Reconstrução da Rede Metabólica da Pseudomonas aeruginosa CCBH4851

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: Ramos, Thiago Giannini
• Orientador(a): Silva, Fabricio Alves Barbosa da, Menezes, Márcio Argollo Ferreira de
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/29528
• topic: Pseudomonas Aeruginosa; Sistemas de Informação; Biologia de Sistemas; Metabolismo; Redes e vias Metabólicas

As altas taxas de mortalidade e morbidade associadas a infecções nosocomiais (adquiridas em ambientes hospitalares) causadas por bactérias multi-resistentes a antibióticos constituem um problema de saúde pública no Brasil. Nesta dissertação estudou-se um desses patógenos, Pseudomonas aeruginosa, cuja cepa altamente virulenta CCBH4851 está presente em vários hospitais públicos brasileiros. A partir de dados genômicos desta cepa, gerados no Laboratório de Pesquisa em Infecção Hospitalar do Instituto Oswaldo Cruz (LAPIH/IOC/FIOCRUZ), e de modelos computacionais que integram a visão sistêmica de processos celulares a informação no nível molecular, a pesquisa realizada objetivou reconstruir a rede metabólica da P. aeruginosa CCBH4851. Para auxiliar o processo de reconstrução foram criados dois sistemas WEB: o primeiro obtém um mapa metabólico inicial da CCBH4851 a partir da coleção de seus genes anotados e armazenados em um arquivo de extensão GBK e o mapa de referência da cepa PAO1. O segundo sistema auxilia na curadoria manual do mapa reconstruído a partir da criação de um espaço virtual para discussão com especialistas. Entre os resultados obtidos com a aplicação desta metodologia, destacam-se: 1) primeira reconstrução do mapa metabólico da P. aeruginosa CCBH4851 capaz de gerar biomassa; 2) adaptação do protocolo T&P para possibilitar tal reconstrução; 3) os sistemas web que possibilitaram tais resultados; 4) uma base de conhecimento para armazenamento de informações dos modelos reconstruídos. Com estes resultados, espera-se ter contribuído para a geração de modelos futuros da P. aeruginosa CCBH4851 que auxiliem na descoberta de novas opções terapêuticas.