Análise do perfil de resistência do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) aos inibidores da transcriptase reversa não análogos de nucleosídeos (ITRNN) em Goiás

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2010
Autor(a) principal: Pacheco, Priscila Ribeiro Guimarães lattes
Orientador(a): Turchi, Marilia Dalva lattes
Banca de defesa: Turchi, Marilia Dalva, Pereira, Gisner Alves de Souza, Araújo Filho, João Alves de
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Goiás
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-graduação em Medicina Tropical e Saúde Publica (IPTSP)
Departamento: Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG)
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/9230
Resumo: Objectives: To describe and analyze HIV-1 resistance mutational profiles associated with non- nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs) from patients experiencing antiretroviral therapy failure; at the main reference public Center in Goiás State. Methods: Samples from 474 patients were collected and processed according to the National Genotyping Network (RENAGENO), between 2006 and e 2009. Patient’s files (genotype exams) and medical records were used as data source. Number of TCD4 cells, HIV-1 viral load quantification, viral subtype and mutation profile assessment (TRUGENE HIV-1 Genotyping Test e ViroSeq System) were done according to the routine adopted by Central State Laboratory (LACEN). Resistance mutation profiles were identified using the Brazilian Algorithm and the Stanford Database Program. Cross resistance between NNRTIs: nevirapine, efavirenz and etravirine were analyzed. Descriptive and exploratory analyses were performed for socio-demographics variables and laboratory results (SPSS 15.0). Results: Samples from 126 adult patients were resistant to nevirapine (NVP) and efavirenz (EVF) Subtyping analysis showed a predominance of subtype B (86.1%), followed by BF1 recombinant (7.8%). Half of the patients received three or more antiretroviral therapy regimes. The most frequent mutations were 103N (72.2%) and 225H (22.2%). Mutations related to decreased etravirine (ETV) activity were detected in 8 codons: 98, 100, 101, 181, 188, 190 e 230 Intermediate ETV resistance were present in 27.0% and 15.1% of the samples, according to the Brazilian protocol and to Stanford Db Program, respectively. High-degree of ETV resistance were present in 10 samples (7.9%; IC95% 3.9-14.1), according to the Brazilian protocol Using the Stanford dB Program, 3 out of 126 patients (2.4%; IC95% 3.9-14.1) had high-degree of resistance. Clinical characteristics, number of T CD4 cells and viral load were not predictors to ETV resistance. Conclusions: The presence of at least one mutation potentially associated with decreased virological response to ETV was frequent, in a population highly exposed to NNRTIs. Otherwise high-degree of cross resistance to ETV was not common, suggesting that this drug could be helpful for patients failing to first generation NNRTIs.
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Methods: Samples from 474 patients were collected and processed according to the National Genotyping Network (RENAGENO), between 2006 and e 2009. Patient’s files (genotype exams) and medical records were used as data source. Number of TCD4 cells, HIV-1 viral load quantification, viral subtype and mutation profile assessment (TRUGENE HIV-1 Genotyping Test e ViroSeq System) were done according to the routine adopted by Central State Laboratory (LACEN). Resistance mutation profiles were identified using the Brazilian Algorithm and the Stanford Database Program. Cross resistance between NNRTIs: nevirapine, efavirenz and etravirine were analyzed. Descriptive and exploratory analyses were performed for socio-demographics variables and laboratory results (SPSS 15.0). Results: Samples from 126 adult patients were resistant to nevirapine (NVP) and efavirenz (EVF) Subtyping analysis showed a predominance of subtype B (86.1%), followed by BF1 recombinant (7.8%). Half of the patients received three or more antiretroviral therapy regimes. The most frequent mutations were 103N (72.2%) and 225H (22.2%). Mutations related to decreased etravirine (ETV) activity were detected in 8 codons: 98, 100, 101, 181, 188, 190 e 230 Intermediate ETV resistance were present in 27.0% and 15.1% of the samples, according to the Brazilian protocol and to Stanford Db Program, respectively. High-degree of ETV resistance were present in 10 samples (7.9%; IC95% 3.9-14.1), according to the Brazilian protocol Using the Stanford dB Program, 3 out of 126 patients (2.4%; IC95% 3.9-14.1) had high-degree of resistance. Clinical characteristics, number of T CD4 cells and viral load were not predictors to ETV resistance. Conclusions: The presence of at least one mutation potentially associated with decreased virological response to ETV was frequent, in a population highly exposed to NNRTIs. Otherwise high-degree of cross resistance to ETV was not common, suggesting that this drug could be helpful for patients failing to first generation NNRTIs.Objetivo: descrever e analisar os padrões de mutação do HIV-1 associados com a resistência aos inibidores da transcriptase reversa não análogos dos nucleosídeos (ITRNNs), em indivíduos com falha de resposta à terapia antirretroviral (ARV), atendidos no principal serviço público HIV/aids do Estado de Goiás. Métodos: População composta por 474 pacientes submetidos à genotipagem, de acordo com os critérios da Rede Nacional de Genotipagem, no período de 2006 a 2009.Utilizou-se como fonte de dados formulários do Sistema de Controle de Exames de Genotipagem e prontuários clínicos. A contagem de células TCD4, a quantificação da carga viral e o sequenciamento viral para caracterização do subtipo e do perfil de resistência genotípica do HIV-1 (TRUGENE HIV-1 Genotyping Test e ViroSeq System) foram coletados e processados de acordo com as rotinas do Laboratório Central (LACEN). O algoritmo Brasileiro e o Banco de Dados de Stanford foram utilizados para interpretação do perfil de resistência. Foi analisada resistência cruzada entre os ITRNNs: nevirapina, efavirenz e etravirina. Foi realizada análise descritiva e exploratória para variáveis sócias demográficas, clínicas e laboratoriais (SPSS 15.0). Resultados: Foram identificados 126 pacientes adultos, com resistência à nevirapina (NVP) e ao efavirenz (EVF). O subtipo B foi predominante (86,1%), seguido pelo recombinante BF1(7,8%). Metade dos pacientes recebeu três ou mais esquemas antirretrovirais, pré-genotipagem. A mutação K103N foi a mais frequente (72,2%), seguida da P225H (22,2%). Foram detectadas mutações em oito códons, potencialmente, associadas com perda de sensibilidade à etravirina (ETV): 98, 100, 101, 106, 181, 188, 190 e 230. Padrão de resistência intermediária foi evidenciado em 27,0% e 15,1% das amostras, de acordo com algoritmo brasileiro e com Stanford, respectivamente. Dez pacientes (7,9%; IC95% 3,9-14,1) apresentaram resistência à ETV pelo algoritmo brasileiro e três (2,4%; IC95% 0,5-6,8) apresentaram alta resistência a essa droga, de acordo com Stanford. Características clínicas, número de células TCD4 e carga viral não foram preditores de resistência à ETV. Conclusão: A detecção de pelo menos uma mutação associada à perda de sensibilidade para ETV foi frequente, em população exposta aos outros ITRNNs, por tempo variado. Em contrapartida, alto grau de resistência cruzada à ETV foi pouco comum, sugerindo que essa droga possa ser útil em pacientes que não responderam aos ITRNNs de primeira linha.Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2019-01-16T10:28:25Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Priscila Ribeiro Guimarães Pacheco - 2010.pdf: 1413719 bytes, checksum: 77957da8696e2e80ee136f949866b0bf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2019-01-16T11:09:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Priscila Ribeiro Guimarães Pacheco - 2010.pdf: 1413719 bytes, checksum: 77957da8696e2e80ee136f949866b0bf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)Made available in DSpace on 2019-01-16T11:09:26Z (GMT). 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