Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2012
Autor(a) principal: Rodrigues, Daniele Tôrres
Orientador(a): Carneiro, Antônio Policarpo Souza lattes
Banca de defesa: Souza, Gustavo Henrique de lattes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
Programa de Pós-Graduação: Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria
Departamento: Estatística Aplicada e Biometria
País: BR
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047
Resumo: A basic issue in animal genetic improvement is if the selection of animals practiced in a given environment results in genetic progress in other environment. The presence of genotype environment interaction (GEI) is characterized by different response of genotypes to environmental variations, which can cause change in the classification of the genotypes in different environments. Among the ways to evaluate the GEI, models of reaction norms (MRN) have been distinguished themselves worldwide today. The GEI is a linear covariance function that lets you assign to each animal, two random regression coefficients (intercept and slope) that predict the genetic value depending on the environment. Thus, each animal has a genetic value for each environment. This study aims to verify the presence of GEI for weaning weight in Nelore Mocho created in different regions of Brazilian northeast, using the model of reaction norms. It was adjusted two models of norms of reaction to the data, MRN in two steps and MRN in one step. The first uses a model without considering the genotype environment interaction to obtain estimates of the environment effects and then uses them as a known covariate in a random regression model. The second, under the Bayesian approach estimates all parameters jointly. The analyzes were conducted using software SAS, R, AMC and Intergen. Based on two of the three criteria used for choosing the model the was the MRN in one step. Through this model it was possible to verify the presence of genotype environment interaction and to estimate the genetic value of animals for weaning weight in each producing region in the Northeast. Thus, it is possible to recommend the most appropriate sires for each environment studied, taking advantage of the GEI effects.
id UFV_0192308aeb4f8976c7cfbb2407ce59e5
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/4047
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str
spelling Rodrigues, Daniele Tôrreshttp://lattes.cnpq.br/4682555268827167Resende, Marcos Deon Vilela dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4709374E4Silva, Fabyano Fonseca ehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2Carneiro, Antônio Policarpo Souzahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8Souza, Gustavo Henrique dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P62015-03-26T13:32:13Z2012-11-142015-03-26T13:32:13Z2012-02-17RODRIGUES, Daniele Tôrres. Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms. 2012. 86 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012.http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047A basic issue in animal genetic improvement is if the selection of animals practiced in a given environment results in genetic progress in other environment. The presence of genotype environment interaction (GEI) is characterized by different response of genotypes to environmental variations, which can cause change in the classification of the genotypes in different environments. Among the ways to evaluate the GEI, models of reaction norms (MRN) have been distinguished themselves worldwide today. The GEI is a linear covariance function that lets you assign to each animal, two random regression coefficients (intercept and slope) that predict the genetic value depending on the environment. Thus, each animal has a genetic value for each environment. This study aims to verify the presence of GEI for weaning weight in Nelore Mocho created in different regions of Brazilian northeast, using the model of reaction norms. It was adjusted two models of norms of reaction to the data, MRN in two steps and MRN in one step. The first uses a model without considering the genotype environment interaction to obtain estimates of the environment effects and then uses them as a known covariate in a random regression model. The second, under the Bayesian approach estimates all parameters jointly. The analyzes were conducted using software SAS, R, AMC and Intergen. Based on two of the three criteria used for choosing the model the was the MRN in one step. Through this model it was possible to verify the presence of genotype environment interaction and to estimate the genetic value of animals for weaning weight in each producing region in the Northeast. Thus, it is possible to recommend the most appropriate sires for each environment studied, taking advantage of the GEI effects.Uma questão básica no melhoramento genético animal é se a seleção dos animais praticada em um determinado ambiente resulta em progresso genético em outro tipo de ambiente. A presença de interação genótipos ambientes (IGA) é caracterizada pela resposta diferenciada dos genótipos às variações ambientais, o que pode ocasionar alteração na classificação dos genótipos nos diferentes ambientes. Dentre as formas de se avaliar a IGA, os modelos de norma de reação (MNR) têm se destacado, atualmente, em todo o mundo. O MNR linear é uma função de covariância que permite atribuir a cada animal, dois coeficientes de regressão aleatórios (intercepto e inclinação) que predizem o valor genético em função do ambiente. Assim, cada animal terá um valor genético predito para cada ambiente. Este estudo tem o objetivo de verificar a presença de IGA para peso à desmama em bovinos da raça Nelore Mocho criados em diferentes regiões produtoras no Nordeste do Brasil, utilizando o modelo de normas de reação. Ajustou-se dois modelos de normas de reação aos dados, MNR em dois passos e o MNR em um passo. O primeiro utiliza um modelo sem considerar a interação genótipos ambientes para obter estimativas dos efeitos de ambiente e em seguida as utiliza como uma covariável conhecida em um modelo de regressão aleatória e o segundo, sob o enfoque Bayesiano, estima todos os parâmetros simultaneamente. As análises foram realizadas por meio dos softwares SAS, R, AMC e Intergen. Com base em dois dos três critérios utilizados para escolha do modelo, o que melhor se ajustou aos dados foi o MNR em um passo. Por meio deste modelo foi possível verificar a presença de interação genótipos ambientes e estimar o valor genético dos animais para cada região produtora do Nordeste, para a característica peso à desmama. Assim, é possível recomendar os reprodutores mais apropriados para cada ambiente estudado, capitalizando os efeitos da IGA.