Linkage analysis and association mapping for plant height in maize

• Ano de defesa: 2014
• Autor(a) principal: Lima, Rodrigo Oliveira de
• Orientador(a): Viana, José Marcelo Soriano
• Banca de defesa: Souza, Leandro Vagno de , Guimarães, Lauro José Moreira
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
• Programa de Pós-Graduação: Doutorado em Genética e Melhoramento
• Departamento: Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me
• País: BR
• Palavras-chave em Português: Milho - Genética; Locos de caracteres quantitativos; Milho - Pesos e medidas
• Palavras-chave em Inglês: Corn - Genetics; Quantitative trait loci; Corn - Weights and measures
• Área do conhecimento CNPq: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
• Link de acesso: http://locus.ufv.br/handle/123456789/1407

Altura de planta é um dos caracteres mais estudados em milho e está relacionado com produtividade de grãos, densidade de plantas e acamamento. Vários quantitative trait loci (QTL) para alttura de planta foram encontrados em milho. Entretanto, sua arquitetura genética ainda permanece desconhecida. Deste modo, o objetivo desse estudo foi explorar a arquitetura genética e fenotípica de altura de planta em milho por meio de análise de ligação e mapeamento associativo. Foram avaliados dez caracteres relacionados à altura de planta em 962 linhagens endogâmicas recombinantes (RILs) de quatro populações e 400 linhagens endogâmicas do painel de mapeamento associativo WiDiv. As linhagens endogâmicas do painel de associação WiDiv foram genotipadas com 458 151 SNP (single nucleotide polymorphism) através do sequenciamento de RNA (RNAseq). As populações RILs IBM, OW e NyH foram genotipadas com 8 224, 6 696 e 5 320 SNP por meio da metodologia de genotyping-by-sequencing . A população NAM22 foi genotipada com 1 200 SNP usando a plataforma de 1 536 SNP da Illumina. Altura de planta de milho pode ser fenotipicamente decomposta em altura de espiga, número de internódios e caracteres de florescimento. Os caracteres número de internódios, número de internódios abaixo da espiga e caracteres de florescimento apresentaram elevada correlação entre eles. A altura de planta de milho pode ser geneticamente dissecada por meio de análise de ligação e mapeamento associativo. Vários QTL foram associados com caracteres de altura de planta, e alguns QTL foram identificados na mesma região genômica para altura de planta, altura de espiga e número de internódios. Alguns SNP localizados no gene candidato GRMZM2G171622 foram associados com seis caracteres de altura de planta. Os genes candidates GRMZM2G108798 e GRMZM2G012766, que foram identificados no painel de associação WiDiv, foram associados com caracteres de altura de planta em milho. Os resultados sugerem que altura de espiga, número de internódios, número de internódios abaixo da espiga, comprimento médio de internódio e caracteres de florescimento são os principais componentes de altura de planta de milho.