Análise do microbioma vaginal bovino por técnicas dependentes e independentes de cultivo

• Ano de defesa: 2015
• Autor(a) principal: Mateus Laguardia Nascimento
• Orientador(a): Edel Figueiredo Barbosa
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Minas Gerais
• Palavras-chave em Português: Metagenômica; Bovino; Microbiota; Probiótico; Trato vaginal
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/1843/BUBD-A58HG3

O Brasil possui o maior rebanho comercial do mundo, e o segundo em número de cabeças, sendo a atividade agropecuária uma importante parte da economia no país. Até hoje os estudos envolvendo a microbiota dos bovinos, utilizando técnicas dependentes ou independentes de cultivo, tiveram como principal alvo o trato gastrointestinal, sendo o trato geniturinário pouco conhecido neste aspecto, apesar de sua importância. Este estudo teve como objetivo a caracterização da microbiota do trato vaginal de novilhas e vacas da raça Nelore, prenhes e vazias, utilizando métodos dependentes e independentes de cultivo e a seleção de potenciais probióticos para o tratamento de infecções geniturinárias. Os resultados provenientes das técnicas independentes de cultivo mostraram uma grande diversidade de bactérias e baixa diversidade de arqueias e fungos. Os filos bacterianos dominantes foram Firmicutes (~40 a 50%), Bacteroidetes (~15 a 25%) e Proteobacteria (~5 a 25%), além de um total de ~10 a 20% de bactérias não classificadas. Quanto aos gêneros, observou-se uma grande diversidade de microrganismos dominantes, sendo as dez OTUs mais abundantes (~45 a 55%): Aeribacillus, Bacteroides, Clostridium, Ruminococcus, Rikenella, Alistipes, Bacillus, Eubacterium, Prevotella e bactérias não classificadas. Dentre as arqueias, houve um grande predomínio do gênero Methanobrevibacter (Euryachaeota, ~55 a 70%). Os ascomicetos foram a maioria dentre os fungos (~80 a 95%), com grande destaque para o gênero Mycosphaerella (~70 a 85%). Estes dados indicam uma grande influência da microbiota do trato gastrointestinal na colonização do trato vaginal, o que já foi relatado para outras espécies animais e pode ser explicado pela proximidade entre os dois tratos. A influência hormonal não foi clara, mas foi possível detectar uma tendência de redução do número total de bactérias nos animais prenhes e um aumento de arqueias. Os eucariotos não variaram de forma significativa entre animais prenhes e vazios, mas houve uma tendência das vacas apresentarem maior abundância destes organismos que as novilhas. Foram isolados 69 clones bacterianos das amostras cultivadas, sendo a grande maioria (60) pertencente ao gênero Escherichia. Os testes de antagonismo, co-agregação, hidrofobicidade e produção de peróxido de hidrogênio realizados com 11 desses isolados apontaram três deles com elevado potencial probiótico, e mais quatro com potencial mediano. Em relação à abundância dos cultiváveis, houve uma clara influência do estado hormonal e da idade dos animais no isolamento, sendo observada maior abundância em animais prenhes (em relação aos vazios) e em vacas (em relação às novilhas). Os resultados aqui descritos evidenciam uma grande variabilidade na microbiota do trato vaginal entre os animais e grupos testados, e uma grande diferença entre os achados dependentes e independentes de cultivo, pontuando a necessidade de maiores estudos neste trato. A colonização do trato vaginal parece ser influenciada pelo trato gastrointestinal.