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaMestrado em Estatística Aplicada e BiometriaUFVBREstatística Aplicada e BiometriaMelhoramento genéticoNelore MochoInferência BayesianaBreedingNelore MochoBayesian InferenceCNPQ::CIENCIAS AGRARIASInteração genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reaçãoGenotype environment interaction in animals by models of reaction normsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf3841900https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/1/texto%20completo.pdf0cacdbb43213a6d667c6941e828f2c74MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain94013https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/2/texto%20completo.pdf.txt07cf04c7ae9360aa8759f5f5e5caeb6dMD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3725https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/3/texto%20completo.pdf.jpgd3db750af5f7154d5d90e3891f2ab2d4MD53123456789/40472016-04-09 23:17:20.11oai:locus.ufv.br:123456789/4047Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-10T02:17:20LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.por.fl_str_mv Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms
title Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
spellingShingle Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
Rodrigues, Daniele Tôrres
Melhoramento genético
Nelore Mocho
Inferência Bayesiana
Breeding
Nelore Mocho
Bayesian Inference
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
title_short Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
title_full Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
title_fullStr Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
title_full_unstemmed Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
title_sort Interação genótipos ambientes em animais via modelos de normas de reação
author Rodrigues, Daniele Tôrres
author_facet Rodrigues, Daniele Tôrres
author_role author
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4682555268827167
dc.contributor.author.fl_str_mv Rodrigues, Daniele Tôrres
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Resende, Marcos Deon Vilela de
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4709374E4
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv Silva, Fabyano Fonseca e
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Carneiro, Antônio Policarpo Souza
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Souza, Gustavo Henrique de
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P6
contributor_str_mv Resende, Marcos Deon Vilela de
Silva, Fabyano Fonseca e
Carneiro, Antônio Policarpo Souza
Souza, Gustavo Henrique de
dc.subject.por.fl_str_mv Melhoramento genético
Nelore Mocho
Inferência Bayesiana
topic Melhoramento genético
Nelore Mocho
Inferência Bayesiana
Breeding
Nelore Mocho
Bayesian Inference
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
dc.subject.eng.fl_str_mv Breeding
Nelore Mocho
Bayesian Inference
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
description A basic issue in animal genetic improvement is if the selection of animals practiced in a given environment results in genetic progress in other environment. The presence of genotype environment interaction (GEI) is characterized by different response of genotypes to environmental variations, which can cause change in the classification of the genotypes in different environments. Among the ways to evaluate the GEI, models of reaction norms (MRN) have been distinguished themselves worldwide today. The GEI is a linear covariance function that lets you assign to each animal, two random regression coefficients (intercept and slope) that predict the genetic value depending on the environment. Thus, each animal has a genetic value for each environment. This study aims to verify the presence of GEI for weaning weight in Nelore Mocho created in different regions of Brazilian northeast, using the model of reaction norms. It was adjusted two models of norms of reaction to the data, MRN in two steps and MRN in one step. The first uses a model without considering the genotype environment interaction to obtain estimates of the environment effects and then uses them as a known covariate in a random regression model. The second, under the Bayesian approach estimates all parameters jointly. The analyzes were conducted using software SAS, R, AMC and Intergen. Based on two of the three criteria used for choosing the model the was the MRN in one step. Through this model it was possible to verify the presence of genotype environment interaction and to estimate the genetic value of animals for weaning weight in each producing region in the Northeast. Thus, it is possible to recommend the most appropriate sires for each environment studied, taking advantage of the GEI effects.
publishDate 2012
dc.date.available.fl_str_mv 2012-11-14
2015-03-26T13:32:13Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2012-02-17
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-26T13:32:13Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv RODRIGUES, Daniele Tôrres. Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms. 2012. 86 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047
identifier_str_mv RODRIGUES, Daniele Tôrres. Genotype environment interaction in animals by models of reaction norms. 2012. 86 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/4047
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFV
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Estatística Aplicada e Biometria
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/2/texto%20completo.pdf.txt
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4047/3/texto%20completo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 0cacdbb43213a6d667c6941e828f2c74
07cf04c7ae9360aa8759f5f5e5caeb6d
d3db750af5f7154d5d90e3891f2ab2d4
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1794528655632760832