Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2005
Autor(a) principal: Rocha, Kliger Kissinger Fernandes
Orientador(a): Gonçalves, Luiz Marcos Garcia
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica
Departamento: Automação e Sistemas; Engenharia de Computação; Telecomunicações
País: BR
Palavras-chave em Português:
PCR
Palavras-chave em Inglês:
PCR
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/15442
Resumo: It proposes a established computational solution in the development of a software to construct species-specific primers, used to improve the diagnosis of virus of plant for PCR. Primers are indispensable to PCR reaction, besides providing the specificity of the diagnosis. Primer is a synthetic, short, single stranded piece of DNA, used as a starter in PCR technique. It flanks the sequence desired to amplify. Species-specific primers indicate the well known region of beginning and ending where the polymerase enzyme is going to amplify on a certain species, i.e. it is specific for only a species. Thus, the main objective of this work is to automatize the process of choice of primers, optimizing the specificity of chosen primers by the traditional method
id UFRN_50caeebdaaab33393f7b7211c64caac5
oai_identifier_str oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/15442
network_acronym_str UFRN
network_name_str Repositório Institucional da UFRN
repository_id_str
spelling Rocha, Kliger Kissinger Fernandeshttp://lattes.cnpq.br/1552785998852736http://lattes.cnpq.br/1562357566810393Lúcio, Paulo Sérgio MarinhoCosta, José Alfredo Ferreirahttp://lattes.cnpq.br/9745845064013172Gonçalves, Luiz Marcos Garcia2014-12-17T14:56:06Z2006-12-212014-12-17T14:56:06Z2005-04-04ROCHA, Kliger Kissinger Fernandes. Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos. 2005. 73 f. Dissertação (Mestrado em Automação e Sistemas; Engenharia de Computação; Telecomunicações) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2005.https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/15442It proposes a established computational solution in the development of a software to construct species-specific primers, used to improve the diagnosis of virus of plant for PCR. Primers are indispensable to PCR reaction, besides providing the specificity of the diagnosis. Primer is a synthetic, short, single stranded piece of DNA, used as a starter in PCR technique. It flanks the sequence desired to amplify. Species-specific primers indicate the well known region of beginning and ending where the polymerase enzyme is going to amplify on a certain species, i.e. it is specific for only a species. Thus, the main objective of this work is to automatize the process of choice of primers, optimizing the specificity of chosen primers by the traditional methodPropõe-se uma solução computacional baseada no desenvolvimento de um software para construir primers espécie-específicos, usados para melhorar o diagnóstico de viroses de planta por PCR. Primers são indispensáveis à reação PCR, além de proporcionar a especificidade do diagnóstico. Um primer é um fragmento de DNA sintético, curto e de fita simples, utilizado como um iniciador na técnica PCR que flanqueia a seqüência que se deseja amplificar. Primers espécie-específicos são primers que só indicam a região bem conhecida de início e término onde a enzima polimerase vai amplificar, de uma determinada espécie, ou seja, é específica para somente uma espécie. Assim, o objetivo principal deste trabalho é automatizar o processo de escolha de primers, otimizando a especificidade dos primers escolhidos pelo método tradicionalCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal do Rio Grande do NortePrograma de Pós-Graduação em Engenharia ElétricaUFRNBRAutomação e Sistemas; Engenharia de Computação; TelecomunicaçõesDesign de PrimerPCRBioinformáticaPrimer DesignPCRBioinformaticsCNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA ELETRICAUm sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALKligerKFR.pdfapplication/pdf1442515https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/15442/1/KligerKFR.pdfb8c82b51681c5740727addb5f0eed20aMD51TEXTKligerKFR.pdf.txtKligerKFR.pdf.txtExtracted texttext/plain95488https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/15442/6/KligerKFR.pdf.txt7581ef3eb003773d45576640931436d1MD56THUMBNAILKligerKFR.pdf.jpgKligerKFR.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3796https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/15442/7/KligerKFR.pdf.jpg96f4c6f25d8fe019d9cc470b295229ffMD57123456789/154422017-10-31 15:28:52.644oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/15442Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2017-10-31T18:28:52Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
dc.title.por.fl_str_mv Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
title Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
spellingShingle Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
Rocha, Kliger Kissinger Fernandes
Design de Primer
PCR
Bioinformática
Primer Design
PCR
Bioinformatics
CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA ELETRICA
title_short Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
title_full Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
title_fullStr Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
title_full_unstemmed Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
title_sort Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos
author Rocha, Kliger Kissinger Fernandes
author_facet Rocha, Kliger Kissinger Fernandes
author_role author
dc.contributor.authorID.por.fl_str_mv
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1552785998852736
dc.contributor.advisorID.por.fl_str_mv
dc.contributor.advisorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1562357566810393
dc.contributor.advisor-co1ID.por.fl_str_mv
dc.contributor.referees1.pt_BR.fl_str_mv Costa, José Alfredo Ferreira
dc.contributor.referees1ID.por.fl_str_mv
dc.contributor.referees1Lattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9745845064013172
dc.contributor.author.fl_str_mv Rocha, Kliger Kissinger Fernandes
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Lúcio, Paulo Sérgio Marinho
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Gonçalves, Luiz Marcos Garcia
contributor_str_mv Lúcio, Paulo Sérgio Marinho
Gonçalves, Luiz Marcos Garcia
dc.subject.por.fl_str_mv Design de Primer
PCR
Bioinformática
topic Design de Primer
PCR
Bioinformática
Primer Design
PCR
Bioinformatics
CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA ELETRICA
dc.subject.eng.fl_str_mv Primer Design
PCR
Bioinformatics
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA ELETRICA
description It proposes a established computational solution in the development of a software to construct species-specific primers, used to improve the diagnosis of virus of plant for PCR. Primers are indispensable to PCR reaction, besides providing the specificity of the diagnosis. Primer is a synthetic, short, single stranded piece of DNA, used as a starter in PCR technique. It flanks the sequence desired to amplify. Species-specific primers indicate the well known region of beginning and ending where the polymerase enzyme is going to amplify on a certain species, i.e. it is specific for only a species. Thus, the main objective of this work is to automatize the process of choice of primers, optimizing the specificity of chosen primers by the traditional method
publishDate 2005
dc.date.issued.fl_str_mv 2005-04-04
dc.date.available.fl_str_mv 2006-12-21
2014-12-17T14:56:06Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2014-12-17T14:56:06Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv ROCHA, Kliger Kissinger Fernandes. Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos. 2005. 73 f. Dissertação (Mestrado em Automação e Sistemas; Engenharia de Computação; Telecomunicações) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2005.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/15442
identifier_str_mv ROCHA, Kliger Kissinger Fernandes. Um sistema computacional para diagnosticar viroses de plantas usando a técnica de PCR com construção de primers espécie-específicos. 2005. 73 f. Dissertação (Mestrado em Automação e Sistemas; Engenharia de Computação; Telecomunicações) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2005.
url https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/15442
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRN
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Automação e Sistemas; Engenharia de Computação; Telecomunicações
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRN
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron:UFRN
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron_str UFRN
institution UFRN
reponame_str Repositório Institucional da UFRN
collection Repositório Institucional da UFRN
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/15442/1/KligerKFR.pdf
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/15442/6/KligerKFR.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/15442/7/KligerKFR.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv b8c82b51681c5740727addb5f0eed20a
7581ef3eb003773d45576640931436d1
96f4c6f25d8fe019d9cc470b295229ff
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1797777625893044224