Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2019
Autor(a) principal: Batista, Izabel Cristina Alves
Orientador(a): Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: eng
Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
Programa de Pós-Graduação: Fitopatologia
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Área do conhecimento CNPq:
Fitopatologia
Link de acesso: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30080
Resumo: Estrutura populacional de Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Brasil. Orientador: Eduardo Seiti Gomide Mizubuti. Coorientadora: Camila Geovana Ferro. Murcha de Fusarium, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), é considerada uma das doenças mais destrutivas da cultura da bananeira. Estudos de genética populacional são necessários para a implementação de uma abordagem de epidemiologia molecular visando ações efetivas de manejo ou mitigação. Neste estudo, uma coleção de 200 isolados monospóricos de várias regiões produtoras de banana com diferentes condições climáticas ao longo de um transecto Norte – Sul no Brasil foi formada para avaliar a estrutura genética da população de Foc. O grupo de compatibilidade vegetativa (VCG) de 140 isolados foi determinado por meio do pareamento com 17 testadores de VCG. Um grupo de 158 isolados foi selecionado para genotipagem por microssatélites. Houve diversidade moderada de Foc no Brasil. Foram identificados oito VCGs: 0120, 0122, 0124, 0125, 0128, 01215, 01220 e 01222. A distribuição de VCGs é desigual, independente do genótipo da banana e variada de acordo com as regiões geográficas. Quatro loci SSR foram polimórficos e, em média, 7,5 alelos foram detectados por locus. Trinta e cinco MGL foram identificados. Não houve associação entre VCG e SSR e nenhuma estrutura genética da população de Foc no Brasil foi detectada. Palavras-chave: Panamá. Murcha. Banana.
id UFV_0f24edf3a6072330c8eb4d71f218e2c0
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/30080
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str
spelling Ferro, Camila GeovanaBatista, Izabel Cristina Alveshttp://lattes.cnpq.br/0943580960513162Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide2022-10-14T10:15:17Z2022-10-14T10:15:17Z2019-07-26BATISTA, Izabel Cristina Alves. Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil. 2019. 43 f. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2019.https://locus.ufv.br//handle/123456789/30080Estrutura populacional de Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Brasil. Orientador: Eduardo Seiti Gomide Mizubuti. Coorientadora: Camila Geovana Ferro. Murcha de Fusarium, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), é considerada uma das doenças mais destrutivas da cultura da bananeira. Estudos de genética populacional são necessários para a implementação de uma abordagem de epidemiologia molecular visando ações efetivas de manejo ou mitigação. Neste estudo, uma coleção de 200 isolados monospóricos de várias regiões produtoras de banana com diferentes condições climáticas ao longo de um transecto Norte – Sul no Brasil foi formada para avaliar a estrutura genética da população de Foc. O grupo de compatibilidade vegetativa (VCG) de 140 isolados foi determinado por meio do pareamento com 17 testadores de VCG. Um grupo de 158 isolados foi selecionado para genotipagem por microssatélites. Houve diversidade moderada de Foc no Brasil. Foram identificados oito VCGs: 0120, 0122, 0124, 0125, 0128, 01215, 01220 e 01222. A distribuição de VCGs é desigual, independente do genótipo da banana e variada de acordo com as regiões geográficas. Quatro loci SSR foram polimórficos e, em média, 7,5 alelos foram detectados por locus. Trinta e cinco MGL foram identificados. Não houve associação entre VCG e SSR e nenhuma estrutura genética da população de Foc no Brasil foi detectada. Palavras-chave: Panamá. Murcha. Banana.Fusarium wilt, caused by the soil-borne fungus Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), is considered one of the most destructive diseases of bananas. Population genetics studies are required for implementing a molecular epidemiology approach, which in turn is fundamental for effective management or mitigation actions. In this study, a collection of 200 monosporic isolates from several banana producing regions with different climate conditions along a South to North transect in Brazil was formed to assess the genetic structure of the population of Foc. The VCG of 140 isolates was determined by pairing against 17 VCG testers. A group of 158 isolates was selected for microsatellite genotyping. There was moderate diversity of Foc in Brazil. Eight VCGs were identified: 0120, 0122, 0124, 0125, 0128, 01215, 01220, and 01222. The distribution of VCGs is uneven, independent of the banana genotype and varied according to geographic regions. Four SSR loci were polymorphic and on average 7.5 alleles were detected per locus. Thirty-five MGL were identified. There was no association between VCG and SSR and no genetic structure of the population of Foc in Brazil was detected. Keywords: Panama. Wilt. Banana.