Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2008
Autor(a) principal: Sánchez, Carlos Felipe Barrera
Orientador(a): Cruz, Cosme Damião lattes
Banca de defesa: Cecon, Paulo Roberto lattes, Ferreira, Adésio lattes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
Programa de Pós-Graduação: Mestrado em Genética e Melhoramento
Departamento: Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me
País: BR
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://locus.ufv.br/handle/123456789/4693
Resumo: The effect of genetic drift on populations has been the subject of many studies due to a reduction in the effective population size. It may seem that the case has only effect on the genetic composition of populations. Meanwhile, a random sampling of gametes in small populations has significant consequences for the conservation of genetic diversity, as the loss of genetic diversity and fixation of alleles within the population. Genetic diversity is fundamental to the evolution. The natural selection operates between the variations within populations to adjust to the environment, providing variation among populations and, finally, variation among species. Thus, the higher the genetic variability exists in the population, the greater the chances of exploitation by breeders in their work. The maintenance of genetic variability in populations is the basis for the conservation of species and hence the description and study of the effect of genetic drift which appears on it, is reason for the search. Thus, the research aimed to analyze the effect of genetic drift on the genetic diversity of different populations. For that were generated and analyzed data from the simulation of populations. One of the key factors to evaluate the effect of genetic drift is the size of populations to be worked. To study and acquisition of genetic differentiation within and between populations under the effect of genetic drift, 4000 were simulated populations originated from molecular markers co- dominant. The samples were generated, 20, 50, 100 and 200 individuals with 100 sub-populations subjected to 10 generations of random mating with emphasis on 10 loci. The populations were evaluated with different indices of genetic diversity between and within: heterozygosity and inbreeding, Distance Shannon - Wiener (1978), Index of diversity of Nei (1973), Index of Fixing Wright (1951, 1978), heterozygosity for Weir (1996), Analysis of molecular variance (AMOVA) of Excoffier, et al., (1992). We conclude that the effect of genetic drift by changing the gene frequency depends on the size of the population. The lower the population, most obvious are the effects of random sampling, the statistics GST, FST and oST increase their value to the advancement of generations, a result of loss of genetic variation within and genetic divergence among populations.
id UFV_d91b8593d091cf0a2f3826ce1dbdf232
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/4693
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str
spelling Sánchez, Carlos Felipe Barrerahttp://lattes.cnpq.br/7419415290331728Furtado, Marcos Ribeirohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784109J7Carneiro, Pedro Crescêncio Souzahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728227T6Cruz, Cosme Damiãohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6Cecon, Paulo Robertohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788114T5Ferreira, Adésiohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4777896Y82015-03-26T13:42:08Z2009-08-062015-03-26T13:42:08Z2008-12-15SÁNCHEZ, Carlos Felipe Barrera. Diversity among and within populations under simulated genetic drift. 2008. 95 f. Dissertação (Mestrado em Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.http://locus.ufv.br/handle/123456789/4693The effect of genetic drift on populations has been the subject of many studies due to a reduction in the effective population size. It may seem that the case has only effect on the genetic composition of populations. Meanwhile, a random sampling of gametes in small populations has significant consequences for the conservation of genetic diversity, as the loss of genetic diversity and fixation of alleles within the population. Genetic diversity is fundamental to the evolution. The natural selection operates between the variations within populations to adjust to the environment, providing variation among populations and, finally, variation among species. Thus, the higher the genetic variability exists in the population, the greater the chances of exploitation by breeders in their work. The maintenance of genetic variability in populations is the basis for the conservation of species and hence the description and study of the effect of genetic drift which appears on it, is reason for the search. Thus, the research aimed to analyze the effect of genetic drift on the genetic diversity of different populations. For that were generated and analyzed data from the simulation of populations. One of the key factors to evaluate the effect of genetic drift is the size of populations to be worked. To study and acquisition of genetic differentiation within and between populations under the effect of genetic drift, 4000 were simulated populations originated from molecular markers co- dominant. The samples were generated, 20, 50, 100 and 200 individuals with 100 sub-populations subjected to 10 generations of random mating with emphasis on 10 loci. The populations were evaluated with different indices of genetic diversity between and within: heterozygosity and inbreeding, Distance Shannon - Wiener (1978), Index of diversity of Nei (1973), Index of Fixing Wright (1951, 1978), heterozygosity for Weir (1996), Analysis of molecular variance (AMOVA) of Excoffier, et al., (1992). We conclude that the effect of genetic drift by changing the gene frequency depends on the size of the population. The lower the population, most obvious are the effects of random sampling, the statistics GST, FST and oST increase their value to the advancement of generations, a result of loss of genetic variation within and genetic divergence among populations.O efeito da deriva genética sobre as populações de pequenos tamanhos tem sido objeto de diversos estudos, apresentando efeito sobre a composição genética das populações. A amostragem dos gametas ao acaso dentro de pequenas populações com perda de diversidade genética e fixação de alelos, tem conseqüências de grande significado para a conservação da diversidade genética e das espécies. A diversidade genética é fundamental para que ocorra a evolução. A seleção natural atua entre as variantes dentro das populações em relação à adaptação ao ambiente, proporcionando variação entre populações e, por fim, variação entre espécies. A manutenção da variabilidade genética em populações é a base da conservação de espécies e, portanto, a descrição e o estudo do efeito da deriva genética sobre as populações se tornam de grande importância. Deste modo, o objetivo deste trabalho foi analisar o efeito da deriva genética sobre a diversidade genética de diferentes populações simuladas de diferentes tamanhos. Para o estudo da diferenciação genética dentro e entre populações sujeitas ao efeito da deriva genética, foram simuladas 4000 populações originadas de marcas moleculares co-dominantes. As amostras geradas foram de 20, 50, 100 e 200 indivíduos com 100 subpopulações submetidas a 10 gerações de acasalamento ao acaso com base em 10 locos. As populações foram avaliadas por meio dos seguintes índices de diversidade genética entre e dentro: Endogamia e Heterozigosidade, Distância Shannon Wiener (1978), Índice de diversidade de Nei (1973), Índice de Fixação de Wright (1951, 1978), Heterozigosidade de Weir (1996), Análise de variância molecular (AMOVA) de Excoffier, et al., (1992). Conclui-se que o efeito da deriva genética alterando a freqüência gênica depende do tamanho da população. Quanto menor a população, maiores são os efeitos da amostragem, evidenciados pelas estatísticas GST, FST e oST, que aumentam seu valor com o avanço das gerações, indicando perda de variação genética dentro e aumento da divergência genética entre as populações.