Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2010
Autor(a) principal: Kober, M?rcia de Vargas lattes
Orientador(a): Oliveira, Silvia Dias de lattes
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul
Programa de Pós-Graduação: Programa de P?s-Gradua??o em Biologia Celular e Molecular
Departamento: Faculdade de Bioci?ncias
País: BR
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5362
Resumo: A Salmonella Enteritidis ? uma das principais bact?rias causadoras de gastrenterite, tamb?m podendo ser respons?vel por doen?as sist?micas. A adequada caracteriza??o deste microrganismo ? essencial nos estudos epidemiol?gicos. Neste contexto, este estudo avaliou a utiliza??o de dois m?todos moleculares, Tipifica??o por Sequenciamento de M?ltiplos loci (MLST) e An?lise de Fragmentos Polim?rficos Amplificados e Fluorescentes (FAFLP), para a diferencia??o de 32 isolados de S. Enteritidis oriundos de diferentes fontes do sul do Brasil, bem como de cinco isolados de S. Enteritidis provenientes de outras ?reas geogr?ficas. Tamb?m foram inclu?dos neste estudo quatro isolados pertencentes a outros sorovares (S. Panama, S. Senftenberg, S. Typhimurium e Salmonella [4,5:-:1,2]. As duas t?cnicas escolhidas para este trabalho j? foram empregadas concomitantemente para analisar diferentes sorotipos de Salmonella, mas este estudo ? o primeiro a utiliz?-las para a diferencia??o de um mesmo grupo de isolados de S. Enteritidis. O esquema desenvolvido para o MLST incluiu a amplifica??o de fragmentos de dois genes constitutivos (hemD e mdh) combinado com dois genes de virul?ncia (ssaQ e slyA), aumentando, assim, a capacidade discriminat?ria do m?todo. Ambas as t?cnicas apresentaram altos ?ndices de poder discriminat?rio, calculados pelo ?ndice de diversidade de Simpson, 0,99 e 0,88 para FAFLP e MLST, respectivamente. Al?m disso, os m?todos avaliados tamb?m mostraram-se eficientes na discrimina??o de isolados de diferentes sorovares de Salmonella. Entretanto, a FAFLP e a MLST n?o foram capazes de diferenciar isolados provavelmente n?o relacionados epidemiologicamente, bem como n?o agruparam isolados pertencentes a um mesmo fagotipo. Desta forma, os resultados obtidos sugerem que ambas as t?cnicas podem ser ferramentas ?teis para a an?lise epidemiol?gica molecular de isolados de Salmonella, inclusive para um sorovar com grande homogeneidade gen?tica como a S. Enteritidis.
id P_RS_5ae249a6f5cd31d9d96676d8066a89c3
oai_identifier_str oai:tede2.pucrs.br:tede/5362
network_acronym_str P_RS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
repository_id_str
spelling Oliveira, Silvia Dias deCPF:73671495049http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761557Z7CPF:63124327004http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4798880J7Kober, M?rcia de Vargas2015-04-14T14:51:00Z2010-04-092010-01-22KOBER, M?rcia de Vargas. Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci). 2010. 77 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2010.http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5362Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 422149.pdf: 415747 bytes, checksum: c509f9409deb999a7bde0e7f31c283e9 (MD5) Previous issue date: 2010-01-22A Salmonella Enteritidis ? uma das principais bact?rias causadoras de gastrenterite, tamb?m podendo ser respons?vel por doen?as sist?micas. A adequada caracteriza??o deste microrganismo ? essencial nos estudos epidemiol?gicos. Neste contexto, este estudo avaliou a utiliza??o de dois m?todos moleculares, Tipifica??o por Sequenciamento de M?ltiplos loci (MLST) e An?lise de Fragmentos Polim?rficos Amplificados e Fluorescentes (FAFLP), para a diferencia??o de 32 isolados de S. Enteritidis oriundos de diferentes fontes do sul do Brasil, bem como de cinco isolados de S. Enteritidis provenientes de outras ?reas geogr?ficas. Tamb?m foram inclu?dos neste estudo quatro isolados pertencentes a outros sorovares (S. Panama, S. Senftenberg, S. Typhimurium e Salmonella [4,5:-:1,2]. As duas t?cnicas escolhidas para este trabalho j? foram empregadas concomitantemente para analisar diferentes sorotipos de Salmonella, mas este estudo ? o primeiro a utiliz?-las para a diferencia??o de um mesmo grupo de isolados de S. Enteritidis. O esquema desenvolvido para o MLST incluiu a amplifica??o de fragmentos de dois genes constitutivos (hemD e mdh) combinado com dois genes de virul?ncia (ssaQ e slyA), aumentando, assim, a capacidade discriminat?ria do m?todo. Ambas as t?cnicas apresentaram altos ?ndices de poder discriminat?rio, calculados pelo ?ndice de diversidade de Simpson, 0,99 e 0,88 para FAFLP e MLST, respectivamente. Al?m disso, os m?todos avaliados tamb?m mostraram-se eficientes na discrimina??o de isolados de diferentes sorovares de Salmonella. Entretanto, a FAFLP e a MLST n?o foram capazes de diferenciar isolados provavelmente n?o relacionados epidemiologicamente, bem como n?o agruparam isolados pertencentes a um mesmo fagotipo. Desta forma, os resultados obtidos sugerem que ambas as t?cnicas podem ser ferramentas ?teis para a an?lise epidemiol?gica molecular de isolados de Salmonella, inclusive para um sorovar com grande homogeneidade gen?tica como a S. Enteritidis.application/pdfhttp://tede2.pucrs.br:80/tede2/retrieve/16211/422149.pdf.jpgporPontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do SulPrograma de P?s-Gradua??o em Biologia Celular e MolecularPUCRSBRFaculdade de Bioci?nciasBIOLOGIA MOLECULARBACT?RIASEPIDEMIOLOGIACNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALDiversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis819824693009663736060060036528317262667714info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RSinstname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)instacron:PUC_RSTHUMBNAIL422149.pdf.jpg422149.pdf.jpgimage/jpeg4040http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5362/3/422149.pdf.jpg97981c90e700fe5e816441986ebbedd3MD53TEXT422149.pdf.txt422149.pdf.txttext/plain116471http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5362/2/422149.pdf.txt572a78aa229ea242cc488cb929a4a017MD52ORIGINAL422149.pdfapplication/pdf415747http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5362/1/422149.pdfc509f9409deb999a7bde0e7f31c283e9MD51tede/53622015-05-14 11:40:29.856oai:tede2.pucrs.br:tede/5362Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucrs.br/tede2/PRIhttps://tede2.pucrs.br/oai/requestbiblioteca.central@pucrs.br||opendoar:2015-05-14T14:40:29Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)false
