Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Silva, Alfredo de Araújo
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal da Paraíba
Brasil
Biologia Celular e Molecular
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
UFPB
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Carcinogênese
Carcinoma basocelular
Single nucleotide polymorphisms - SNP
Genotipagem
Epidemiologia
Carcinogenesis
Basal cell carcinoma
Genotyping
Epidemiology
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
Link de acesso: https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/28833
Resumo: Basal cell carcinoma (BCC) is one of the most common types of skin tumors that originate from epithelial basal cells that have lost their ability to differentiate and normalize keratinization. SNPs (Single nucleotide polymorphisms) occur frequently in the population and these variations in the genome can be studied with a predisposition to susceptibility to diseases, including cancer. This study aimed to genotype the BRAF gene rs113488022 SNP in BCC samples and determine the association of these SNPs with susceptibility to skin cancer development. 150 samples of paraffin tissue from patients in the State of Paraíba with a histopathological diagnosis of BCC were analyzed, totaling 300 alleles of each polymorphism. The modified allele-specific PCR method was the technique used for the genotyping of the samples. The Biostat software version 5.3 was used to analyze the genotypic frequencies. A p-value < 0.05 was established according to the Hardy-Weinberg equilibrium with an application of the chi-square test. Our results suggest that the SNP rs113488022 is not in Hardy-Weinberg equilibrium, it is showed a significant association with the BCC in the analyzed samples (X²=16.167 and P <0.003 ). The results suggest that the SNP rs113488022 has the potential as a molecular biomarker for susceptibility to basal cell carcinoma in the population of Paraíba.
id UFPB_a3506d49ff804d2e76e6d743b3ce1b42
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpb.br:123456789/28833
network_acronym_str UFPB
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
repository_id_str
spelling Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da ParaíbaCarcinogêneseCarcinoma basocelularSingle nucleotide polymorphisms - SNPGenotipagemEpidemiologiaCarcinogenesisBasal cell carcinomaGenotypingEpidemiologyCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALBasal cell carcinoma (BCC) is one of the most common types of skin tumors that originate from epithelial basal cells that have lost their ability to differentiate and normalize keratinization. SNPs (Single nucleotide polymorphisms) occur frequently in the population and these variations in the genome can be studied with a predisposition to susceptibility to diseases, including cancer. This study aimed to genotype the BRAF gene rs113488022 SNP in BCC samples and determine the association of these SNPs with susceptibility to skin cancer development. 150 samples of paraffin tissue from patients in the State of Paraíba with a histopathological diagnosis of BCC were analyzed, totaling 300 alleles of each polymorphism. The modified allele-specific PCR method was the technique used for the genotyping of the samples. The Biostat software version 5.3 was used to analyze the genotypic frequencies. A p-value < 0.05 was established according to the Hardy-Weinberg equilibrium with an application of the chi-square test. Our results suggest that the SNP rs113488022 is not in Hardy-Weinberg equilibrium, it is showed a significant association with the BCC in the analyzed samples (X²=16.167 and P <0.003 ). The results suggest that the SNP rs113488022 has the potential as a molecular biomarker for susceptibility to basal cell carcinoma in the population of Paraíba.NenhumaO Carcinoma basocelular (CBC) é um tipo de tumor de pele mais frequente de origem de células basais epiteliais com perda de sua capacidade de diferenciação e queratinização normais. Os SNPs (Single nucleotide polymorphisms) são frequentes na população e apresentam variações no genoma que podem ser utilizadas como alvos de estudo para predisposição à susceptibilidade a doenças, incluindo o câncer. O objetivo deste estudo foi realizar a genotipagem do SNP rs113488022 do gene BRAF em amostras de CBC e determinar a associação desses SNP com a susceptibilidade ao desenvolvimento do câncer de pele. Foram analisadas 150 amostras de tecido parafinado de pacientes do estado da Paraíba com diagnóstico histopatológico de CBC, totalizando 300 alelos de cada polimorfismo. O método PCR alelo específico modificado foi a técnica utilizada para a genotipagem das amostras. O software BioEstat versão 5.3 foi utilizada para análises das frequências genotípicas. Foram estabelecidas segundo o equilíbrio de Hardy-Weinberg com aplicação do teste Qui-quadrado um p-valor < 0,05. Nossos resultados sugerem, que o SNP rs113488022 não está em equilíbrio de Hardy-Weinberg, portanto, apresentou associação significativa com o CBC nas amostras