Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Oliveira, Luã Cardoso de
Orientador(a): Oliveira, Rosely Maria Zancope, Alves, Carlos Roberto
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Link de acesso: https://arca.fiocruz.br/handle/icict/60677
Resumo: No Rio de Janeiro observa-se uma hiperendemia de esporotricose, causada principalmente por Sporothrix brasiliensis. Espécies clínicas de S. brasiliensis, produzem urease, porém pouco se avançou no conhecimento desta. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a urease, verificar a expressão de seu gene e começar a entender seu possível papel na virulência. Foram utilizadas 2 cepas de S. brasiliensis, uma delas considerada produtora de urease e outra considerada não produtora de urease. Fenotipicamente, foi observado que apenas a cepa considerada urease positiva foi capaz de crescer em meio de cultivo cujo a ureia era a única fonte de nitrogênio, e quando esta foi cultivada em meio com inibidor tioureia apresentou pouco crescimento. Após, o extrato proteico foi submetido a ressonância plasmômica de superfície (SPR) e western blot para caracterizar a enzima bioquimicamente. A expressão gênica da urease foi verificada por qPCR e a comparação, in silico, entre a urease de S. brasiliensis, a de outros 20 fungos e de Canavalia ensiformis. A técnica de western blot não demonstrou reatividade na cepa negativa, já na SPR esta foi evidenciada nas duas cepas. A partir disto, foram realizadas reações de qPCR para verificar a expressão gênica do gene codificador da urease nas duas cepas, e em ambas o RNA mensageiro para urease está presente. Foi comparada, através de ferramentas de bioinformática, as sequencias de urease de 21 fungos e de C. ensiformis, e a urease se mostrou uma enzima bem conservada entre as espécies analisadas, e parece ser, corroborando com os achados in vitro uma enzima que se localiza no citoplasma celular. Os achados nesta tese, indicam que a urease provavelmente é um gene constitutivo neste modelo fúngico, e muito importante para o crescimento celular do S. brasiliensis, pois em condições inibitórias da enzima o fungo foi incapaz de crescer normalmente. Esses dados, juntamente com a demonstração da alta preservação desta enzima nos fungos, sugerem que a urease é importante para a fisiologia do S. brasiliensis em parasitismo
id CRUZ_e510b46fed2f2abeb9d22a20ed94cb7d
oai_identifier_str oai:arca.fiocruz.br:icict/60677
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str
spelling Oliveira, Luã Cardoso deOliveira, Rosely Maria ZancopeAlves, Carlos Roberto2023-10-03T18:42:18Z2023-10-03T18:42:18Z2020OLIVEIRA, Luã Cardoso de. Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis. 2020. 99 f. Tese (Doutorado em Pesquisa Clínica em Doenças Infecciosas) - Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, RJ, 2020.https://arca.fiocruz.br/handle/icict/60677No Rio de Janeiro observa-se uma hiperendemia de esporotricose, causada principalmente por Sporothrix brasiliensis. Espécies clínicas de S. brasiliensis, produzem urease, porém pouco se avançou no conhecimento desta. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a urease, verificar a expressão de seu gene e começar a entender seu possível papel na virulência. Foram utilizadas 2 cepas de S. brasiliensis, uma delas considerada produtora de urease e outra considerada não produtora de urease. Fenotipicamente, foi observado que apenas a cepa considerada urease positiva foi capaz de crescer em meio de cultivo cujo a ureia era a única fonte de nitrogênio, e quando esta foi cultivada em meio com inibidor tioureia apresentou pouco crescimento. Após, o extrato proteico foi submetido a ressonância plasmômica de superfície (SPR) e western blot para caracterizar a enzima bioquimicamente. A expressão gênica da urease foi verificada por qPCR e a comparação, in silico, entre a urease de S. brasiliensis, a de outros 20 fungos e de Canavalia ensiformis. A técnica de western blot não demonstrou reatividade na cepa negativa, já na SPR esta foi evidenciada nas duas cepas. A partir disto, foram realizadas reações de qPCR para verificar a expressão gênica do gene codificador da urease nas duas cepas, e em ambas o RNA mensageiro para urease está presente. Foi comparada, através de ferramentas de bioinformática, as sequencias de urease de 21 fungos e de C. ensiformis, e a urease se mostrou uma enzima bem conservada entre as espécies analisadas, e parece ser, corroborando com os achados in vitro uma enzima que se localiza no citoplasma celular. Os achados nesta tese, indicam que a urease provavelmente é um gene constitutivo neste modelo fúngico, e muito importante para o crescimento celular do S. brasiliensis, pois em condições inibitórias da enzima o fungo foi incapaz de crescer normalmente. Esses dados, juntamente com a demonstração da alta preservação desta enzima nos fungos, sugerem que a urease é importante para a fisiologia do S. brasiliensis em parasitismoIn Rio de Janeiro there is a hyperendemia of sporotrichosis, caused mainly by Sporothrix