Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos
Ano de defesa: | 2010 |
---|---|
Autor(a) principal: | |
Orientador(a): | |
Banca de defesa: | , |
Tipo de documento: | Tese |
Tipo de acesso: | Acesso aberto |
Idioma: | por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Viçosa
|
Programa de Pós-Graduação: |
Doutorado em Zootecnia
|
Departamento: |
Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul
|
País: |
BR
|
Palavras-chave em Português: | |
Palavras-chave em Inglês: | |
Área do conhecimento CNPq: | |
Link de acesso: | http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758 |
Resumo: | The accomplishment of the present study had as objective: 1) to map Quantitative Trait Loci (QTL) on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15 and X in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain); 2) investigate the level of expression of candidate genes influencing economic traits in pigs and 3)develop a panel of microsatellite markers for paternity testing and origin of pigs. A total of 18 QTL were indentified to carcass and quality traits and a total of 6 QTL to performance traits, from these, the QTL for cooking loss and for slaughter age (days) was significant at the 5% genome-wise level. The backfat thickness trait was mainly associated with the Piau breed allele, known as a fat pig. It was observed in diferences in the expressions of the genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 and MyoD1 among groups genetic Piau, commercial and crossbred, opening prospects for further studies, sequencing and search for causal mutation associated with quantitative traits. Accurate information of paternity are fundamental to the estimation of breeding values and thus ensure the success of breeding programs. The the 28 microsatellite markers evaluated were highly informative, showed combined exclusion probabilities for the situations where the mother's genotype is known (P1) and the situation where the mother's genotype is not available (P2) greater than 99% and can be considered efficient for paternity and traceability analysis in pigs. The results obtained in this study and shown in the various chapters were relevant and contributed to more information about the genomic involved in the development of quantitative traits of economic importance in pigs production and also showed the effectiveness of testing for individual identification in pigs. |
id |
UFV_0db7201d74f231a1b10cef61aff9d5f7 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:locus.ufv.br:123456789/1758 |
network_acronym_str |
UFV |
network_name_str |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
repository_id_str |
|
spelling |
Paixão, Débora Martinshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4779007P3Lopes, Paulo Sáviohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1Paiva, Samuel Rezendehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767878U7Guimarães, Simone Eliza Facionihttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2Silva, Fabyano Fonseca ehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2Brommonschenkel, Sérgio Hermíniohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780948Y42015-03-26T12:54:35Z2011-09-272015-03-26T12:54:35Z2010-09-24PAIXÃO, Débora Martins. Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs. 2010. 96 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2010.http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758The accomplishment of the present study had as objective: 1) to map Quantitative Trait Loci (QTL) on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15 and X in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain); 2) investigate the level of expression of candidate genes influencing economic traits in pigs and 3)develop a panel of microsatellite markers for paternity testing and origin of pigs. A total of 18 QTL were indentified to carcass and quality traits and a total of 6 QTL to performance traits, from these, the QTL for cooking loss and for slaughter age (days) was significant at the 5% genome-wise level. The backfat thickness trait was mainly associated with the Piau breed allele, known as a fat pig. It was observed in diferences in the expressions of the genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 and MyoD1 among groups genetic Piau, commercial and crossbred, opening prospects for further studies, sequencing and search for causal mutation associated with quantitative traits. Accurate information of paternity are fundamental to the estimation of breeding values and thus ensure the success of breeding programs. The the 28 microsatellite markers evaluated were highly informative, showed combined exclusion probabilities for the situations where the mother's genotype is known (P1) and the situation where the mother's genotype is not available (P2) greater than 99% and can be considered efficient for paternity and traceability analysis in pigs. The results obtained in this study and shown in the various chapters were relevant and contributed to more information about the genomic involved in the development of quantitative traits of economic importance in pigs production and also showed the effectiveness of testing for individual identification in pigs.A realização do presente estudo teve como objetivo: 1) mapear QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em uma população F2 de suínos desenvolvida pelo cruzamento de dois reprodutores da raça brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain); 2) investigar o nível de expressão de genes candidatos a influenciar características de importância econômica em suínos e 3) desenvolver um painel de marcadores microssatélites para testar a paternidade e a origem de suínos. Um total de 18 QTL foram encontrados para características de carcaça e qualidade de carne e seis para características de desempenho, desses, os QTL para perda por cozimento e idade de abate foram significativos ao nível genômico de 5% de probabilidade. A característica espessura de toucinho foi essencialmente associada aos alelos da raça Piau, conhecido como porco tipo banha. Observou-se diferenças de expressão dos genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 e MyoD1 entre os grupos genéticos Piau, comercial e cruzados, abrindo perspectivas para maiores estudos, sequenciamento e procura por mutação causal associada a características quantitativas. Informações de paternidade acuradas são fundamentais para a predição dos valores genéticos dos animais e assim, assegurar o sucesso dos programas de melhoramento. Os 28 marcadores microssatelites avaliados foram altamente informativos, apresentaram estimativas de probabilidades de exclusão de paternidade combinada para as situações em que o genótipo da mãe é conhecido (P1) e para a situação em que genótipo da mãe não está disponível (P2) maiores que 99% e podem ser considerados adequados para análises de paternidade e de rastreabilidade em suínos. Os resultados obtidos no presente trabalho e apresentados nos diferentes capítulos foram relevantes e contribuíram com maiores informações a cerca da genômica envolvida no desenvolvimento das características quantitativas de importância econômica na produção de suínos, como também mostraram a efetividade de testes de identificação indiviual de suínos.