analisadas (X²=16,167 e P <0,003). Os resultados sugerem que o SNP rs113488022 tem potencial de biomarcador molecular para susceptibilidade ao Carcinoma basocelular na população Paraibana.Universidade Federal da ParaíbaBrasilBiologia Celular e MolecularPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularUFPBSoares, Leonardo Ferreirahttp://lattes.cnpq.br/9139785950005568Silva, Alfredo de Araújo2023-10-24T10:53:46Z2023-02-102023-10-24T10:53:46Z2022-12-05info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttps://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/28833porAttribution-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPBinstname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB)instacron:UFPB2023-10-25T06:05:50Zoai:repositorio.ufpb.br:123456789/28833Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://repositorio.ufpb.br/PUBhttp://tede.biblioteca.ufpb.br:8080/oai/requestdiretoria@ufpb.br|| diretoria@ufpb.bropendoar:2023-10-25T06:05:50Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB)false
dc.title.none.fl_str_mv Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
title Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
spellingShingle Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
Silva, Alfredo de Araújo
Carcinogênese
Carcinoma basocelular
Single nucleotide polymorphisms - SNP
Genotipagem
Epidemiologia
Carcinogenesis
Basal cell carcinoma
Genotyping
Epidemiology
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
title_short Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
title_full Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
title_fullStr Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
title_full_unstemmed Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
title_sort Associação do SNP rs113488022 do gene BRAF na susceptibilidade do carcinoma basocelular utilizando o método PCR alelo específico estendido em amostras de pacientes da Paraíba
author Silva, Alfredo de Araújo
author_facet Silva, Alfredo de Araújo
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Soares, Leonardo Ferreira
http://lattes.cnpq.br/9139785950005568
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Alfredo de Araújo
dc.subject.por.fl_str_mv Carcinogênese
Carcinoma basocelular
Single nucleotide polymorphisms - SNP
Genotipagem
Epidemiologia
Carcinogenesis
Basal cell carcinoma
Genotyping
Epidemiology
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
topic Carcinogênese
Carcinoma basocelular
Single nucleotide polymorphisms - SNP
Genotipagem
Epidemiologia
Carcinogenesis
Basal cell carcinoma
Genotyping
Epidemiology
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
description Basal cell carcinoma (BCC) is one of the most common types of skin tumors that originate from epithelial basal cells that have lost their ability to differentiate and normalize keratinization. SNPs (Single nucleotide polymorphisms) occur frequently in the population and these variations in the genome can be studied with a predisposition to susceptibility to diseases, including cancer. This study aimed to genotype the BRAF gene rs113488022 SNP in BCC samples and determine the association of these SNPs with susceptibility to skin cancer development. 150 samples of paraffin tissue from patients in the State of Paraíba with a histopathological diagnosis of BCC were analyzed, totaling 300 alleles of each polymorphism. The modified allele-specific PCR method was the technique used for the genotyping of the samples. The Biostat software version 5.3 was used to analyze the genotypic frequencies. A p-value < 0.05 was established according to the Hardy-Weinberg equilibrium with an application of the chi-square test. Our results suggest that the SNP rs113488022 is not in Hardy-Weinberg equilibrium, it is showed a significant association with the BCC in the analyzed samples (X²=16.167 and P <0.003 ). The results suggest that the SNP rs113488022 has the potential as a molecular biomarker for susceptibility to basal cell carcinoma in the population of Paraíba.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-12-05
2023-10-24T10:53:46Z
2023-02-10
2023-10-24T10:53:46Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/28833
url https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/28833
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal da Paraíba
Brasil
Biologia Celular e Molecular
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
UFPB
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal da Paraíba
Brasil
Biologia Celular e Molecular
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
UFPB
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
instname:Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
instacron:UFPB
instname_str Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
instacron_str UFPB
institution UFPB
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFPB - Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
repository.mail.fl_str_mv diretoria@ufpb.br|| diretoria@ufpb.br
_version_ 1798964196262543360

Registros relacionados