Padrões de expressão gênica em indivíduos com tuberculose ativa e infecção latente, vacinados ou não com o Bacilo de Calmette-Guérin (BCG)
Ano de defesa: | 2018 |
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Tipo de documento: | Dissertação |
Tipo de acesso: | Acesso aberto |
Idioma: | por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal da Bahia
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Programa de Pós-Graduação: |
Pós-Graduação em Patologia Humana e Patologia Experimental (PGPAT)
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Departamento: |
Faculdade de Medicina da Bahia
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País: |
Brasil
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Palavras-chave em Português: | |
Área do conhecimento CNPq: | |
Link de acesso: | https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38586 |
Resumo: | INTRODUÇÃO: A tuberculose (TB) é uma doença infecciosa crônica de difícil manejo, pelos diferentes estados de equilíbrio entre a infecção e a resposta imune do indivíduo em sua evolução natural. O reconhecimento precoce da doença ativa é muito importante para o controle da disseminação do bacilo e prevenção de novos casos. Vários estudos têm procurado demonstrar biomarcadores que possam ajudar a reconhecer os diferentes estágios de manifestação da doença, que vão desde a latência à doença ativa. Nos últimos anos, abordagens utilizando biologia de sistemas, uma ferramenta de análise global que permite reconhecer processos modulados na interação entre patógeno e hospedeiro de forma integrada, vêm sendo empregadas para auxiliar na identificação de biomarcadores relevantes no curso da infecção tuberculosa. Porém, há escassez de dados na literatura sobre como a vacina BCG, amplamente utilizada contra a TB em todo o mundo e com amplo espectro de efeitos sobre o organismo, pode influenciar na modulação da resposta imune e na patogênese da doença. OBJETIVO: Caracterizar o perfil de expressão gênica em indivíduos com a tuberculose ativa, infecção latente e controles não infectados, incluindo a variável do status de vacinação com a BCG. MATERIAL E MÉTODOS: Para entendermos os potenciais processos biológicos envolvidos nesta interação, efetuamos análises de bioinformática utilizando dados de expressão gênica do banco de dados público Gene Expression Omnibus (GEO). Foram obtidos 3 conjuntos de dados de transcriptoma que avaliaram amostras de sangue total de indivíduos com tuberculose ativa e latente, bem como controles saudáveis, com o status de vacinação com a BCG estabelecido. RESULTADOS: Entre os vacinados, os indivíduos com doença tuberculosa diferem dos controles em 4 genes, que estão associados à morte e sobrevivência celular, a autofagia, bem como a maturação do fagossomo. Ao comparar indivíduos com TB ativa e infecção latente observa-se 3 genes modulados, que estão associados ao metabolismo lipídico e de carboidratos, assim como transporte molecular. Em contraste, entre indivíduos não vacinados, as comparações entre indivíduos controles, infectados e doentes mostram 100 moléculas moduladas, com algumas intersecções em vias moduladas entre indivíduos vacinados. RAB25 e SLC30A3 apresentam-se modulados positivamente em indivíduos doentes não vacinados em comparação com vacinados. Essas moléculas agem sobre o transporte molecular, migração celular, sinalização célula-célula, bem como no metabolismo de carboidratos. CONCLUSÃO: Nossos resultados sugerem que a vacinação prévia com BCG interfere na modulação de genes específicos, influenciando na patogênese da doença pela alteração de vias importantes no controle da infecção. Estes achados podem ser aplicados no desenvolvimento de novas terapias ou otimização de terapias já existentes. |
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Porém, há escassez de dados na literatura sobre como a vacina BCG, amplamente utilizada contra a TB em todo o mundo e com amplo espectro de efeitos sobre o organismo, pode influenciar na modulação da resposta imune e na patogênese da doença. OBJETIVO: Caracterizar o perfil de expressão gênica em indivíduos com a tuberculose ativa, infecção latente e controles não infectados, incluindo a variável do status de vacinação com a BCG. MATERIAL E MÉTODOS: Para entendermos os potenciais processos biológicos envolvidos nesta interação, efetuamos análises de bioinformática utilizando dados de expressão gênica do banco de dados público Gene Expression Omnibus (GEO). Foram obtidos 3 conjuntos de dados de transcriptoma que avaliaram amostras de sangue total de indivíduos com tuberculose ativa e latente, bem como controles saudáveis, com o status de vacinação com a BCG estabelecido. RESULTADOS: Entre os vacinados, os indivíduos com doença tuberculosa diferem dos controles em 4 genes, que estão associados à morte e sobrevivência celular, a autofagia, bem como a maturação do fagossomo. Ao comparar indivíduos com TB ativa e infecção latente observa-se 3 genes modulados, que estão associados ao metabolismo lipídico e de carboidratos, assim como transporte molecular. Em contraste, entre indivíduos não vacinados, as comparações entre indivíduos controles, infectados e doentes mostram 100 moléculas moduladas, com algumas intersecções em vias moduladas entre indivíduos vacinados. RAB25 e SLC30A3 apresentam-se modulados positivamente em indivíduos doentes não vacinados