas, além de quantificação do conteúdo de DNA genômico usando citometria de fluxo. Os mitogenomes apresentaram 779,106 bp e 674,156 bp, para S. tuberosa e S. mombin, exibindo um total de 74 genes e 68 genes, respectivamente, com estrutura com muitos rearranjos mediados pela presença de DNA repetitivo e alta incorporação de DNA do cloroplasto. A análise do conteúdo de DNA e da fração repetitiva do genoma demonstraram que os tamanhos dos genomas de Spondias analisados variaram de 460 a 530 Mb e a análise filogenética revelou uma tendência ao aumento no tamanho do genoma em espécies mais diversificadas. As análises de composição do genoma resultaram na identificação e caracterização do DNA repetitivo, perfazendo aproximadamente 35,57% em S. tuberosa, 33,43% em S. mombim, 34,60% em Spondias sp, 31,02% S. bahiensis e 49,66% em S.dulcis. Para satDNA foram observados dois satélites principais distribuídos em todas as espécies, sendo o SatSpo1 com alta diversificação no gênero. Além disso, para S. tuberosa foi detectado um satélite no espaçador intergênico de rDNA. A hibridização in situ do satDNA (SatSpo1 e SatSpo2) evidenciou a baixa diversificação de DNA repetitivo, a presença de satélites ricos em GC que provavelmente estaõ distrubuídos em regiões de heterocromatina. A partir disso, conclui-se que o gênero Spondias tem uma diversificação recente do DNA repetitivo, com distribuição similar de TEs e famílias de satDNA entre as espécies.