ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2014
Autor(a) principal: Boreiko, Sheila lattes
Orientador(a): Iulek, Jorge lattes
Banca de defesa: Marques, Mariza Boscacci lattes, Silber, Ariel Mariano lattes
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Química Aplicada
Departamento: Química
País: BR
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/2126
Resumo: Chagas' disease, caused by the protozoan Trypanosoma cruzi, is one of the seventeen neglected diseases according to World Health Organization. In the last two decades, this parasite specific metabolic pathways have been evaluated as therapeutic targets, making the prospect for the development of more specific and less toxic drugs. To achieve this goal, there is the need for studies to get knowledge on the pathway protein three dimensional structures.Protein structures can be studied experimentally by the X ray diffraction technique and computationally by homology modeling, however, other structural information can also be obtained by spectroscopic techniques. Thus, in this work, structural studies of the enzyme Urocanate Hydratase from Trypanosoma cruzi (TcUH), which participates in the histidine metabolic pathway, were carried out. The enzyme was expressed functionally in E. coli and,by affinity chromatography, effectively purified and crystallized, however, no minimum quality for X-ray diffraction was observed. Thus, we carried out the structural study by circular dichroism (CD), small angle X-ray scattering (SAXS) and homology modeling. The TcUH is mainly composed of α-helices and its denaturation process by temperature starts near 50 ° C, being irreversible after completed. The SAXS study indicated that the protein in solution was not monomeric. With the homology produced model, docking studies indicated that some promising molecules to be carefully studied for possible inhibition tests.
id UEPG_e5c2b38eaaacd224411ac1dc0bcfca9e
oai_identifier_str oai:tede2.uepg.br:prefix/2126
network_acronym_str UEPG
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG
repository_id_str
spelling Iulek, JorgeCPF:05870302838http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4762264Y2Silva, Marcia daCPF:09761680819http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4796058A2Marques, Mariza BoscacciCPF:26387247004http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727372D5Silber, Ariel MarianoCPF:22728106835http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4702318A3CPF:05239171980http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4408424Y9Boreiko, Sheila2017-07-24T19:38:13Z2014-07-142017-07-24T19:38:13Z2014-03-26BOREIKO, Sheila. ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS. 2014. 71 f. Dissertação (Mestrado em Química) - UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA, Ponta Grossa, 2014.http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/2126Chagas' disease, caused by the protozoan Trypanosoma cruzi, is one of the seventeen neglected diseases according to World Health Organization. In the last two decades, this parasite specific metabolic pathways have been evaluated as therapeutic targets, making the prospect for the development of more specific and less toxic drugs. To achieve this goal, there is the need for studies to get knowledge on the pathway protein three dimensional structures.Protein structures can be studied experimentally by the X ray diffraction technique and computationally by homology modeling, however, other structural information can also be obtained by spectroscopic techniques. Thus, in this work, structural studies of the enzyme Urocanate Hydratase from Trypanosoma cruzi (TcUH), which participates in the histidine metabolic pathway, were carried out. The enzyme was expressed functionally in E. coli and,by affinity chromatography, effectively purified and crystallized, however, no minimum quality for X-ray diffraction was observed. Thus, we carried out the structural study by circular dichroism (CD), small angle X-ray scattering (SAXS) and homology modeling. The TcUH is mainly composed of α-helices and its denaturation process by temperature starts near 50 ° C, being irreversible after completed. The SAXS study indicated that the protein in solution was not monomeric. With the homology produced model, docking studies indicated that some promising molecules to be carefully studied for possible inhibition tests.A doença de Chagas, causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, é uma das dezessete doenças negligenciadas de acordo com a Organização Mundial de Saúde. Nas últimas duas décadas, vias metabólicas específicas deste parasita têm sido avaliadas como alvos terapêuticos, o que abre perspectivas para o desenvolvimento de medicamentos mais específicos e menos tóxicos. Para alcançar este objetivo, há a necessidade de estudos para conhecimento da estrutura tridimensional de proteínas que fazem parte destas vias. As estruturas das proteínas podem ser estudadas experimentalmente pela técnica de difração de raios X e computacionalmente pela modelagem por homologia, porém, outras informações estruturais também podem ser obtidas por técnicas espectroscópicas. Sendo assim, realizaramse, neste trabalho, estudos estruturais com a enzima Urocanato Hidratase de Trypanosoma cruzi (TcUH), que participa da via metabólica da histina. A enzima foi expressa em E. coli de forma funcional e, por meio de cromatografia de afinidade, purificada efetivamente e cristalizada, porém, não apresentou qualidade mínima para análise por difração de raios X. Assim, realizou-se o estudo estrutural por meio de dicroísmo circular (CD), espalhamento de raios X a baixo ângulo (SAXS) e modelagem por homologia. A TcUH é constituída majoritariamente por hélices-α e seu processo de desnaturação térmica inicia-se próximo a 50 °C, sendo irreversível após completa. O estudo de SAXS indicou que em solução a enzima não se apresenta monomérica. Com o modelo produzido por homologia, que apresentou razoáveis índices de qualidade, os estudos de docagem indicaram algumas moléculas promissoras que deverão ser estudadas criteriosamente para possíveis testes de inibição.Made available in DSpace on 2017-07-24T19:38:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 SHEILA BOREIKO.pdf: 2469578 bytes, checksum: d94618ec9a9eb25acc74ab5a7a6ca5d3 (MD5) Previous issue date: 2014-03-26Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Paranáapplication/pdfporUNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSAPrograma de Pós-Graduação em Química AplicadaUEPGBRQuímicaestruturas de proteínasUrocanato hidrataseTrypanosoma cruzimodelagem estruturalprotein structuresUrocanate hydratasetrypanosoma cruziStructural modelingCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICAESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAISinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPGinstname:Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)instacron:UEPGORIGINALSHEILA BOREIKO.pdfapplication/pdf2469578http://tede2.uepg.br/jspui/bitstream/prefix/2126/1/SHEILA%20BOREIKO.pdfd94618ec9a9eb25acc74ab5a7a6ca5d3MD51prefix/21262017-07-24 16:38:13.089oai:tede2.uepg.br:prefix/2126Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://tede2.uepg.br/jspui/PUBhttp://tede2.uepg.br/oai/requestbicen@uepg.br||mv_fidelis@yahoo.com.bropendoar:2017-07-24T19:38:13Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG - Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)false
