Caracterização fenotípica e genotípica de animais da raça Hereford criados na região sul do estado do Rio Grande do Sul durante surtos de Ceratoconjuntivite Infecciosa Bovina

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: Comin, Helena Brocardo
• Orientador(a): Cardoso, Fernando Flores
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Pelotas
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Zootecnia
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: Zootecnia; Bovinos de corte
• Área do conhecimento CNPq: CIENCIAS AGRARIAS
• Link de acesso: http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/10422

Esta dissertação foi dividida em quatro capítulos, tendo como principais objetivos: i) realizar a identificação bacteriológica dos agentes envolvidos na Ceratoconjuntivite Infecciosa Bovina (CIB), por meio de diferentes técnicas: análise morfo-tintorial e bioquímica, Espectrometria de massas com fonte de ionização e dessorção a laser assistida por matriz e analisador de massas do tipo tempo-de-voo (MALDI-TOF), Reação em cadeia da polimerase (PCR) e sequenciamento. ii) avaliar a diversidade genética de bactérias das espécies Moraxella bovis e Moraxella bovoculi isoladas de surtos de CIB entre 2015 e 2017, utilizando as técnicas de ERIC-PCR (enterobacterial repetitive intergenic consensus), RAPD-PCR (random amplification of polymorphic DNA) e uma variação do RAPD-PCR com os primers JWP1 e JWOPA07. iii) estimar os parâmetros e valores genéticos por meio da avaliação tradicional pelo modelo animal para a incidência de CIB. iv) realizar estudo de associação ampla do genoma (GWAS) para identificação de regiões genômicas e SNPs mais representativos para susceptibilidade à CIB. Logo no início do surto de CIB amostras de secreções oculares e nasais foram coletadas de bovinos da raça Hereford para possibilitar a identificação do agente bacteriológico causador da enfermidade, com isso confirmar o surto de CIB. Os animais eram provenientes de cinco fazendas, criados no sul do estado do Rio Grande do Sul. Foram realizadas quatro avaliações, com intervalo médio de 30 dias. O monitoramento teve como finalidade a realização da fenotipagem com relação à susceptibilidade à doença, por meio do acompanhamento da evolução dos surtos de CIB nas propriedades, a partir da atribuição de escores de lesão ocular. Foram atribuídos escores para as lesões de CIB, para cada um dos olhos, em uma escala de zero a quatro, na qual zero indicava o olho normal e quatro o estágio mais avançado da doença, implicando em perda ocular. As melhores concordâncias obtidas entre os métodos de identificação bacteriológica estudada foram à identificação por MALDI-TOF e a identificação molecular (PCR), confirmadas por sequenciamento, a partir do DNA extraído das colônias de Moraxella spp. Ademais, foi confirmada a existência de variabilidade genética entre as cepas de Moraxella bovis e Moraxella bovoculi isoladas de bovinos da raça Hereford, acometidos por CIB, pertencentes a cinco diferentes municípios situados no estado do Rio Grande do Sul. Os coeficientes de herdabilidade preditos foram de 0,14, 0,096 e 0,099 para as categorias (c_2, c_3 e c_9) para incidência a CIB. Os estudos de GWAS apontaram janelas genômicas significativas nos cromossomos 3, 11, 14, 18, 26 e 27 associados à CIB. As análises de enriquecimento funcional revelaram oito termos significativos (p<0,05) associados com a susceptibilidade a CIB: Babesia, Plasmodium vivax, Babesiosis, Bood bactericidal activity, Retinal cone photorecptor cells, Animal nutritional physiological phenomena, COS cells e 5 Flanking region. Os termos MeSH, apontam para importantes processos biológicos que estão relacionados com a expressão fenotípica das lesões ocorridas pela CIB. Concluindo, as análises fenotípicas e genômicas realizada ao longo deste estudo podem auxiliar na concepção de estratégias de prevenção e tratamento contra o CIB, podendo colaborar com estratégias de seleção por animais resistentes a CIB.