Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil
| Ano de defesa: | 2020 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Fiocruz/IRR
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Link de acesso: | https://arca.fiocruz.br/handle/icict/49745 |
Resumo: | O subgênero Evandromyia (Aldamyia) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) possui 15 espécies formalmente descritas por caracteres morfológicos, além de uma espécie cujo nome não atende o princípio de nomenclatura binomial (artigos 5.1 e 11.4, ICZN). Por conta da complexidade da identificação morfológica desses insetos, métodos moleculares podem ser utilizados de forma integrativa para elucidar sua correta identificação, como é o caso da amplificação e análise do DNA Barcoding (fragmento do gene citocromo oxidase subunidade I – coI). Três das espécies desse subgênero – E. carmelinoi, E. evandroi e E. lenti – não são corretamente delimitadas pelo gene coI. Logo, nesse estudo foi avaliada a utilidade da taxonomia molecular para a identificação de espécies desse subgênero, incluindo a análise de marcadores suplementares ao COI, bem como a utilização de métodos sofisticados de delimitação de espécies "multilocus". Para isso, foram analisadas sequencias do gene COI de 10 morfoespécies, além de sequencias dos genes CYTB, CAC, PER e rDNA 28S para três espécies indistinguíveis pelo COI, provenientes de 11 localidades do Brasil. Foram combinadas ao nosso conjunto de dados 44 "barcodes" de COI previamente publicadas, que foram analisadas pelos critérios de similaridade de sequencias "best-match", enquanto quatro diferentes métodos de delimitação de espécies "single-locus" (ABGD, GMYC, PTP e TCS) foram utilizados para inferir unidades taxonômicas operacionais (OTUs). A utilidade de marcadores suplementares na delimitação de espécies pelo COI foi conduzida pelo método "multilocus" de coalescência de múltiplas espécies (MSC) no programa BPP. De forma geral, seis das morfoespécies analisadas foram corretamente delimitadas pelos "barcodes", formando clados bem apoiados pelas análises filogenéticas e inferência de OTUs, enquanto outras quatro – E. carmelinoi, E. evandroi, E. lenti e E. piperiformis – formaram um único clado/OTU bem apoiado. Apesar de E. carmelinoi, E. evandroi e E. lenti serem indistinguíveis por sequencias de COI, E. piperiformis formou um clado único, e pode ser corretamente identificado pelos critérios de "best-match". A análise dos marcadores suplementares CYTB, CAC, PER e 28S não foram suficientes para delimitar corretamente as três espécies indistinguíveis pelo COI, mas ao analisadas por métodos "multilocus" foram capazes para delimitar E. evandroi como uma espécie distinta de E. carmelinoi/E. lenti. Apesar das nítidas diferenças morfológicas, essas quatro últimas espécies não podem ser identificadas como táxons distintos na maioria das análises moleculares, e por conta disso propomos que devam ser consideradas como membros de um complexo de espécies recentes (complexo Evandro). |
| id |
CRUZ_6db00d8cd3ed306d92c8c99e57b0d177 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:arca.fiocruz.br:icict/49745 |
| network_acronym_str |
CRUZ |
| network_name_str |
Repositório Institucional da Fiocruz (ARCA) |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Rodrigues, Bruno LeiteShimabukuro, Paloma Helena FernandesHaseyama, Kirstern Lica FollmannCaldeira, Roberta LimaShimabukuro, Paloma Helena Fernandes2021-11-09T17:21:15Z2021-11-09T17:21:15Z2020RODRIGUES, Bruno Leite. Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil. 2020. 71 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde - Área de concentração Transmissores de Patogénos)-Instituto René Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Belo Horizonte, 2020.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/49745O subgênero Evandromyia (Aldamyia) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) possui 15 espécies formalmente descritas por caracteres morfológicos, além de uma espécie cujo nome não atende o princípio de nomenclatura binomial (artigos 5.1 e 11.4, ICZN). Por conta da complexidade da identificação morfológica desses insetos, métodos moleculares podem ser utilizados de forma integrativa para elucidar sua correta identificação, como é o caso da amplificação e análise do DNA Barcoding (fragmento do gene citocromo oxidase subunidade I – coI). Três das espécies desse subgênero – E. carmelinoi, E. evandroi e E. lenti – não são corretamente delimitadas pelo gene