Identificação polifásica e detecção simultânea por PCR Multiplex de patógenos presentes em tambaqui (Colossoma Macropomum) oriundo de diferentes sistemas de manejo

• Ano de defesa: 2022
• Autor(a) principal: Souza, Roseane Veras de
• Orientador(a): Santos, Claudia C. Auler do A.
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal do Tocantins; Palmas
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Alimentos - PPGCTA
• País: BR
• Palavras-chave em Português: Peixe nativo; Amazônia; patógenos; identificação polifásica; mPCR; Native fish; Amazon; pathogens; polyphasic identification
• Área do conhecimento CNPq: CNPQ::ENGENHARIAS
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11612/3804

A Região Amazônica se destaca na piscicultura com a produção de espécies nativas, em especial o tambaqui (Colossoma macropomum), espécie nativa de maior produção brasileira. Métodos rápidos e precisos de detecção de patógenos em pescado podem auxiliar no controle de qualidade microbiológica, promovendo a segurança alimentar e o desempenho da piscicultura no país. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi identificar os isolados bacterianos de tambaqui obtido de dois diferentes sistemas de manejo, utilizando análise polifásica. Ademais, adaptou-se um método multiplex de Reação em Cadeia da Polimerase para detecção simultânea das espécies Escherichia coli, Salmonella spp. e Staphylococcus aureus nas amostras de musculatura do pescado. Primeiramente, 470 isolados (181 de tanque-rede e 289 de viveiro escavado) provenientes de amostras de swab de pele, musculatura e água de cultivo de tambaqui foram caracterizados morfologicamente e bioquimicamente, agrupados de acordo com suas características fenotípicas. Dentre os isolados, 85 foram caracterizados e agrupados em 12 grupos distintos: cinco grupos pertencentes ao gênero Salmonella spp., dois grupos de Escherichia spp, dois de Staphylococcus spp. e três grupos característicos da família Enterobacteriaceae. De cada grupo, isolados representativos foram confirmados pelo sequenciamento da região 16S-23S rRNA, como pertencentes as espécies Salmonella tiphymurium, E. coli, S. aureus, Enterobacter cloacae, Enterobacter asburie e Pseudomonas aeruginosa, com similaridade entre 77-100%. O DNA de 30 amostras de musculatura de tambaqui de ambos os sistemas de manejo foi extraído e submetido a PCR multiplex, utilizando os primers específicos dos genes phoA, invA e nuc para detecção dos patógenos E. coli, Salmonella spp. e S. aureus, respectivamente, de forma simultânea em uma única reação. Na reação, Salmonella spp. foi detectada em cinco amostras, duas de tanque-rede e três de viveiro escavado. E. coli foi detectada em duas amostras de viveiro escavado. S. aureus não foi detectado em nenhuma das amostras. Os resultados obtidos na identificação polifásica dos isolados e na análise de PCR multiplex das amostras de musculatura do pescado, correlacionaram-se, portanto, a metodologia proposta tem potencial para ser utilizada como um método eficaz de detecção simultânea de patógenos, podendo impactar positivamente a cadeia produtiva de pescado nativo, e fornecer de forma rápida e eficiente informações sobre a qualidade microbiológica do mesmo.