Estudo e caracterização de peptídeos não-ribossomais produzidos por Streptomyces sp. CBMAI 2043 usando espectrometria de massas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Gonçalves, Ana Beatriz, 1994-
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: [s.n.]
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Espectrometria de massas
Metabólitos
Surugamida
Mass spectrometry
Metabolites
Surugamide
Link de acesso: https://hdl.handle.net/20.500.12733/8312
Resumo: Orientador: Daniel Fabio Kawano
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Além disso, o desenvolvimento da plataforma GNPS (Global Natural Products Social Molecular Networking) facilitou a correlação de moléculas e a descoberta de análogos estruturais. A linhagem de Streptomyces sp. CBMAI 2043 foi isolada de Citrus reticulata e o sequenciamento do genoma indicou a presença de 23 clusters biossintéticos, dentre os quais se encontram policetídeo sintases (PKS), peptídeo não ribossomal sintetase (NRPS), terpenos, sideróforos e lantipeptídeos. Neste trabalho realizou-se a exploração do metabolismo secundário da Streptomyces sp. CBMAI 2043 em busca de metabólitos e análogos cujo cluster está predito no genoma. Foram detectadas surugamidas e cinco novos análogos estruturais e algumas metodologias de clonagem foram usadas com a finalidade de confirmar a biossíntese dessas moléculas. Também buscou-se correlacionar o metabólito ao gene anotado como sendo gene das manopeptimicinas (cluster 12). Por fim, com a finalidade de atribuir o metabólito ao cluster 23, obteve-se um organismo heterólogo usando a linhagem S. coelicolor M1152 como hospedeiro, sendo possível relacionar o metabólito leucinostatina a esse clusterAbstract: Streptomyces are gram-positive actinobacteria that have high G+C content. These microorganisms, which are found in the most diverse environments, are extremely important, as more than 500 antibiotics are produced by Streptomyces strains.1 The advance of genome sequencing techniques, bioinformatics and editing tools of genes allowed to explore the secondary metabolism of different Streptomyces strains and other microorganisms. In addition, the development of the GNPS (Global Natural Products Molecular Networking) platform has facilitated the correlation of molecules and the discovery of structural analogs. The Streptomyces sp. CBMAI 2043 was isolated from Citrus reticulata and genome sequencing indicated the presence of 23 biosynthetic gene clusters, among which are polycetide synthasis (PKS), non-ribosomal peptide synthetase (NRPS), terpenes, siderophores and lantipeptides. In this work the exploitation of the secondary metabolism of Streptomyces sp. was performed. CBMAI 2043 in search of metabolites and analogues whose cluster is predicted in the genome. Surugamides were detected and five new structural analogs and some cloning methodologies were used to confirm the biosynthesis of these molecules. It was also sought to correlate the metabolite to the annotated gene as gene of mannopeptimycins (cluster 12). In order to assign the metabolite to cluster 23, a heterologist was obtained using the S. coelicolor M1152 host, and it is possible to relate the leucinostatin metabolite to this clusterDoutoradoQuímica OrgânicaDoutora em CiênciasCNPQ164664/2018-1[s.n.]Kawano, Daniel Fábio, 1980-Nunes, Paulo Sérgio GonçalvesAlves, Danilo AntoniniCatharino, Rodrigo RamosLancellotti, MarceloUniversidade Estadual de Campinas. Instituto de QuímicaPrograma de Pós-Graduação em QuímicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASGonçalves, Ana Beatriz, 1994-20222022-12-02T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf1 recurso online (69 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/8312GONÇALVES, Ana Beatriz. Estudo e caracterização de peptídeos não-ribossomais produzidos por Streptomyces sp. CBMAI 2043 usando espectrometria de massas. 2022. 1 recurso online (69 p.) Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/8312. Acesso em: 26 abr. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1266303porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-04-11T09:47:37Zoai::1266303Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2023-04-11T09:47:37Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
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