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicoapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaDoutorado em ZootecniaUFVBRGenética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e ForragiculProdução de suínosGenômica de suínosGenética de suínosPigPig genomicSwine geneticsCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOSEstudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínosStudies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf1008911https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/1/texto%20completo.pdf202ef68e7701c33736cda73a230054f0MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain185880https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/2/texto%20completo.pdf.txt07ea49520b6b327d372119ad6d1b7945MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3559https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/3/texto%20completo.pdf.jpg67533187b77f2f9f37580c5e9722b338MD53123456789/17582016-04-07 23:11:53.109oai:locus.ufv.br:123456789/1758Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-08T02:11:53LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos |
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs |
title |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos |
spellingShingle |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos Paixão, Débora Martins Produção de suínos Genômica de suínos Genética de suínos Pig Pig genomic Swine genetics CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS |
title_short |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos |
title_full |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos |
title_fullStr |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos |
title_full_unstemmed |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos |
title_sort |
Estudos de locos de características quantitativas, de expressão gênica e teste de paternidade em suínos |
author |
Paixão, Débora Martins |
author_facet |
Paixão, Débora Martins |
author_role |
author |
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4779007P3 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Paixão, Débora Martins |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Lopes, Paulo Sávio |
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1 |
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv |
Paiva, Samuel Rezende |
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767878U7 |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Guimarães, Simone Eliza Facioni |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2 |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Silva, Fabyano Fonseca e |
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2 |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Brommonschenkel, Sérgio Hermínio |
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780948Y4 |
contributor_str_mv |
Lopes, Paulo Sávio Paiva, Samuel Rezende Guimarães, Simone Eliza Facioni Silva, Fabyano Fonseca e Brommonschenkel, Sérgio Hermínio |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Produção de suínos Genômica de suínos Genética de suínos |
topic |
Produção de suínos Genômica de suínos Genética de suínos Pig Pig genomic Swine genetics CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS |
dc.subject.eng.fl_str_mv |
Pig Pig genomic Swine genetics |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS |
description |
The accomplishment of the present study had as objective: 1) to map Quantitative Trait Loci (QTL) on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15 and X in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain); 2) investigate the level of expression of candidate genes influencing economic traits in pigs and 3)develop a panel of microsatellite markers for paternity testing and origin of pigs. A total of 18 QTL were indentified to carcass and quality traits and a total of 6 QTL to performance traits, from these, the QTL for cooking loss and for slaughter age (days) was significant at the 5% genome-wise level. The backfat thickness trait was mainly associated with the Piau breed allele, known as a fat pig. It was observed in diferences in the expressions of the genes CAPN3, COL12A1, COL15A1, EPOR, IGF2 and MyoD1 among groups genetic Piau, commercial and crossbred, opening prospects for further studies, sequencing and search for causal mutation associated with quantitative traits. Accurate information of paternity are fundamental to the estimation of breeding values and thus ensure the success of breeding programs. The the 28 microsatellite markers evaluated were highly informative, showed combined exclusion probabilities for the situations where the mother's genotype is known (P1) and the situation where the mother's genotype is not available (P2) greater than 99% and can be considered efficient for paternity and traceability analysis in pigs. The results obtained in this study and shown in the various chapters were relevant and contributed to more information about the genomic involved in the development of quantitative traits of economic importance in pigs production and also showed the effectiveness of testing for individual identification in pigs. |
publishDate |
2010 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2010-09-24 |
dc.date.available.fl_str_mv |
2011-09-27 2015-03-26T12:54:35Z |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2015-03-26T12:54:35Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
PAIXÃO, Débora Martins. Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs. 2010. 96 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2010. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758 |
identifier_str_mv |
PAIXÃO, Débora Martins. Studies of quantitative trait loci, genic expression and of paternity testing in pigs. 2010. 96 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2010. |
url |
http://locus.ufv.br/handle/123456789/1758 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Viçosa |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Doutorado em Zootecnia |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFV |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Viçosa |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV) instacron:UFV |
instname_str |
Universidade Federal de Viçosa (UFV) |
instacron_str |
UFV |
institution |
UFV |
reponame_str |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
collection |
LOCUS Repositório Institucional da UFV |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/1/texto%20completo.pdf https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/2/texto%20completo.pdf.txt https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1758/3/texto%20completo.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
202ef68e7701c33736cda73a230054f0 07ea49520b6b327d372119ad6d1b7945 67533187b77f2f9f37580c5e9722b338 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV) |
repository.mail.fl_str_mv |
fabiojreis@ufv.br |
_version_ |
1794528744914812928 |