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaMestrado em Genética e MelhoramentoUFVBRGenética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; MeFixaçãoIsolamentoGenéticaGeneticsCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA QUANTITATIVADiversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genéticaDiversity among and within populations under simulated genetic driftinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf570177https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4693/1/texto%20completo.pdfd71e9d24e3e0eda58b4a211dd8553b04MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain152395https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4693/2/texto%20completo.pdf.txt6f92cdc9207c5b8211403d2b359d5412MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3539https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4693/3/texto%20completo.pdf.jpg836aa0dd6a9b31fcce30a76b528baf8fMD53123456789/46932016-04-10 23:12:30.171oai:locus.ufv.br:123456789/4693Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-11T02:12:30LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.por.fl_str_mv Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Diversity among and within populations under simulated genetic drift
title Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
spellingShingle Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
Sánchez, Carlos Felipe Barrera
Fixação
Isolamento
Genética
Genetics
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA QUANTITATIVA
title_short Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
title_full Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
title_fullStr Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
title_full_unstemmed Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
title_sort Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética
author Sánchez, Carlos Felipe Barrera
author_facet Sánchez, Carlos Felipe Barrera
author_role author
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7419415290331728
dc.contributor.author.fl_str_mv Sánchez, Carlos Felipe Barrera
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Furtado, Marcos Ribeiro
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784109J7
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv Carneiro, Pedro Crescêncio Souza
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728227T6
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Cruz, Cosme Damião
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Cecon, Paulo Roberto
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788114T5
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Ferreira, Adésio
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4777896Y8
contributor_str_mv Furtado, Marcos Ribeiro
Carneiro, Pedro Crescêncio Souza
Cruz, Cosme Damião
Cecon, Paulo Roberto
Ferreira, Adésio
dc.subject.por.fl_str_mv Fixação
Isolamento
Genética
topic Fixação
Isolamento
Genética
Genetics
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA QUANTITATIVA
dc.subject.eng.fl_str_mv Genetics
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA QUANTITATIVA
description The effect of genetic drift on populations has been the subject of many studies due to a reduction in the effective population size. It may seem that the case has only effect on the genetic composition of populations. Meanwhile, a random sampling of gametes in small populations has significant consequences for the conservation of genetic diversity, as the loss of genetic diversity and fixation of alleles within the population. Genetic diversity is fundamental to the evolution. The natural selection operates between the variations within populations to adjust to the environment, providing variation among populations and, finally, variation among species. Thus, the higher the genetic variability exists in the population, the greater the chances of exploitation by breeders in their work. The maintenance of genetic variability in populations is the basis for the conservation of species and hence the description and study of the effect of genetic drift which appears on it, is reason for the search. Thus, the research aimed to analyze the effect of genetic drift on the genetic diversity of different populations. For that were generated and analyzed data from the simulation of populations. One of the key factors to evaluate the effect of genetic drift is the size of populations to be worked. To study and acquisition of genetic differentiation within and between populations under the effect of genetic drift, 4000 were simulated populations originated from molecular markers co- dominant. The samples were generated, 20, 50, 100 and 200 individuals with 100 sub-populations subjected to 10 generations of random mating with emphasis on 10 loci. The populations were evaluated with different indices of genetic diversity between and within: heterozygosity and inbreeding, Distance Shannon - Wiener (1978), Index of diversity of Nei (1973), Index of Fixing Wright (1951, 1978), heterozygosity for Weir (1996), Analysis of molecular variance (AMOVA) of Excoffier, et al., (1992). We conclude that the effect of genetic drift by changing the gene frequency depends on the size of the population. The lower the population, most obvious are the effects of random sampling, the statistics GST, FST and oST increase their value to the advancement of generations, a result of loss of genetic variation within and genetic divergence among populations.
publishDate 2008
dc.date.issued.fl_str_mv 2008-12-15
dc.date.available.fl_str_mv 2009-08-06
2015-03-26T13:42:08Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-26T13:42:08Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SÁNCHEZ, Carlos Felipe Barrera. Diversity among and within populations under simulated genetic drift. 2008. 95 f. Dissertação (Mestrado em Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://locus.ufv.br/handle/123456789/4693
identifier_str_mv SÁNCHEZ, Carlos Felipe Barrera. Diversity among and within populations under simulated genetic drift. 2008. 95 f. Dissertação (Mestrado em Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/4693
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Mestrado em Genética e Melhoramento
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFV
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4693/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4693/2/texto%20completo.pdf.txt
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/4693/3/texto%20completo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv d71e9d24e3e0eda58b4a211dd8553b04
6f92cdc9207c5b8211403d2b359d5412
836aa0dd6a9b31fcce30a76b528baf8f
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1794528636804530176