Mineração de textos científicos visando à identificação de componentes bioativos com potencial terapêutico para o tratamento de dengue, malária e doença de Chagas

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2013
Autor(a) principal: Jezuz, Milene Pereira Guimarães de
Orientador(a): Cruz, Oswaldo Gonçalves, Caffarena, Ernesto Raul
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/13626
Resumo: As doenças negligenciadas, como a dengue, malária e doença de Chagas, entre outras, que prevalecem em países menos desenvolvidos e em ambientes cercados por condições de pobreza, afetam um sexto da população mundial, matando cerca de três mil pessoas a cada dia no mundo. Porém, pouco investimento tem sido feito em pesquisas sobre essas doenças com o fim de obter fármacos menos agressivos aos seres humanos e com ações mais eficazes. Os fármacos existentes utilizados atualmente em tratamentos para essas doenças datam de 30, 40 ou até 50 anos atrás. Existe um grande volume de trabalhos científicos disponibilizados em bibliotecas digitais que armazenam artigos voltados à descrição da biologia, imunologia e genética dos parasitas que causam estas doenças. Esses trabalhos podem ser acessados através de técnicas para mineração de textos, em busca de compostos bioativos ainda não completamente explorados que venham contribuir para o desenvolvimento de novos tratamentos contra essas doenças Com esse fim, neste trabalho é apresentada uma metodologia organizada a partir do workflow WIMBAT que utiliza métodos e técnicas de mineração de textos para possibilitar a extração de termos que descrevam tais compostos a partir de informações obtidas em bancos de dados biológicos, culminando com a construção de grafos para possibilitar a análise de associações entre os compostos identificados e a sua função aos agentes causadores destas doenças
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spelling Jezuz, Milene Pereira Guimarães deDávila, Alberto M. R.Coelho, Flávio CodeçoSilva Junior, Floriano PaesMiranda, Antonio Basilio deSantos, Leticia Miranda LeryCruz, Oswaldo GonçalvesCaffarena, Ernesto Raul2016-04-07T13:21:47Z2016-04-07T13:21:47Z2013JEZUZ, M. P. G. de. Mineração de textos científicos visando à identificação de componentes bioativos com potencial terapêutico para o tratamento de dengue, malária e doença de Chagas. 2013. 160f. Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Rio de janeiro, RJ, 2013https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/13626As doenças negligenciadas, como a dengue, malária e doença de Chagas, entre outras, que prevalecem em países menos desenvolvidos e em ambientes cercados por condições de pobreza, afetam um sexto da população mundial, matando cerca de três mil pessoas a cada dia no mundo. Porém, pouco investimento tem sido feito em pesquisas sobre essas doenças com o fim de obter fármacos menos agressivos aos seres humanos e com ações mais eficazes. Os fármacos existentes utilizados atualmente em tratamentos para essas doenças datam de 30, 40 ou até 50 anos atrás. Existe um grande volume de trabalhos científicos disponibilizados em bibliotecas digitais que armazenam artigos voltados à descrição da biologia, imunologia e genética dos parasitas que causam estas doenças. Esses trabalhos podem ser acessados através de técnicas para mineração de textos, em busca de compostos bioativos ainda não completamente explorados que venham contribuir para o desenvolvimento de novos tratamentos contra essas doenças Com esse fim, neste trabalho é apresentada uma metodologia organizada a partir do workflow WIMBAT que utiliza métodos e técnicas de mineração de textos para possibilitar a extração de termos que descrevam tais compostos a partir de informações obtidas em bancos de dados biológicos, culminando com a construção de grafos para possibilitar a análise de associações entre os compostos identificados e a sua função aos agentes causadores destas doençasNeglected diseases such as Dengue, Malaria and Chag as disease among others are prevalent in less developed countries and in environments sur rounded by poverty, affecting one-sixth of the world population, killing about 3000 people eac h day worldwide. However, a small investment has been made in research on these disea ses to obtain less aggressive drugs to humans and accomplish most effective actions and th us, the existing drugs used in treatments date back 30, 40 or even 50 years back. There is a large volume of scientific papers availa ble in digital libraries that store articles related to the description of the biology, immunolo gy and genetics of the parasites that cause these diseases and can be accessed through text min ing techniques, aiming the search of bioactive compounds not properly exploitedyet that might contribute to the development of new treatments against these diseases. To this end, this thesis presents the workflow bas ed methodology called WIMBAT that uses methods and text mining techniques to enable the ex traction of terms describing such compounds from information obtained from biologica l databases, ending within the construction of graphs that enable the specialistth e associations analysis between the identified compounds and their function to the caus ative agents of these diseasesFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, BrasilporMineração de textos científicos visando à identificação de componentes bioativos com potencial terapêutico para o tratamento de dengue, malária e doença de Chagasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2013-10-21Pós-Graduação em Biologia Computacional e SistemasFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo CruzRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Biologia Computacional e SistemasMineração de DadosDoenças NegligenciadasÁreas de PobrezaDoençasBase de Dadosinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALmilene_jezuz_ioc_dout_2013.pdfapplication/pdf1977625https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/13626/1/milene_jezuz_ioc_dout_2013.pdf319190da9936c6ea521704bed4808f50MD51LICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/13626/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTmilene_jezuz_ioc_dout_2013.pdf.txtmilene_jezuz_ioc_dout_2013.pdf.txtExtracted texttext/plain247022https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/13626/3/milene_jezuz_ioc_dout_2013.pdf.txt62e776897afe7e0dd0149a027d343bd8MD53icict/136262022-06-24 12:18:59.519oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-06-24T15:18:59Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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