Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação
Ano de defesa: | 2016 |
---|---|
Autor(a) principal: | |
Orientador(a): | |
Banca de defesa: | |
Tipo de documento: | Tese |
Tipo de acesso: | Acesso aberto |
Idioma: | por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Lavras
Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas UFLA brasil Departamento de Biologia |
Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
País: |
Não Informado pela instituição
|
Palavras-chave em Português: | |
Link de acesso: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11849 |
Resumo: | Plant breeding provides several alternatives for obtaining superior cultivars. When the goal is to improve the performance of a population, the strategies used may involve the selection of either individuals or progenies. In this case, half-sib progenies are often preferred, especially for being easy to work with. In this context, we performed this study to evaluate, through computer simulation, strategies that help in the decision-making regarding to the number of progenies, repetitions and plants per plot to increase effectiveness in breeding programs that uses half-sib progenies. Experiments with half-sib progenies were simulated considering a trait controlled by 100 genes, varying the average degree of dominance (0 or 1), the mean allelic frequency of the population (0;2, 0;5 or 0;8) and heritability (0;1, 0;25 or 0;5). It was considered a breeding program with the ability to assess 6:000 plants in experiments with multiple plants or single plant plot. In the first case, we used N f progenies, with N f ranging between 60 and 600, in 2, 3, 4 or 5 repetitions with k plants/plot (5, 10 or 20). Recombination occurred with and without the use of remaining seeds, with selection within progenies only in the maternal side. In the case of one plant per plot, N f ranged between 12 and 600 progenies, with 500 and 10 repetitions, respectively. It was considered in this case, the selection among and within progenies in both sexes. The results of this study shows that increasing the number of repetitions over the number of plants per plot, provides larger genetic gain. The gains were, on average, higher in experiments with single plant plot. It also shows that it is possible to obtain similar genetic gain with different number of progenies. However, the results obtained with the use of fewer progeny shows large fluctuations and therefore greater risks. On other hand, the use of fewer plants per progeny, on average, result in lower gain. For the situations considered in this study, the use of about 100 progenies in 60 repetitions resulted in a better ratio between the magnitude of genetic gains and the accuracy of the estimates. |
id |
UFLA_19863ed8d933996efd88c4d7aa7bea22 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:localhost:1/11849 |
network_acronym_str |
UFLA |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFLA |
repository_id_str |
|
spelling |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulaçãoStrategies to improve selection efficiency in half sib progenies through simulationGenética quantitativaModelo computacionalPlantas – Melhoramento genéticoTeste de progênieQuantitative geneticsComputational modelsPlant breedingProgenies testGenética QuantitativaPlant breeding provides several alternatives for obtaining superior cultivars. When the goal is to improve the performance of a population, the strategies used may involve the selection of either individuals or progenies. In this case, half-sib progenies are often preferred, especially for being easy to work with. In this context, we performed this study to evaluate, through computer simulation, strategies that help in the decision-making regarding to the number of progenies, repetitions and plants per plot to increase effectiveness in breeding programs that uses half-sib progenies. Experiments with half-sib progenies were simulated considering a trait controlled by 100 genes, varying the average degree of dominance (0 or 1), the mean allelic frequency of the population (0;2, 0;5 or 0;8) and heritability (0;1, 0;25 or 0;5). It was considered a breeding program with the ability to assess 6:000 plants in experiments with multiple plants or single plant plot. In the first case, we used N f progenies, with N f ranging between 60 and 600, in 2, 3, 4 or 5 repetitions with k plants/plot (5, 10 or 20). Recombination occurred with and without the use of remaining seeds, with selection within progenies only in the maternal side. In the case of one plant per plot, N f ranged between 12 and 600 progenies, with 500 and 10 repetitions, respectively. It was considered in this case, the selection among and within progenies in both sexes. The results of this study shows that increasing the number of repetitions over the number of plants per plot, provides larger genetic gain. The gains were, on average, higher in experiments with single plant plot. It also shows that it is possible to obtain similar genetic gain with different number of progenies. However, the results obtained with the use of fewer progeny shows large fluctuations and therefore greater risks. On other hand, the use of fewer plants per progeny, on average, result in lower gain. For the situations considered in this study, the use of about 100 progenies in 60 repetitions resulted in a better ratio between the magnitude of genetic gains and the accuracy of the estimates.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)O melhoramento de plantas oferece várias alternativas para a obtenção de cultivares superiores. Quando o objetivo é melhorar o desempenho de uma população, as estratégias utilizadas podem envolver a seleção tanto de indivíduos quanto de progênies. Nesse caso, as progênies de meios-irmãos são, muitas vezes, preferidas, especialmente pela facilidade de condução. Do exposto, realizou-se este trabalho com o objetivo de avaliar, por meio de simulação computacional, estratégias que auxiliem a tomada de decisão com relação aos números de progênies, repetições e plantas por parcela que aumentam a eficiência de programas de melhoramento que utilizam progênies de meios-irmãos. Foram simulados experimentos com progênies de meios-irmãos, considerando um caráter controlado por 100 genes, variando o grau médio de dominância (0 ou 1), a frequência alélica média da população (0;2, 0;5 ou 0;8) e a herdabilidade (0;1, 0;25 ou 0;5). Considerou-se um programa com a capacidade de avaliar 6:000 plantas em experimentos com múltiplas plantas ou com uma planta por parcela. No primeiro caso, utilizou-se N f progênies, com N f variando entre 60 e 600, em 2, 3, 4 ou 5 repeticões, com k plantas/parcela (5, 10 ou 20). A recombinação aconteceu com e sem o uso de sementes remanescentes, sendo a seleção dentro apenas do lado materno. No caso de uma planta por parcela, N f variou entre 12 e 600 progênies, com 500 e 10 repetições, respectivamente. Considerou-se, neste caso, a seleção entre e dentro nos dois sexos. Os resultados obtidos neste estudo mostraram que o aumento do número de repetições em detrimento do aumento do número de plantas por parcela, proporciona maiores ganhos genéticos. Estes ganhos foram, em média, maiores em experimentos com uma planta por parcela. Evidenciou-se também que, é possível obter ganhos genéticos semelhantes com diferentes números de progênies. No entanto, os resultados obtidos com o uso de poucas progênies apresentam grandes oscilações e consequentemente maiores riscos. Por outro lado, o uso de poucas plantas por progênie resulta em ganhos, em média, inferiores. Para as situações consideradas neste estudo, o uso de aproximadamente 100 progênies em 60 repetições, resultou na melhor relação entre a magnitude dos ganhos genéticos e a precisão das estimativas obtidas.Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de PlantasUFLAbrasilDepartamento de BiologiaFerreira, Daniel FurtadoRamalho, Magno Antonio PattoGuimarães, Paulo Evaristo de OliveiraToledo, Fernando Hernique Ribeiro BarrozoGonçalves, Flávia Maria AvelarRamalho, Magno Antonio PattoFernandes, Samuel Bonfim2016-10-03T19:33:43Z2016-10-03T19:33:43Z2016-09-302016-09-16info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfFERNANDES, S. B. Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação. 2016. 68 p. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2016.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11849porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2016-10-03T19:33:43Zoai:localhost:1/11849Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2016-10-03T19:33:43Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação Strategies to improve selection efficiency in half sib progenies through simulation |
title |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação |
spellingShingle |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação Fernandes, Samuel Bonfim Genética quantitativa Modelo computacional Plantas – Melhoramento genético Teste de progênie Quantitative genetics Computational models Plant breeding Progenies test Genética Quantitativa |
title_short |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação |
title_full |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação |
title_fullStr |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação |
title_full_unstemmed |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação |
title_sort |
Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação |
author |
Fernandes, Samuel Bonfim |
author_facet |
Fernandes, Samuel Bonfim |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Ferreira, Daniel Furtado Ramalho, Magno Antonio Patto Guimarães, Paulo Evaristo de Oliveira Toledo, Fernando Hernique Ribeiro Barrozo Gonçalves, Flávia Maria Avelar Ramalho, Magno Antonio Patto |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Fernandes, Samuel Bonfim |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Genética quantitativa Modelo computacional Plantas – Melhoramento genético Teste de progênie Quantitative genetics Computational models Plant breeding Progenies test Genética Quantitativa |
topic |
Genética quantitativa Modelo computacional Plantas – Melhoramento genético Teste de progênie Quantitative genetics Computational models Plant breeding Progenies test Genética Quantitativa |
description |
Plant breeding provides several alternatives for obtaining superior cultivars. When the goal is to improve the performance of a population, the strategies used may involve the selection of either individuals or progenies. In this case, half-sib progenies are often preferred, especially for being easy to work with. In this context, we performed this study to evaluate, through computer simulation, strategies that help in the decision-making regarding to the number of progenies, repetitions and plants per plot to increase effectiveness in breeding programs that uses half-sib progenies. Experiments with half-sib progenies were simulated considering a trait controlled by 100 genes, varying the average degree of dominance (0 or 1), the mean allelic frequency of the population (0;2, 0;5 or 0;8) and heritability (0;1, 0;25 or 0;5). It was considered a breeding program with the ability to assess 6:000 plants in experiments with multiple plants or single plant plot. In the first case, we used N f progenies, with N f ranging between 60 and 600, in 2, 3, 4 or 5 repetitions with k plants/plot (5, 10 or 20). Recombination occurred with and without the use of remaining seeds, with selection within progenies only in the maternal side. In the case of one plant per plot, N f ranged between 12 and 600 progenies, with 500 and 10 repetitions, respectively. It was considered in this case, the selection among and within progenies in both sexes. The results of this study shows that increasing the number of repetitions over the number of plants per plot, provides larger genetic gain. The gains were, on average, higher in experiments with single plant plot. It also shows that it is possible to obtain similar genetic gain with different number of progenies. However, the results obtained with the use of fewer progeny shows large fluctuations and therefore greater risks. On other hand, the use of fewer plants per progeny, on average, result in lower gain. For the situations considered in this study, the use of about 100 progenies in 60 repetitions resulted in a better ratio between the magnitude of genetic gains and the accuracy of the estimates. |
publishDate |
2016 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2016-10-03T19:33:43Z 2016-10-03T19:33:43Z 2016-09-30 2016-09-16 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
FERNANDES, S. B. Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação. 2016. 68 p. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2016. http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11849 |
identifier_str_mv |
FERNANDES, S. B. Estratégias para melhorar a eficiencia da seleção em progênies de meios irmãos por meio de simulação. 2016. 68 p. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2016. |
url |
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11849 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Lavras Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas UFLA brasil Departamento de Biologia |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Lavras Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas UFLA brasil Departamento de Biologia |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFLA instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA) instacron:UFLA |
instname_str |
Universidade Federal de Lavras (UFLA) |
instacron_str |
UFLA |
institution |
UFLA |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFLA |
collection |
Repositório Institucional da UFLA |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA) |
repository.mail.fl_str_mv |
nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br |
_version_ |
1784549829391679488 |