Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2010
Autor(a) principal: Paixão, Débora Martins
Orientador(a): Guimarães, Simone Eliza Facioni lattes
Banca de defesa: Silva, Fabyano Fonseca e lattes, Brommonschenkel, Sérgio Hermínio lattes
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
Programa de Pós-Graduação: Doutorado em Zootecnia
Departamento: Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul
País: BR
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Pig
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758
Resumo: The accomplishment of the present study had as objective: 1) to map Quantitative Trait Loci (QTL) on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15 and X in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain); 2) investigate the level of expression of candidate genes influencing economic traits in pigs and 3)develop a panel of microsatellite markers for paternity testing and origin of pigs. A total of 18 QTL were indentified to carcass and quality traits and a total of 6 QTL to performance traits, from these, the QTL for cooking loss and for slaughter age (days) was significant at the 5% genome-wise level. The backfat thickness trait was mainly associated with the Piau breed allele, known as a fat pig. It was observed in diferences in the expressions of the genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 and MyoD1 among groups genetic Piau, commercial and crossbred, opening prospects for further studies, sequencing and search for causal mutation associated with quantitative traits. Accurate information of paternity are fundamental to the estimation of breeding values and thus ensure the success of breeding programs. The the 28 microsatellite markers evaluated were highly informative, showed combined exclusion probabilities for the situations where the mother's genotype is known (P1) and the situation where the mother's genotype is not available (P2) greater than 99% and can be considered efficient for paternity and traceability analysis in pigs. The results obtained in this study and shown in the various chapters were relevant and contributed to more information about the genomic involved in the development of quantitative traits of economic importance in pigs production and also showed the effectiveness of testing for individual identification in pigs.
id UFV_0db7201d74f231a1b10cef61aff9d5f7
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/1758
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str
spelling Paixão, Débora Martinshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4779007P3Lopes, Paulo Sáviohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1Paiva, Samuel Rezendehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767878U7Guimarães, Simone Eliza Facionihttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2Silva, Fabyano Fonseca ehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2Brommonschenkel, Sérgio Hermíniohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780948Y42015-03-26T12:54:35Z2011-09-272015-03-26T12:54:35Z2010-09-24PAIXÃO, Débora Martins. Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs. 2010. 96 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2010.http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758The accomplishment of the present study had as objective: 1) to map Quantitative Trait Loci (QTL) on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15 and X in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain); 2) investigate the level of expression of candidate genes influencing economic traits in pigs and 3)develop a panel of microsatellite markers for paternity testing and origin of pigs. A total of 18 QTL were indentified to carcass and quality traits and a total of 6 QTL to performance traits, from these, the QTL for cooking loss and for slaughter age (days) was significant at the 5% genome-wise level. The backfat thickness trait was mainly associated with the Piau breed allele, known as a fat pig. It was observed in diferences in the expressions of the genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 and MyoD1 among groups genetic Piau, commercial and crossbred, opening prospects for further studies, sequencing and search for causal mutation associated with quantitative traits. Accurate information of paternity are fundamental to the estimation of breeding values and thus ensure the success of breeding programs. The the 28 microsatellite markers evaluated were highly informative, showed combined exclusion probabilities for the situations where the mother's genotype is known (P1) and the situation where the mother's genotype is not available (P2) greater than 99% and can be considered efficient for paternity and traceability analysis in pigs. The results obtained in this study and shown in the various chapters were relevant and contributed to more information about the genomic involved in the development of quantitative traits of economic importance in pigs production and also showed the effectiveness of testing for individual identification in pigs.A realização do presente estudo teve como objetivo: 1) mapear QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em uma população F2 de suínos desenvolvida pelo cruzamento de dois reprodutores da raça brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain); 2) investigar o nível de expressão de genes candidatos a influenciar características de importância econômica em suínos e 3) desenvolver um painel de marcadores microssatélites para testar a paternidade e a origem de suínos. Um total de 18 QTL foram encontrados para características de carcaça e qualidade de carne e seis para características de desempenho, desses, os QTL para perda por cozimento e idade de abate foram significativos ao nível genômico de 5% de probabilidade. A característica espessura de toucinho foi essencialmente associada aos alelos da raça Piau, conhecido como porco tipo banha. Observou-se diferenças de expressão dos genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 e MyoD1 entre os grupos genéticos Piau, comercial e cruzados, abrindo perspectivas para maiores estudos, sequenciamento e procura por mutação causal associada a características quantitativas. Informações de paternidade acuradas são fundamentais para a predição dos valores genéticos dos animais e assim, assegurar o sucesso dos programas de melhoramento. Os 28 marcadores microssatelites avaliados foram altamente informativos, apresentaram estimativas de probabilidades de exclusão de paternidade combinada para as situações em que o genótipo da mãe é conhecido (P1) e para a situação em que genótipo da mãe não está disponível (P2) maiores que 99% e podem ser considerados adequados para análises de paternidade e de rastreabilidade em suínos. Os resultados obtidos no presente trabalho e apresentados nos diferentes capítulos foram relevantes e contribuíram com maiores informações a cerca da genômica envolvida no desenvolvimento das características quantitativas de importância econômica na produção de suínos, como também mostraram a efetividade de testes de identificação indiviual de suínos.