coI. Logo, nesse estudo foi avaliada a utilidade da taxonomia molecular para a identificação de espécies desse subgênero, incluindo a análise de marcadores suplementares ao COI, bem como a utilização de métodos sofisticados de delimitação de espécies "multilocus". Para isso, foram analisadas sequencias do gene COI de 10 morfoespécies, além de sequencias dos genes CYTB, CAC, PER e rDNA 28S para três espécies indistinguíveis pelo COI, provenientes de 11 localidades do Brasil. Foram combinadas ao nosso conjunto de dados 44 "barcodes" de COI previamente publicadas, que foram analisadas pelos critérios de similaridade de sequencias "best-match", enquanto quatro diferentes métodos de delimitação de espécies "single-locus" (ABGD, GMYC, PTP e TCS) foram utilizados para inferir unidades taxonômicas operacionais (OTUs). A utilidade de marcadores suplementares na delimitação de espécies pelo COI foi conduzida pelo método "multilocus" de coalescência de múltiplas espécies (MSC) no programa BPP. De forma geral, seis das morfoespécies analisadas foram corretamente delimitadas pelos "barcodes", formando clados bem apoiados pelas análises filogenéticas e inferência de OTUs, enquanto outras quatro – E. carmelinoi, E. evandroi, E. lenti e E. piperiformis – formaram um único clado/OTU bem apoiado. Apesar de E. carmelinoi, E. evandroi e E. lenti serem indistinguíveis por sequencias de COI, E. piperiformis formou um clado único, e pode ser corretamente identificado pelos critérios de "best-match". A análise dos marcadores suplementares CYTB, CAC, PER e 28S não foram suficientes para delimitar corretamente as três espécies indistinguíveis pelo COI, mas ao analisadas por métodos "multilocus" foram capazes para delimitar E. evandroi como uma espécie distinta de E. carmelinoi/E. lenti. Apesar das nítidas diferenças morfológicas, essas quatro últimas espécies não podem ser identificadas como táxons distintos na maioria das análises moleculares, e por conta disso propomos que devam ser consideradas como membros de um complexo de espécies recentes (complexo Evandro).The subgenus Evandromyia (Aldamyia) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) has 15 species formally described by morphological characters, in addition, one species does not comply with the Principle of Binominal Nomenclature (articles 5.1 and 11.4, ICZN). Due to the complexity of the morphological identification of these insects, molecular methods may be used in an integrative way to elucidate their correct identification, such as the amplification and analysis of DNA Barcoding (a fragment of the gene cytochrome oxidase subunit I - COI). Three species of this subgenus – E. carmelinoi, E. evandroi and E. lenti – are not correctly delimited by COI-barcodes. Therefore, this study evaluated the usefulness of molecular taxonomy for the identification of Evandromyia (Aldamyia) species, including the analysis of supplementary markers to COI, as well as the use of sophisticated multilocus species delimitation methods. For this, we analyzed COI sequences of 10 morphospecies, as well as sequences of the CYTB, CAC, PER and rDNA 28S genes for three species indistinguishable by COI from 11 localities in Brazil. Forty-four previously published COIbarcodes were combined with our dataset, which were analyzed by the best-match sequence similarity criteria, while four different single-locus species delimitation methods (ABGD, GMYC, PTP and TCS) were used to infer operational taxonomic units (OTUs). The usefulness of supplemental markers in species delimitation was also conducted by the multispecies coalescent (MSC) method in the BPP software. Overall, 6 of the morphospecies were congruent with both the well-supported clades identified by phylogenetic analysis and the OTUs inferred by species delimitation, while the remaining 4 morphospecies – E. carmelinoi, E. evandroi, E. lenti and E. piperiformis – were merged into a single well-supported clade/MOTU. Although E. carmelinoi, E. evandroi, E. lenti were indistinguishable using COI DNA barcodes, E. piperiformis did form a distinct phylogenetic cluster and could be correctly identified using best-match criteria. The analysis of the other markers CYTB, CAC, PER and 28S were insufficient to correctly identify the three species indistinguishable by COI, but when analyzed by multilocus methods were sufficient to delimit E. evandroi as a distinct species of E. carmelinoi / E. lenti. Despite the clear morphological differences, these last four species cannot be delimited as distinct taxa in most of the molecular analyzes, and we therefore propose that they should be considered as members of a recently-diverged species complex (evandroi complex).Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte, MG, Brasil.porFiocruz/IRRDNA barcodingFilogenéticaFlebotomíneosComplexo de espéciesDelimitação de espéciesMultilocusCoalescênciaDNA barcodingSand flyPhylogeneticsSpecies delimitationSpecies complexTaxonomyMulti-species coalescentDNA/classificaçãoEvolução biológicaPhlebotominaeTipagem de Sequência MultilocusTaxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2020Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidsade Federal de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, BrasilMestrado AcadêmicoBelo Horizonte/MGPrograma de Pós-Graduação em Ciências da Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83082https://arca.fiocruz.br/bitstreams/e975c3f3-c7ad-40c0-8988-f63c25fb5126/download9193a7c197bc67acd023525e72a03240MD51falseAnonymousREADORIGINALD_2020_Bruno Leite Rodrigues.pdfD_2020_Bruno Leite Rodrigues.pdfapplication/pdf2737097https://arca.fiocruz.br/bitstreams/c3151b34-cc62-4f8f-8822-af911bf9c921/download6448deabf54c7b34ed0161ef86fc1a68MD52trueAnonymousREADTEXTD_2020_Bruno Leite Rodrigues.pdf.txtD_2020_Bruno Leite Rodrigues.pdf.txtExtracted texttext/plain103047https://arca.fiocruz.br/bitstreams/a0959e39-5b81-4ef6-9788-ac4f1e06df17/downloadbb797a0748c6cd3980b09e201fa3cc30MD57falseAnonymousREADTHUMBNAILD_2020_Bruno Leite Rodrigues.pdf.jpgD_2020_Bruno Leite Rodrigues.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg14377https://arca.fiocruz.br/bitstreams/385ba61f-53d0-4249-afa7-b3ae5cb3ab9c/downloadca50a51036363bf90328cac687985590MD58falseAnonymousREADicict/497452025-12-11 08:19:53.729open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/49745https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:19:53Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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 |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil |
| title |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil |
| spellingShingle |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil Rodrigues, Bruno Leite DNA barcoding Filogenética Flebotomíneos Complexo de espécies Delimitação de espécies Multilocus Coalescência DNA barcoding Sand fly Phylogenetics Species delimitation Species complex Taxonomy Multi-species coalescent DNA/classificação Evolução biológica Phlebotominae Tipagem de Sequência Multilocus |
| title_short |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil |
| title_full |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil |
| title_fullStr |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil |
| title_full_unstemmed |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil |
| title_sort |
Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil |
| author |
Rodrigues, Bruno Leite |
| author_facet |
Rodrigues, Bruno Leite |
| author_role |
author |
| dc.contributor.member.none.fl_str_mv |
Shimabukuro, Paloma Helena Fernandes Haseyama, Kirstern Lica Follmann Caldeira, Roberta Lima |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Rodrigues, Bruno Leite |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Shimabukuro, Paloma Helena Fernandes |
| contributor_str_mv |
Shimabukuro, Paloma Helena Fernandes |
| dc.subject.other.none.fl_str_mv |
DNA barcoding Filogenética Flebotomíneos Complexo de espécies Delimitação de espécies Multilocus Coalescência |
| topic |
DNA barcoding Filogenética Flebotomíneos Complexo de espécies Delimitação de espécies Multilocus Coalescência DNA barcoding Sand fly Phylogenetics Species delimitation Species complex Taxonomy Multi-species coalescent DNA/classificação Evolução biológica Phlebotominae Tipagem de Sequência Multilocus |
| dc.subject.en.none.fl_str_mv |
DNA barcoding Sand fly Phylogenetics Species delimitation Species complex Taxonomy Multi-species coalescent |
| dc.subject.decs.none.fl_str_mv |
DNA/classificação Evolução biológica Phlebotominae Tipagem de Sequência Multilocus |
| description |