dc.title.por.fl_str_mv ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
title ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
spellingShingle ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
Boreiko, Sheila
estruturas de proteínas
Urocanato hidratase
Trypanosoma cruzi
modelagem estrutural
protein structures
Urocanate hydratase
trypanosoma cruzi
Structural modeling
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
title_short ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
title_full ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
title_fullStr ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
title_full_unstemmed ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
title_sort ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS
author Boreiko, Sheila
author_facet Boreiko, Sheila
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Iulek, Jorge
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv CPF:05870302838
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4762264Y2
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Silva, Marcia da
dc.contributor.advisor-co1ID.fl_str_mv CPF:09761680819
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4796058A2
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Marques, Mariza Boscacci
dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv CPF:26387247004
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727372D5
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Silber, Ariel Mariano
dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv CPF:22728106835
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4702318A3
dc.contributor.authorID.fl_str_mv CPF:05239171980
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4408424Y9
dc.contributor.author.fl_str_mv Boreiko, Sheila
contributor_str_mv Iulek, Jorge
Silva, Marcia da
Marques, Mariza Boscacci
Silber, Ariel Mariano
dc.subject.por.fl_str_mv estruturas de proteínas
Urocanato hidratase
Trypanosoma cruzi
modelagem estrutural
topic estruturas de proteínas
Urocanato hidratase
Trypanosoma cruzi
modelagem estrutural
protein structures
Urocanate hydratase
trypanosoma cruzi
Structural modeling
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
dc.subject.eng.fl_str_mv protein structures
Urocanate hydratase
trypanosoma cruzi
Structural modeling
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA
description Chagas' disease, caused by the protozoan Trypanosoma cruzi, is one of the seventeen neglected diseases according to World Health Organization. In the last two decades, this parasite specific metabolic pathways have been evaluated as therapeutic targets, making the prospect for the development of more specific and less toxic drugs. To achieve this goal, there is the need for studies to get knowledge on the pathway protein three dimensional structures.Protein structures can be studied experimentally by the X ray diffraction technique and computationally by homology modeling, however, other structural information can also be obtained by spectroscopic techniques. Thus, in this work, structural studies of the enzyme Urocanate Hydratase from Trypanosoma cruzi (TcUH), which participates in the histidine metabolic pathway, were carried out. The enzyme was expressed functionally in E. coli and,by affinity chromatography, effectively purified and crystallized, however, no minimum quality for X-ray diffraction was observed. Thus, we carried out the structural study by circular dichroism (CD), small angle X-ray scattering (SAXS) and homology modeling. The TcUH is mainly composed of α-helices and its denaturation process by temperature starts near 50 ° C, being irreversible after completed. The SAXS study indicated that the protein in solution was not monomeric. With the homology produced model, docking studies indicated that some promising molecules to be carefully studied for possible inhibition tests.
publishDate 2014
dc.date.available.fl_str_mv 2014-07-14
2017-07-24T19:38:13Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-03-26
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-07-24T19:38:13Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv BOREIKO, Sheila. ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS. 2014. 71 f. Dissertação (Mestrado em Química) - UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA, Ponta Grossa, 2014.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/2126
identifier_str_mv BOREIKO, Sheila. ESTUDOS ESTRUTURAIS DA UROCANATO HIDRATASE DE Trypanosoma cruzi POR MÉTODOS EXPERIMENTAIS E COMPUTACIONAIS. 2014. 71 f. Dissertação (Mestrado em Química) - UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA, Ponta Grossa, 2014.
url http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/2126
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Química Aplicada
dc.publisher.initials.fl_str_mv UEPG
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Química
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG
instname:Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)
instacron:UEPG
instname_str Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)
instacron_str UEPG
institution UEPG
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG
bitstream.url.fl_str_mv http://tede2.uepg.br/jspui/bitstream/prefix/2126/1/SHEILA%20BOREIKO.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv d94618ec9a9eb25acc74ab5a7a6ca5d3
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG - Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG)
repository.mail.fl_str_mv bicen@uepg.br||mv_fidelis@yahoo.com.br
_version_ 1797039581644718080