dc.title.por.fl_str_mv Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
title Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
spellingShingle Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
Kober, M?rcia de Vargas
BIOLOGIA MOLECULAR
BACT?RIAS
EPIDEMIOLOGIA
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
title_short Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
title_full Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
title_fullStr Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
title_full_unstemmed Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
title_sort Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci)
author Kober, M?rcia de Vargas
author_facet Kober, M?rcia de Vargas
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Oliveira, Silvia Dias de
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv CPF:73671495049
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761557Z7
dc.contributor.authorID.fl_str_mv CPF:63124327004
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4798880J7
dc.contributor.author.fl_str_mv Kober, M?rcia de Vargas
contributor_str_mv Oliveira, Silvia Dias de
dc.subject.por.fl_str_mv BIOLOGIA MOLECULAR
BACT?RIAS
EPIDEMIOLOGIA
topic BIOLOGIA MOLECULAR
BACT?RIAS
EPIDEMIOLOGIA
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
description A Salmonella Enteritidis ? uma das principais bact?rias causadoras de gastrenterite, tamb?m podendo ser respons?vel por doen?as sist?micas. A adequada caracteriza??o deste microrganismo ? essencial nos estudos epidemiol?gicos. Neste contexto, este estudo avaliou a utiliza??o de dois m?todos moleculares, Tipifica??o por Sequenciamento de M?ltiplos loci (MLST) e An?lise de Fragmentos Polim?rficos Amplificados e Fluorescentes (FAFLP), para a diferencia??o de 32 isolados de S. Enteritidis oriundos de diferentes fontes do sul do Brasil, bem como de cinco isolados de S. Enteritidis provenientes de outras ?reas geogr?ficas. Tamb?m foram inclu?dos neste estudo quatro isolados pertencentes a outros sorovares (S. Panama, S. Senftenberg, S. Typhimurium e Salmonella [4,5:-:1,2]. As duas t?cnicas escolhidas para este trabalho j? foram empregadas concomitantemente para analisar diferentes sorotipos de Salmonella, mas este estudo ? o primeiro a utiliz?-las para a diferencia??o de um mesmo grupo de isolados de S. Enteritidis. O esquema desenvolvido para o MLST incluiu a amplifica??o de fragmentos de dois genes constitutivos (hemD e mdh) combinado com dois genes de virul?ncia (ssaQ e slyA), aumentando, assim, a capacidade discriminat?ria do m?todo. Ambas as t?cnicas apresentaram altos ?ndices de poder discriminat?rio, calculados pelo ?ndice de diversidade de Simpson, 0,99 e 0,88 para FAFLP e MLST, respectivamente. Al?m disso, os m?todos avaliados tamb?m mostraram-se eficientes na discrimina??o de isolados de diferentes sorovares de Salmonella. Entretanto, a FAFLP e a MLST n?o foram capazes de diferenciar isolados provavelmente n?o relacionados epidemiologicamente, bem como n?o agruparam isolados pertencentes a um mesmo fagotipo. Desta forma, os resultados obtidos sugerem que ambas as t?cnicas podem ser ferramentas ?teis para a an?lise epidemiol?gica molecular de isolados de Salmonella, inclusive para um sorovar com grande homogeneidade gen?tica como a S. Enteritidis.
publishDate 2010
dc.date.available.fl_str_mv 2010-04-09
dc.date.issued.fl_str_mv 2010-01-22
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-04-14T14:51:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv KOBER, M?rcia de Vargas. Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci). 2010. 77 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2010.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5362
identifier_str_mv KOBER, M?rcia de Vargas. Diversidade gen?tica de isolados de Salmonella Enteritidis avaliada por FAFLP (An?lise de fragmentos polim?rficos amplificados e fluorescentes) e MLST (Tipifica??o por sequenciamento de m?ltiplos loci). 2010. 77 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2010.
url http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5362
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.program.fl_str_mv 8198246930096637360
dc.relation.confidence.fl_str_mv 600
600
dc.relation.department.fl_str_mv 36528317262667714
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de P?s-Gradua??o em Biologia Celular e Molecular
dc.publisher.initials.fl_str_mv PUCRS
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Faculdade de Bioci?ncias
publisher.none.fl_str_mv Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
instacron:PUC_RS
instname_str Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
instacron_str PUC_RS
institution PUC_RS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
bitstream.url.fl_str_mv http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5362/3/422149.pdf.jpg
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5362/2/422149.pdf.txt
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5362/1/422149.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 97981c90e700fe5e816441986ebbedd3
572a78aa229ea242cc488cb929a4a017
c509f9409deb999a7bde0e7f31c283e9
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
repository.mail.fl_str_mv biblioteca.central@pucrs.br||
_version_ 1796793209362317312