Análise do desempenho da técnica de PCR em tempo real para o diagnóstico da tuberculose pulmonar
| Ano de defesa: | 2012 |
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Resumo: | A tuberculose constitui um grave problema de saúde pública, com preocupação e repercussão mundial. No Brasil, foram notificados 78.564 mil casos no ano de 2011, com 83.55% dos casos da forma pulmonar, sendo Recife a capital brasileira com maior taxa de mortalidade específica por tuberculose. O controle da doença consiste em um diagnóstico precoce e eficaz associado a um tratamento adequado, contudo os métodos convencionais apresentam limitações, como a baixa sensibilidade e o resultado tardio. Por isto, métodos moleculares vêm sendo propostos para o diagnóstico de diversas doenças infecciosas. Recentemente, a técnica da reação em cadeia de polimerase em tempo real (qPCR) tem sido desenvolvida, apresentando como diferencial a capacidade de amplificação e detecção do DNA ocorrerem simultaneamente, através de um sistema de fluorescência. O estudo avaliou o desempenho da técnica de qPCR na detecção específica do complexo Mycobacterium tuberculosis nos pacientes com tuberculose pulmonar. Para avaliar o limite de detecção, foi construída uma curva de diluição a partir de cepa de referência do M. tuberculosis, em que se determinou que o sistema foi capaz de detectar até 3x100 bacilos/ml. Este limite foi correspondente ao ciclo de amplificação 30, o qual foi utilizado como limite máximo de positividade das amostras analisadas. Foram avaliadas 165 amostras de escarro de pacientes suspeitos de tuberculose pulmonar, apresentando sensibilidade de 87.9% e especificidade de 98%, considerando a cultura e/ou resposta ao tratamento específico como padrão-ouro. A técnica de qPCR demonstrou um excelente desempenho, podendo ser utilizada como uma ferramenta auxiliar para o diagnóstico da tuberculose pulmonar. O diagnóstico da TB deve estar fundamentado na análise conjunta de vários parâmetros como baciloscopia, cultura, manifestações clínicas e a prova terapêutica . |
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Lira, Laís Ariane de SiqueiraMontenegro, Lílian Maria LapaSchindler, Haiana CharifkerCavalcanti, Milena de PaivaLorena, Virgínia Maria Barros deSchindler, Haiana Charifker2024-05-02T14:07:30Z2024-05-02T14:07:30Z2012LIRA, Laís Ariane de Siqueira. Análise do desempenho da técnica de PCR em tempo real para o diagnóstico da tuberculose pulmonar. 2012. 74 pilus. Dissertação, (mestrado)-Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, Fundação Oswaldo Cruz, Recife, 2012.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/63816A tuberculose constitui um grave problema de saúde pública, com preocupação e repercussão mundial. No Brasil, foram notificados 78.564 mil casos no ano de 2011, com 83.55% dos casos da forma pulmonar, sendo Recife a capital brasileira com maior taxa de mortalidade específica por tuberculose. O controle da doença consiste em um diagnóstico precoce e eficaz associado a um tratamento adequado, contudo os métodos convencionais apresentam limitações, como a baixa sensibilidade e o resultado tardio. Por isto, métodos moleculares vêm sendo propostos para o diagnóstico de diversas doenças infecciosas. Recentemente, a técnica da reação em cadeia de polimerase em tempo real (qPCR) tem sido desenvolvida, apresentando como diferencial a capacidade de amplificação e detecção do DNA ocorrerem simultaneamente, através de um sistema de fluorescência. O estudo avaliou o desempenho da técnica de qPCR na detecção específica do complexo Mycobacterium tuberculosis nos pacientes com tuberculose pulmonar. Para avaliar o limite de detecção, foi construída uma curva de diluição a partir de cepa de referência do M. tuberculosis, em que se determinou que o sistema foi capaz de detectar até 3x100 bacilos/ml. Este limite foi correspondente ao ciclo de amplificação 30, o qual foi utilizado como limite máximo de positividade das amostras analisadas. Foram avaliadas 165 amostras de escarro de pacientes suspeitos de tuberculose pulmonar, apresentando sensibilidade de 87.9% e especificidade de 98%, considerando