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicoapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaDoutorado em ZootecniaUFVBRGenética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e ForragiculProdução de suínosGenômica de suínosGenética de suínosPigPig genomicSwine geneticsCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOSEstudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínosStudies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf1008911https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/1/texto%20completo.pdf202ef68e7701c33736cda73a230054f0MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain185880https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/2/texto%20completo.pdf.txt07ea49520b6b327d372119ad6d1b7945MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3559https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/3/texto%20completo.pdf.jpg67533187b77f2f9f37580c5e9722b338MD53123456789/17582016-04-07 23:11:53.109oai:locus.ufv.br:123456789/1758Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-08T02:11:53LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.por.fl_str_mv Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs
title Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
spellingShingle Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
Paixão, Débora Martins
Produção de suínos
Genômica de suínos
Genética de suínos
Pig
Pig genomic
Swine genetics
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS
title_short Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
title_full Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
title_fullStr Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
title_full_unstemmed Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
title_sort Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
author Paixão, Débora Martins
author_facet Paixão, Débora Martins
author_role author
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4779007P3
dc.contributor.author.fl_str_mv Paixão, Débora Martins
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Lopes, Paulo Sávio
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv Paiva, Samuel Rezende
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767878U7
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Guimarães, Simone Eliza Facioni
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Silva, Fabyano Fonseca e
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Brommonschenkel, Sérgio Hermínio
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780948Y4
contributor_str_mv Lopes, Paulo Sávio
Paiva, Samuel Rezende
Guimarães, Simone Eliza Facioni
Silva, Fabyano Fonseca e
Brommonschenkel, Sérgio Hermínio
dc.subject.por.fl_str_mv Produção de suínos
Genômica de suínos
Genética de suínos
topic Produção de suínos
Genômica de suínos
Genética de suínos
Pig
Pig genomic
Swine genetics
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS
dc.subject.eng.fl_str_mv Pig
Pig genomic
Swine genetics
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS
description The accomplishment of the present study had as objective: 1) to map Quantitative Trait Loci (QTL) on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15 and X in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain); 2) investigate the level of expression of candidate genes influencing economic traits in pigs and 3)develop a panel of microsatellite markers for paternity testing and origin of pigs. A total of 18 QTL were indentified to carcass and quality traits and a total of 6 QTL to performance traits, from these, the QTL for cooking loss and for slaughter age (days) was significant at the 5% genome-wise level. The backfat thickness trait was mainly associated with the Piau breed allele, known as a fat pig. It was observed in diferences in the expressions of the genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 and MyoD1 among groups genetic Piau, commercial and crossbred, opening prospects for further studies, sequencing and search for causal mutation associated with quantitative traits. Accurate information of paternity are fundamental to the estimation of breeding values and thus ensure the success of breeding programs. The the 28 microsatellite markers evaluated were highly informative, showed combined exclusion probabilities for the situations where the mother's genotype is known (P1) and the situation where the mother's genotype is not available (P2) greater than 99% and can be considered efficient for paternity and traceability analysis in pigs. The results obtained in this study and shown in the various chapters were relevant and contributed to more information about the genomic involved in the development of quantitative traits of economic importance in pigs production and also showed the effectiveness of testing for individual identification in pigs.
publishDate 2010
dc.date.issued.fl_str_mv 2010-09-24
dc.date.available.fl_str_mv 2011-09-27
2015-03-26T12:54:35Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-26T12:54:35Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv PAIXÃO, Débora Martins. Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs. 2010. 96 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2010.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758
identifier_str_mv PAIXÃO, Débora Martins. Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs. 2010. 96 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2010.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Doutorado em Zootecnia
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFV
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/2/texto%20completo.pdf.txt
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/3/texto%20completo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 202ef68e7701c33736cda73a230054f0
07ea49520b6b327d372119ad6d1b7945
67533187b77f2f9f37580c5e9722b338
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1794528744914812928