Estudo comparativo do microbioma de duas lagoas do Pantanal Sul-Mato-Grossense através de metagenômica shotgun

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: Farias, Carine Linda Moura de
• Orientador(a): Fonseca, Rodrigo Jardim Monteiro da
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Fiocruz/IOC
• Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/71437
• topic: Pantanal; Metagenoma; MetaWRAP; Microbioma; Shotgun; Pantanal; Metagenome; MetaWRAP; Microbiome; Shotgun; Áreas Alagadas; Metagenoma; Microbiota; Sequenciamento Shotgun; 06 Água potável e saneamento; 09 Indústria, inovação e infraestrutura; 13 Ação contra a mudança global do clima; 14 Vida na água; 15 Vida terrestre

O Pantanal, a maior área inundável do mundo, abrange Bolívia, Paraguai e Brasil, sendo este último detentor de 78% da região. Reconhecido como Reserva da Biosfera pela UNESCO, o Pantanal enfrenta desafios ambientais, incluindo incêndios e a disseminação da planta aquática Eichhornia crassipes, conhecida como camalote. Embora o camalote tenha potencial bioenergético e purificação de água, seu crescimento descontrolado pode afetar negativamente a biodiversidade. O estudo, focado no Pantanal Sul-Mato-Grossense, destaca a pecuária como atividade econômica predominante em Mato Grosso do Sul, que abrange 65% do Pantanal. Incêndios frequentes, muitos causados por ações humanas, e a degradação florestal ameaçam esse ecossistema essencial. O Pantanal é uma Zona Úmida de Importância Internacional, mas enfrenta desafios legais e ambientais para preservação. O estudo emprega técnicas de sequenciamento metagenômico, utilizando o pipeline MetaWRAP, para analisar o microbioma lagunar do Pantanal. Os objetivos incluem avaliar a diversidade bacteriana, compreender as interações com o camalote, e fornecer conhecimento para estratégias sustentáveis de conservação. A inferência taxonômica destacou a predominância do filo Proteobacteria, especialmente Alpha, Beta e Gammaproteobacteria. Regiões mais impactadas por atividades humanas mostram maior presença de patógenos como Burkholderiales. A análise de espécies identifica diferenças regionais, destacando a prevalência de Mycobacterium grossiae em Corumbá com camalote e Polynucleobacter sp. em ambas as condições em Aquidauana. Oito genomas de alta qualidade foram identificados, mais concentrados em Corumbá. A classificação funcional revela processos essenciais como tradução e transporte de aminoácidos. Foi possível inferir funções metabólicas importantes, como Pantotenato quinase e Aryl sulfatase, essenciais para o metabolismo em ecossistemas de lagoas. A análise de diversidade beta sugere diferentes composições de organismos entre as amostras, enquanto a diversidade alfa aponta maior diversidade em Aquidauana, influenciada por intervenções humanas. Esses resultados contribuem para a compreensão do impacto humano no Pantanal e fornecem informações valiosas para a conservação e gestão sustentável desses ecossistemas aquáticos.