Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Alves, Rodrigo Silva
Orientador(a): Resende, Marcos Deon Vilela de
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: eng
Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://locus.ufv.br//handle/123456789/28745
Resumo: As técnicas atualmente usadas para avaliação genética envolvem a predição de valores genéticos e a estimação de componentes de variância simultaneamente. O método amplamente utilizado, em todo o mundo, para predição de valores genéticos é a melhor predição linear não viesada (BLUP). A predição usando o BLUP assume que os componentes de variância são conhecidos. No entanto, na prática, esses valores não são conhecidos e devem ser estimados com precisão para obter o BLUP empírico. Atualmente, o método padrão para estimação de componentes de variância é o da máxima verossimilhança restrita (REML). Portanto, a avaliação genética consiste em usar essas metodologias juntas (procedimento REML/BLUP). Porém, quando a seleção genética é baseada em várias características, que podem ser geneticamente correlacionadas devido a genes pleiotrópicos e/ou desequilíbrio da fase gamética, pode ocorrer viés de seleção se essas características forem analisadas individualmente. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a aplicabilidade e eficiência do BLUP multicaracterístico no melhoramento florestal. Os modelos multicaracterísticos empregados conduziram a melhores resultados que os tradicionais modelos univariados e de repetibilidade. Portanto, o BLUP multicaracterístico pode ser utilizado com vantagem no melhoramento florestal. Palavras-chave: BLUP. REML. Metodologia de modelos mistos.
id UFV_b901553c6db1e68f0367df6c7ac3455f
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/28745
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str
spelling Alves, Rodrigo Silvahttp://lattes.cnpq.br/2496150091737945Resende, Marcos Deon Vilela de2022-03-11T13:19:03Z2022-03-11T13:19:03Z2020-02-28ALVES, Rodrigo Silva. Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models. 2020. 49 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2020.https://locus.ufv.br//handle/123456789/28745As técnicas atualmente usadas para avaliação genética envolvem a predição de valores genéticos e a estimação de componentes de variância simultaneamente. O método amplamente utilizado, em todo o mundo, para predição de valores genéticos é a melhor predição linear não viesada (BLUP). A predição usando o BLUP assume que os componentes de variância são conhecidos. No entanto, na prática, esses valores não são conhecidos e devem ser estimados com precisão para obter o BLUP empírico. Atualmente, o método padrão para estimação de componentes de variância é o da máxima verossimilhança restrita (REML). Portanto, a avaliação genética consiste em usar essas metodologias juntas (procedimento REML/BLUP). Porém, quando a seleção genética é baseada em várias características, que podem ser geneticamente correlacionadas devido a genes pleiotrópicos e/ou desequilíbrio da fase gamética, pode ocorrer viés de seleção se essas características forem analisadas individualmente. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a aplicabilidade e eficiência do BLUP multicaracterístico no melhoramento florestal. Os modelos multicaracterísticos empregados conduziram a melhores resultados que os tradicionais modelos univariados e de repetibilidade. Portanto, o BLUP multicaracterístico pode ser utilizado com vantagem no melhoramento florestal. Palavras-chave: BLUP. REML. Metodologia de modelos mistos.The current techniques used for genetic evaluation involve the simultaneous prediction of genetic values and estimation of variance components. Best linear unbiased prediction (BLUP) is a widely used method worldwide to predict genetic values. Prediction using BLUP assumes that the variance components are known. However, these values are not known in practice and should thus be accurately estimated to obtain the empirical BLUP. At present, the standard method to estimate variance components is restricted maximum likelihood (REML). Therefore, genetic evaluation consists of using these methodologies together (REML/BLUP procedure). Nonetheless, when genetic selection is based on several traits, which may be genetically correlated due to pleiotropic genes and/or gametic phase imbalance, selection bias may occur if these traits are analyzed individually. Thus, the present work aimed to evaluate the applicability and efficiency of multiple-trait BLUP in forest-tree breeding. The multiple-trait models employed led to better results than the traditional univariate and repeatability models. On this basis, the multiple-trait BLUP can be advantageously used in forest breeding. Keywords: BLUP. REML. Mixed model methodology.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorengUniversidade Federal de ViçosaBLUPAnálise de variânciaModelos multiníveis (Estatísticas)Florestas - Melhoramento genéticoGenética QuantitativaOptimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed modelsOtimização do melhoramento florestal por meio de modelos mistos multicaracterísticosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de Biologia GeralDoutor em Genética e MelhoramentoViçosa - MG2020-02-28Doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf572184https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28745/1/texto%20completo.pdfafd0e00bb61ca3d463ae4cc9ee5ffb57MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28745/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/287452022-03-11 10:20:06.72oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452022-03-11T13:20:06LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.en.fl_str_mv Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
dc.title.pt-BR.fl_str_mv Otimização do melhoramento florestal por meio de modelos mistos multicaracterísticos
title Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
spellingShingle Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
Alves, Rodrigo Silva
BLUP
Análise de variância
Modelos multiníveis (Estatísticas)
Florestas - Melhoramento genético
Genética Quantitativa
title_short Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
title_full Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
title_fullStr Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
title_full_unstemmed Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
title_sort Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models
author Alves, Rodrigo Silva
author_facet Alves, Rodrigo Silva
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt-BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2496150091737945
dc.contributor.author.fl_str_mv Alves, Rodrigo Silva
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Resende, Marcos Deon Vilela de
contributor_str_mv Resende, Marcos Deon Vilela de
dc.subject.pt-BR.fl_str_mv BLUP
Análise de variância
Modelos multiníveis (Estatísticas)
Florestas - Melhoramento genético
topic BLUP
Análise de variância
Modelos multiníveis (Estatísticas)
Florestas - Melhoramento genético
Genética Quantitativa
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Genética Quantitativa
description As técnicas atualmente usadas para avaliação genética envolvem a predição de valores genéticos e a estimação de componentes de variância simultaneamente. O método amplamente utilizado, em todo o mundo, para predição de valores genéticos é a melhor predição linear não viesada (BLUP). A predição usando o BLUP assume que os componentes de variância são conhecidos. No entanto, na prática, esses valores não são conhecidos e devem ser estimados com precisão para obter o BLUP empírico. Atualmente, o método padrão para estimação de componentes de variância é o da máxima verossimilhança restrita (REML). Portanto, a avaliação genética consiste em usar essas metodologias juntas (procedimento REML/BLUP). Porém, quando a seleção genética é baseada em várias características, que podem ser geneticamente correlacionadas devido a genes pleiotrópicos e/ou desequilíbrio da fase gamética, pode ocorrer viés de seleção se essas características forem analisadas individualmente. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a aplicabilidade e eficiência do BLUP multicaracterístico no melhoramento florestal. Os modelos multicaracterísticos empregados conduziram a melhores resultados que os tradicionais modelos univariados e de repetibilidade. Portanto, o BLUP multicaracterístico pode ser utilizado com vantagem no melhoramento florestal. Palavras-chave: BLUP. REML. Metodologia de modelos mistos.
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020-02-28
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-03-11T13:19:03Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-03-11T13:19:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv ALVES, Rodrigo Silva. Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models. 2020. 49 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2020.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://locus.ufv.br//handle/123456789/28745
identifier_str_mv ALVES, Rodrigo Silva. Optimization of forest tree breeding through multiple-trait mixed models. 2020. 49 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2020.
url https://locus.ufv.br//handle/123456789/28745
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28745/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28745/2/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv afd0e00bb61ca3d463ae4cc9ee5ffb57
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1794528692123205632