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorengUniversidade Federal de ViçosaFitopatologiaFusarioseBananaFitopatologiaPopulation structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in BrazilEstrutura populacional de Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de FitopatologiaMestre em FitopatologiaViçosa - MG2019-07-26Mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf1003862https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30080/1/texto%20completo.pdfa95e59588c2a33319ad7ac6fd0a7cf82MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30080/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/300802022-10-14 15:12:54.364oai:locus.ufv.br:123456789/30080Tk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452022-10-14T18:12:54LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.en.fl_str_mv Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
dc.title.pt-BR.fl_str_mv Estrutura populacional de Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Brasil
title Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
spellingShingle Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
Batista, Izabel Cristina Alves
Fusariose
Banana
Fitopatologia
title_short Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
title_full Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
title_fullStr Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
title_full_unstemmed Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
title_sort Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil
author Batista, Izabel Cristina Alves
author_facet Batista, Izabel Cristina Alves
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt-BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0943580960513162
dc.contributor.none.fl_str_mv Ferro, Camila Geovana
dc.contributor.author.fl_str_mv Batista, Izabel Cristina Alves
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide
contributor_str_mv Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide
dc.subject.pt-BR.fl_str_mv Fusariose
Banana
topic Fusariose
Banana
Fitopatologia
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Fitopatologia
description Estrutura populacional de Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Brasil. Orientador: Eduardo Seiti Gomide Mizubuti. Coorientadora: Camila Geovana Ferro. Murcha de Fusarium, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), é considerada uma das doenças mais destrutivas da cultura da bananeira. Estudos de genética populacional são necessários para a implementação de uma abordagem de epidemiologia molecular visando ações efetivas de manejo ou mitigação. Neste estudo, uma coleção de 200 isolados monospóricos de várias regiões produtoras de banana com diferentes condições climáticas ao longo de um transecto Norte – Sul no Brasil foi formada para avaliar a estrutura genética da população de Foc. O grupo de compatibilidade vegetativa (VCG) de 140 isolados foi determinado por meio do pareamento com 17 testadores de VCG. Um grupo de 158 isolados foi selecionado para genotipagem por microssatélites. Houve diversidade moderada de Foc no Brasil. Foram identificados oito VCGs: 0120, 0122, 0124, 0125, 0128, 01215, 01220 e 01222. A distribuição de VCGs é desigual, independente do genótipo da banana e variada de acordo com as regiões geográficas. Quatro loci SSR foram polimórficos e, em média, 7,5 alelos foram detectados por locus. Trinta e cinco MGL foram identificados. Não houve associação entre VCG e SSR e nenhuma estrutura genética da população de Foc no Brasil foi detectada. Palavras-chave: Panamá. Murcha. Banana.
publishDate 2019
dc.date.issued.fl_str_mv 2019-07-26
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-10-14T10:15:17Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-10-14T10:15:17Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv BATISTA, Izabel Cristina Alves. Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil. 2019. 43 f. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2019.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://locus.ufv.br//handle/123456789/30080
identifier_str_mv BATISTA, Izabel Cristina Alves. Population structure of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Brazil. 2019. 43 f. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2019.
url https://locus.ufv.br//handle/123456789/30080
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Fitopatologia
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30080/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30080/2/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv a95e59588c2a33319ad7ac6fd0a7cf82
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1794528694171074560

Registros relacionados