O subgênero Evandromyia (Aldamyia) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) possui 15 espécies formalmente descritas por caracteres morfológicos, além de uma espécie cujo nome não atende o princípio de nomenclatura binomial (artigos 5.1 e 11.4, ICZN). Por conta da complexidade da identificação morfológica desses insetos, métodos moleculares podem ser utilizados de forma integrativa para elucidar sua correta identificação, como é o caso da amplificação e análise do DNA Barcoding (fragmento do gene citocromo oxidase subunidade I – coI). Três das espécies desse subgênero – E. carmelinoi, E. evandroi e E. lenti – não são corretamente delimitadas pelo gene coI. Logo, nesse estudo foi avaliada a utilidade da taxonomia molecular para a identificação de espécies desse subgênero, incluindo a análise de marcadores suplementares ao COI, bem como a utilização de métodos sofisticados de delimitação de espécies "multilocus". Para isso, foram analisadas sequencias do gene COI de 10 morfoespécies, além de sequencias dos genes CYTB, CAC, PER e rDNA 28S para três espécies indistinguíveis pelo COI, provenientes de 11 localidades do Brasil. Foram combinadas ao nosso conjunto de dados 44 "barcodes" de COI previamente publicadas, que foram analisadas pelos critérios de similaridade de sequencias "best-match", enquanto quatro diferentes métodos de delimitação de espécies "single-locus" (ABGD, GMYC, PTP e TCS) foram utilizados para inferir unidades taxonômicas operacionais (OTUs). A utilidade de marcadores suplementares na delimitação de espécies pelo COI foi conduzida pelo método "multilocus" de coalescência de múltiplas espécies (MSC) no programa BPP. De forma geral, seis das morfoespécies analisadas foram corretamente delimitadas pelos "barcodes", formando clados bem apoiados pelas análises filogenéticas e inferência de OTUs, enquanto outras quatro – E. carmelinoi, E. evandroi, E. lenti e E. piperiformis – formaram um único clado/OTU bem apoiado. Apesar de E. carmelinoi, E. evandroi e E. lenti serem indistinguíveis por sequencias de COI, E. piperiformis formou um clado único, e pode ser corretamente identificado pelos critérios de "best-match". A análise dos marcadores suplementares CYTB, CAC, PER e 28S não foram suficientes para delimitar corretamente as três espécies indistinguíveis pelo COI, mas ao analisadas por métodos "multilocus" foram capazes para delimitar E. evandroi como uma espécie distinta de E. carmelinoi/E. lenti. Apesar das nítidas diferenças morfológicas, essas quatro últimas espécies não podem ser identificadas como táxons distintos na maioria das análises moleculares, e por conta disso propomos que devam ser consideradas como membros de um complexo de espécies recentes (complexo Evandro). |
| publishDate |
2020 |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2020 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2021-11-09T17:21:15Z |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2021-11-09T17:21:15Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
RODRIGUES, Bruno Leite. Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil. 2020. 71 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde - Área de concentração Transmissores de Patogénos)-Instituto René Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Belo Horizonte, 2020. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://arca.fiocruz.br/handle/icict/49745 |
| identifier_str_mv |
RODRIGUES, Bruno Leite. Taxonomia integrativa de espécies do subgênero Evandromyia (Aldamyia) Galati, 2003 (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) do Brasil. 2020. 71 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde - Área de concentração Transmissores de Patogénos)-Instituto René Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Belo Horizonte, 2020. |
| url |
https://arca.fiocruz.br/handle/icict/49745 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Fiocruz/IRR |
| publisher.none.fl_str_mv |
Fiocruz/IRR |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) instacron:FIOCRUZ |
| instname_str |
Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
| instacron_str |
FIOCRUZ |
| institution |
FIOCRUZ |
| reponame_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
| collection |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/e975c3f3-c7ad-40c0-8988-f63c25fb5126/download https://arca.fiocruz.br/bitstreams/c3151b34-cc62-4f8f-8822-af911bf9c921/download https://arca.fiocruz.br/bitstreams/a0959e39-5b81-4ef6-9788-ac4f1e06df17/download https://arca.fiocruz.br/bitstreams/385ba61f-53d0-4249-afa7-b3ae5cb3ab9c/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
9193a7c197bc67acd023525e72a03240 6448deabf54c7b34ed0161ef86fc1a68 bb797a0748c6cd3980b09e201fa3cc30 ca50a51036363bf90328cac687985590 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.arca@fiocruz.br |
| _version_ |
1855588555424792576 |