Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2013
Autor(a) principal: Costa, André Luis da, 1982-
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: [s.n.]
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1620589
Resumo: Orientador: Marco Antonio Garcia de Carvalho
id UNICAMP-30_0a5d1c08215e442da83ada63c374a3b9
oai_identifier_str oai::909115
network_acronym_str UNICAMP-30
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository_id_str
spelling Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentationNormalized cut on graphs : an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentationCorte normalizadoTeoria dos grafosSegmentação de imagensMicrobiologia - Cultura e meios de culturaNormalized cutGraph theoryImage segmentationMicrobiology - Culture media and cultureOrientador: Marco Antonio Garcia de CarvalhoDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de TecnologiaResumo: O problema de segmentação de colônias de bactérias em placas de Petri possui algumas características bem distintas daquelas encontradas, por exemplo, em problemas de segmentação de imagens naturais. A principal característica é o alto número de colônias que podem ser encontradas em uma placa. Desta forma, é primordial que o algoritmo de segmentação seja capaz de realizar a segmentação da imagem em um grande número de regiões. Este cenário extremo é ideal para analisar limitações dos algoritmos de segmentação. De fato, neste trabalho foi verificado que o algoritmo de corte normalizado original, que se fundamenta na teoria espectral de grafos, é inadequado para aplicações que exigem que a segmentação seja realizada em um grande número de regiões. Contudo, a utilização do critério de corte normalizado para segmentar imagens de colônias de bactérias ainda é possível graças a um novo algoritmo que está sendo introduzido neste trabalho. O novo algoritmo fundamenta-se no agrupamento hierárquico dos nós do grafo, ao invés de utilizar conceito da teoria espectral. Experimentos mostram também que o biparticionamento de um grafo pelo novo algoritmo apresenta um valor de corte normalizado médio cerca de 40 vezes menor que o biparticionamento pelo algoritmo baseado na teoria espectralAbstract: The problem of bacteria colonies segmentation in Petri dishes has some very different characteristics from those found, for example, in segmenting natural images. The main feature is the high number of colonies that can be found on a plate. Thus, it is essential that the segmentation algorithm is capable of performing the image segmentation into a huge number of regions. This extreme scenario is ideal for analyzing segmentation algorithms limitations. In fact, this study showed that the original normalized cut algorithm, which is based on the spectral graph theory, is inappropriate for applications that require that the segmentation be performed on a large number of regions. However, the use of normalized cut criteria for segmenting bacteria colonies images is still possible thanks to a new algorithm that is being introduced in this paper. The new algorithm is based on hierarchical clustering of the graph nodes, instead of using the spectral theory concepts. Experiments also show that the bi-partitioning of a graph by the new algorithm has a normalized cut average value about 40 times lesser than the bi-partitioning by the algorithm based on the spectral theoryMestradoTecnologia e InovaçãoMestre em Tecnologia[s.n.]Carvalho, Marco Antonio Garcia de, 1970-Papa, João PauloPedrini, HélioUniversidade Estadual de Campinas. Faculdade de TecnologiaPrograma de Pós-Graduação em TecnologiaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASCosta, André Luis da, 1982-2013info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf57 f. : il.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1620589COSTA, André Luis da. Corte normalizado em grafos: um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation. 2013. 57 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Tecnologia, Limeira, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1620589. Acesso em: 25 abr. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/909115porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2017-02-18T07:02:05Zoai::909115Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2017-02-18T07:02:05Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
dc.title.none.fl_str_mv Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
Normalized cut on graphs : an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
title Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
spellingShingle Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
Costa, André Luis da, 1982-
Corte normalizado
Teoria dos grafos
Segmentação de imagens
Microbiologia - Cultura e meios de cultura
Normalized cut
Graph theory
Image segmentation
Microbiology - Culture media and culture
title_short Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
title_full Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
title_fullStr Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
title_full_unstemmed Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
title_sort Corte normalizado em grafos : um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation
author Costa, André Luis da, 1982-
author_facet Costa, André Luis da, 1982-
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Carvalho, Marco Antonio Garcia de, 1970-
Papa, João Paulo
Pedrini, Hélio
Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Tecnologia
Programa de Pós-Graduação em Tecnologia
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
dc.contributor.author.fl_str_mv Costa, André Luis da, 1982-
dc.subject.por.fl_str_mv Corte normalizado
Teoria dos grafos
Segmentação de imagens
Microbiologia - Cultura e meios de cultura
Normalized cut
Graph theory
Image segmentation
Microbiology - Culture media and culture
topic Corte normalizado
Teoria dos grafos
Segmentação de imagens
Microbiologia - Cultura e meios de cultura
Normalized cut
Graph theory
Image segmentation
Microbiology - Culture media and culture
description Orientador: Marco Antonio Garcia de Carvalho
publishDate 2013
dc.date.none.fl_str_mv 2013
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12733/1620589
COSTA, André Luis da. Corte normalizado em grafos: um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation. 2013. 57 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Tecnologia, Limeira, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1620589. Acesso em: 25 abr. 2024.
url https://hdl.handle.net/20.500.12733/1620589
identifier_str_mv COSTA, André Luis da. Corte normalizado em grafos: um algoritmo aglomerativo para segmentação de imagens de colonias de bactérias= Normalized cut on graphs: an aglomerative algorithm for bacterial colonies image segmentation. 2013. 57 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Tecnologia, Limeira, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1620589. Acesso em: 25 abr. 2024.
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/909115
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
57 f. : il.
dc.publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron:UNICAMP
instname_str Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron_str UNICAMP
institution UNICAMP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.mail.fl_str_mv sbubd@unicamp.br
_version_ 1797405480476213248