Genetic structure of the population of Pseudocercospora ulei in the watershed of the Amazon river

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: Santos, Taciana Ferreira
• Orientador(a): Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: eng
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
• Área do conhecimento CNPq: Fitopatologia
• Link de acesso: http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/22449

O mal das folhas da seringueira (MDF) é uma doença destrutiva causada pelo fungo Pseudocercospora ulei que pode afetar severamente a seringueira em monocultura na América tropical. O agente causal da doença é um patógeno hemibiotrófico que apresenta crescimento lento in vitro. O isolamento de DNA de boa qualidade em quantidades adequadas não é uma tarefa fácil devido à falta de um protocolo padrão e a dificuldade de cultivar P. ulei em condições de laboratório. Embora o MDF seja conhecido por mais de um século, informações sobre a estrutura genética na região amazônica, seu centro de origem, permanecem desconhecidas. Neste trabalho foram avaliados protocolos adequados para a extração de DNA e a estrutura genética da população de P. ulei na região amazônica. Foram comparados seis protocolos de extração em relação a pureza e ao rendimento do DNA. Um total de 61 isolados foram amostrados ao longo das bacias hidrográficas Madeira, Purus e Juruá localizadas na região amazônica e genotipados para 12 locos SSR. O protocolo de extração de DNA de Doyle e Doyle foi o único que apresentou concentração consistente e melhor qualidade do DNA extraído. Houve desequilíbrio de ligação entre os alelos e diferenciação genética entre populações geograficamente distantes foi detectada. A análise de componentes principais revelou agrupamento dos isolados de acordo com os limites das bacias hidrográficas. Foram formados dois grupos, um constituído pelos indivíduos da bacia do rio Madeira e o outro composto por indivíduos dos rios Purus e Juruá.