em comparação com vacinados. Essas moléculas agem sobre o transporte molecular, migração celular, sinalização célula-célula, bem como no metabolismo de carboidratos. CONCLUSÃO: Nossos resultados sugerem que a vacinação prévia com BCG interfere na modulação de genes específicos, influenciando na patogênese da doença pela alteração de vias importantes no controle da infecção. Estes achados podem ser aplicados no desenvolvimento de novas terapias ou otimização de terapias já existentes.INTRODUCTION: Tuberculosis (TB) is a chronic infectious disease difficult to manage due to the different equilibrium states between the infection and the individual’s immune response in its natural evolution. Early identification of active disease is very important for the bacillus dissemination control and prevention of new cases. Several studies attempted to find molecules that may help to distinct stages of disease manifestation, ranging from latent to active disease. In recent years, a global analysis tool that allows the recognition of modulated processes between pathogen and host interaction called systems biology have been employed to assist in the identification of relevant biomarkers in tuberculosis infection course. However, there is a shortage of data in the literature on how the BCG vaccine, widely used against TB worldwide and with a wide spectrum of effects on the organism, can influence the modulation of the immune response and the pathogenesis of the disease. AIM: To characterize the gene expression profile in individuals with active tuberculosis, latent infection and non-infected controls, including the variable of vaccination status with BCG. MATERIAL AND METHODS: To understand the potential biological processes involved in this interaction, we performed bioinformatics analyzes using gene expression data from the public database Gene Expression Omnibus (GEO). Transcriptome data from 3 datasets that evaluated whole blood samples from individuals with active and latent tuberculosis, as well as healthy controls, with their established BCG vaccination status were obtained. RESULTS: Among vaccinated, those with tuberculous disease differ from controls in 4 genes, which are associated with cell death and survival, autophagy, as well as phagossome maturation. When comparing individuals with active TB and latent infection, 3 modulated genes are observed, which are associated with lipid and carbohydrate metabolism, as well as molecular transport. In contrast, among unvaccinated individuals, comparisons between controls individuals, infected and patients presented 100 modulated molecules, with some intersections in modulated pathways between vaccinated individuals. RAB25 and SLC30A3 are upregulated in unvaccinated patients compared to vaccinated. These molecules act on molecular transport, cell movement, cell-cell signaling, as well as carbohydrate metabolism. CONCLUSION: Our results suggest that previous vaccination with BCG interferes in the modulation of specific genes, influencing the pathogenesis of the disease by altering important pathways in infection control. These findings can be applied to the development of new therapies or optimizing existing therapies.Submitted by Glauber de Assunção Moreira (glauber.moreira@ufba.br) on 2023-12-01T15:11:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 701 bytes, checksum: 42fd4ad1e89814f5e4a476b409eb708c (MD5) DISSERTAÇÃO Mota, Scarlet Torres Moraes.pdf: 1800152 bytes, checksum: 196bdef3bbf7bc353214f318cbf6bec3 (MD5)Approved for entry into archive by Edvaldo Souza (edvaldosouza@ufba.br) on 2023-12-04T16:24:19Z (GMT) No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Mota, Scarlet Torres Moraes.pdf: 1800152 bytes, checksum: 196bdef3bbf7bc353214f318cbf6bec3 (MD5) license_rdf: 701 bytes, checksum: 42fd4ad1e89814f5e4a476b409eb708c (MD5)Made available in DSpace on 2023-12-04T16:24:19Z (GMT). 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MenezesRamos, Pablo Ivan PereiraBessa, Theolis Costa Barbosahttp://lattes.cnpq.br/8848294814337836Mota, Scarlet Torres Moraesreponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBATEXTDISSERTAÇÃO Mota, Scarlet Torres Moraes.pdf.txtDISSERTAÇÃO Mota, Scarlet Torres Moraes.pdf.txtExtracted texttext/plain104980https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38586/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Mota%2c%20Scarlet%20Torres%20Moraes.pdf.txte0c118eb11772cf6dd26fa6cef95b4caMD54ORIGINALDISSERTAÇÃO Mota, Scarlet Torres Moraes.pdfDISSERTAÇÃO Mota, Scarlet Torres Moraes.pdfapplication/pdf1800152https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38586/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Mota%2c%20Scarlet%20Torres%20Moraes.pdf196bdef3bbf7bc353214f318cbf6bec3MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8701https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38586/2/license_rdf42fd4ad1e89814f5e4a476b409eb708cMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1715https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38586/3/license.txt67bf4f75790b0d8d38d8f112a48ad90bMD53ri/385862023-12-09 02:04:14.834oai:repositorio.ufba.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://192.188.11.11:8080/oai/requestopendoar:19322023-12-09T05:04:14Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false |
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