a cultura e/ou resposta ao tratamento específico como padrão-ouro. A técnica de qPCR demonstrou um excelente desempenho, podendo ser utilizada como uma ferramenta auxiliar para o diagnóstico da tuberculose pulmonar. O diagnóstico da TB deve estar fundamentado na análise conjunta de vários parâmetros como baciloscopia, cultura, manifestações clínicas e a prova terapêutica .Tuberculosis is a serious health problem public concern and with worldwide repercussions. On Brazil, 78.564,000 cases were reported in the year 2011, with 83.55% of cases of pulmonary, and Recife the Brazilian capital with a higher mortality rate specific for tuberculosis. The disease control is in early and effective diagnosis associated with a appropriate treatment, however, conventional methods have limitations such as low sensitivity and late results. Therefore, molecular methods have been proposed for the diagnosis of various diseases infectious. Recently, the technique of real time polymerase chain reaction (qPCR) has been developed, presenting a differential ability to DNA amplification and detection occur simultaneously, through a fluorescence system. The study evaluated the performance of the qPCR for specific detection of complex Mycobacterium tuberculosis complex in patients with pulmonary tuberculosis. To evaluate the limit of detection, was done a dilution curve from reference strain of M. tuberculosis, has been determined that the system was able to detect up to 3x100 bacilli / ml. This threshold is corresponding to the amplification cycle 30, which was used as the maximum limit of positive samples. We evaluated 165 sputum samples from patients suspected of pulmonary tuberculosis, with sensitivity of 87.9% and specificity of 98% considering the culture and / or response to treatment as the gold standard. The qPCR showed an excellent performance and can be used as an auxiliary tool for the diagnosis of pulmonary tuberculosis. The diagnosis of TB should be based on joint analysis of various parameters such as smear, culture, clinical and therapeutic trial .Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.porTuberculoseReação em Cadeia da Polimerase em Tempo RealMycobacterium tuberculosisTuberculosisReal-Time Polymerase Chain ReactionMycobacterium tuberculosisTuberculosisReacción en cadena de la polimerasa en tiempo realMycobacterium tuberculosisTuberculoseRéaction en chaîne de la polymérase en temps réelMycobacterium tuberculosisHumanosMasculinoFemininoCriançaAdolescenteTuberculoseDiagReação em Cadeia da PolimeraseMycobacterium TuberculosisGenetAnálise do desempenho da técnica de PCR em tempo real para o diagnóstico da tuberculose pulmonarAssessment of performance of the real time PCR for the diagnosis of pulmonary tuberculosisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2012-04-02Instituto Aggeu MagalhãesMestrado AcadêmicoRecife/PEPrograma de Pós-Graduação em Saúde Públicainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALlais_lira_iam_mest_2012.pdflais_lira_iam_mest_2012.pdfapplication/pdf3498209https://arca.fiocruz.br/bitstreams/1ed03718-83ed-4c97-a78a-0ef33e294103/download53320de29566b3c1b6ff756c6739aad8MD52trueAnonymousREADLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/0ec8bb46-e671-468f-b6ca-3c00deb1236a/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADTEXTlais_lira_iam_mest_2012.pdf.txtlais_lira_iam_mest_2012.pdf.txtExtracted texttext/plain102783https://arca.fiocruz.br/bitstreams/b434795e-9130-4c55-bfb7-0d6d7c056c74/downloadb4717dbcb8abf69fbf6cfa9c6f824e3aMD59falseAnonymousREADTHUMBNAILlais_lira_iam_mest_2012.pdf.jpglais_lira_iam_mest_2012.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg16767https://arca.fiocruz.br/bitstreams/a1551a9b-9c8d-45cc-97a9-b5404cec015b/downloade75f12cc2c708bc5f11fb86671ca464fMD510falseAnonymousREADicict/638162025-12-11 08:36:12.212open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/63816https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-12-11T11:36:12Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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 |
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