Medidas de diferenciação genética em populações simuladas sob endogamia e seleção divergente
Ano de defesa: | 2008 |
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Banca de defesa: | , |
Tipo de documento: | Dissertação |
Tipo de acesso: | Acesso aberto |
Idioma: | por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Viçosa
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Programa de Pós-Graduação: |
Mestrado em Biologia Celular e Estrutural
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Departamento: |
Análises quantitativas e moleculares do Genoma; Biologia das células e dos tecidos
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País: |
BR
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Palavras-chave em Português: | |
Palavras-chave em Inglês: | |
Área do conhecimento CNPq: | |
Link de acesso: | http://locus.ufv.br/handle/123456789/2371 |
Resumo: | Several methods to esteem genetic variation and of population structure they were already developed, with varied applications to the individual levels, intrapopulational and interpopulational. In these studies the responsible factors should be considered by the structuring of the genetic variation at the population level, which they are the genetic drift, the genic flow , the mutation and the selection. The objective of this work was, through simulation, to discuss the effectiveness of the biometrics methodologies GST of NEI (1973), FST of Wright (1951) and ANOVA of genic frequency , in detecting differentiation among populations generated under inbreeding and divergent selection. For this they were simulate, in the case of the inbreeding, 6 derived populations of autofecundation successive starting from 3 populations base. In the case of the divergent selection , 20 populations were generated, being 10 resultants of the selection in favor of an allele A and 10 of the selection in against the specified allele, starting from a population base. After the obtaining of all the differentiation estimates among the populations based on the biometrics statistics tested it is ended that, for all the loci, in the case of the inbreeding, significant differentiation was not observed among the populations as it was used statistics GST, FST, and ANOVA. For the case of the divergent selection high differentiation interpopulational was observed for all the loci, with the use of statistics GST, FST, and ANOVA. |
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Dissertação (Mestrado em Análises quantitativas e moleculares do Genoma; Biologia das células e dos tecidos) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.http://locus.ufv.br/handle/123456789/2371Several methods to esteem genetic variation and of population structure they were already developed, with varied applications to the individual levels, intrapopulational and interpopulational. In these studies the responsible factors should be considered by the structuring of the genetic variation at the population level, which they are the genetic drift, the genic flow , the mutation and the selection. The objective of this work was, through simulation, to discuss the effectiveness of the biometrics methodologies GST of NEI (1973), FST of Wright (1951) and ANOVA of genic frequency , in detecting differentiation among populations generated under inbreeding and divergent selection. For this they were simulate, in the case of the inbreeding, 6 derived populations of autofecundation successive starting from 3 populations base. In the case of the divergent selection , 20 populations were generated, being 10 resultants of the selection in favor of an allele A and 10 of the selection in against the specified allele, starting from a population base. After the obtaining of all the differentiation estimates among the populations based on the biometrics statistics tested it is ended that, for all the loci, in the case of the inbreeding, significant differentiation was not observed among the populations as it was used statistics GST, FST, and ANOVA. For the case of the divergent selection high differentiation interpopulational was observed for all the loci, with the use of statistics GST, FST, and ANOVA.Diversos métodos para estimar variação genética e de estrutura populacional já foram desenvolvidos, com aplicações variadas em níveis individuais, intrapopulacional e interpopulacional. Nestes estudos devem ser considerados os fatores responsáveis pela estruturação da variação genética ao nível populacional, quais sejam a deriva genética, o fluxo gênico, a mutação e a seleção. O objetivo deste trabalho foi, testar a eficiência de diferentes procedimentos biométricos dentre eles as estatísticas GST, FST, e ANOVA de freqüência gênica, em detectar diferenciação entre populações simuladas sob endogamia e seleção divergente. Para isto foram simuladas, no caso da endogamia, 6 populações derivadas de sucessivas autofecundações a partir de 3 populações base. E, no caso da seleção divergente, foram geradas 20 populações, sendo 10 resultantes da seleção a favor de um alelo A e 10 da seleção contra o alelo especificado, a partir de uma população base. Após a obtenção de todas as estimativas de diferenciação entre as populações baseadas nas estatísticas biométricas testadas conclui-se que, para todos os locos, no caso da endogamia, não observou-se diferenciação significativa entre as populações quanto se utilizou as estatísticas GST, FST, e ANOVA . Para o caso da seleção divergente observou-se alta diferenciação interpopulacional para todos os locos, com o uso das estatísticas GST, FST, e ANOVA.application/pdfporUniversidade Federal de ViçosaMestrado em Biologia Celular e EstruturalUFVBRAnálises quantitativas e moleculares do Genoma; Biologia das células e dos tecidosVariação genéticaEndogamiaSeleção divergenteGenetic variationInbreedingDivergent selectionCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALMedidas de diferenciação genética em populações simuladas sob endogamia e seleção divergenteMeasures of genetic differentiation in simulate populations under inbreeding and divergent selectioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf537040https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/2371/1/texto%20completo.pdf8d7187f72e80a4e6a630c7c07f8b5236MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain146623https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/2371/2/texto%20completo.pdf.txt70bc9b5d2f001c3f61ace6cd31763d1fMD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3744https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/2371/3/texto%20completo.pdf.jpg763562fc9a1b302ffd036776fd92d107MD53123456789/23712016-04-08 23:05:32.896oai:locus.ufv.br:123456789/2371Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-09T02:05:32LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false |
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