brasiliensis. Clinical species of S. brasiliensis, produce urease, but slight progress has been made in its field. The aim of this work was to characterize urease, to verify the expression of its gene and begin to understand its possible role in virulence. Two strains of S. brasiliensis were used, one of them considered a producer of urease and the other considered non-producer of urease. Phenotypically, it was observed that only the strain considered urease positive was able to grow in a culture medium which urea was the only source of nitrogen, and when it was cultivated in a medium with a thiourea inhibitor it showed little growth. Afterwards, the protein extract was submitted to surface plasmon resonance (SPR) and western blot to characterize the enzyme biochemically. The urease gene expression was verified by qPCR and the comparison, in silico, between the urease of S. brasiliensis, that of other 20 fungi and of Canavalia ensiformis. The western blot technique showed no reactivity in the negative strain, whereas in SPR it was found in both strains. From this, qPCR reactions were performed to check the gene expression of the urease encoding gene in both strains, and in both the messenger RNA for urease is present. The urease sequences of 21 fungi and C. ensiformis were compared using bioinformatics tools, and urease proved to be a well-preserved enzyme among the analyzed species, and it appears to be, corroborating with the in vitro findings an enzyme that locates in the cell cytoplasm. The findings in this thesis indicate that urease is probably a constitutive gene in this fungal model, and very important for the cellular growth of S. brasiliensis, because under enzyme inhibitory conditions the fungus was unable to grow normally. These data, together with the demonstration of the high preservation of this enzyme in fungi, suggest that urease is important for the physiology of S. brasiliensis in parasitismFundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porSporothrix brasiliensisUreaseCaracterização BioquímicaSporothrix brasiliensisUreaseBiochemical CharacterizationSporothrixUreaseExpressão GênicaBioquímicaCaracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2020Instituto Nacional de Infectologia Evandro ChagasFundação Oswaldo CruzRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Pesquisa Clínica em Doenças Infecciosasinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://arca.fiocruz.br/bitstreams/818b9c9a-b8d4-4bdd-b6e4-94f6e4ae1f8a/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51falseAnonymousREADORIGINALlua_oliveira_ini_dout_2020.pdfapplication/pdf2161785https://arca.fiocruz.br/bitstreams/ec6fb8e3-8273-4d71-9edd-56936b5808d2/downloadf6145f1fc0e1b809700173dc12f5e3afMD52trueAnonymousREADTEXTlua_oliveira_ini_dout_2020.pdf.txtlua_oliveira_ini_dout_2020.pdf.txtExtracted texttext/plain102621https://arca.fiocruz.br/bitstreams/f801c262-ed66-4c40-a3b2-f325650b1adc/download1f994410d710770a4d373b20550f2a12MD55falseAnonymousREADTHUMBNAILlua_oliveira_ini_dout_2020.pdf.jpglua_oliveira_ini_dout_2020.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3138https://arca.fiocruz.br/bitstreams/5ed3e5c5-c8ba-4deb-942b-f4cd023488c1/download4bfa876eaaf9acbdf22a71c231bd3d7aMD56falseAnonymousREADicict/606772025-07-30 00:31:34.274open.accessoai:arca.fiocruz.br:icict/60677https://arca.fiocruz.brRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352025-07-30T03:31:34Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)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
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
title Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
spellingShingle Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
Oliveira, Luã Cardoso de
Sporothrix brasiliensis
Urease
Caracterização Bioquímica
Sporothrix brasiliensis
Urease
Biochemical Characterization
Sporothrix
Urease
Expressão Gênica
Bioquímica
title_short Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
title_full Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
title_fullStr Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
title_full_unstemmed Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
title_sort Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis
author Oliveira, Luã Cardoso de
author_facet Oliveira, Luã Cardoso de
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Oliveira, Luã Cardoso de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Oliveira, Rosely Maria Zancope
Alves, Carlos Roberto
contributor_str_mv Oliveira, Rosely Maria Zancope
Alves, Carlos Roberto
dc.subject.other.none.fl_str_mv Sporothrix brasiliensis
Urease
Caracterização Bioquímica
topic Sporothrix brasiliensis
Urease
Caracterização Bioquímica
Sporothrix brasiliensis
Urease
Biochemical Characterization
Sporothrix
Urease
Expressão Gênica
Bioquímica
dc.subject.en.none.fl_str_mv Sporothrix brasiliensis
Urease
Biochemical Characterization
dc.subject.decs.none.fl_str_mv Sporothrix
Urease
Expressão Gênica
Bioquímica
description No Rio de Janeiro observa-se uma hiperendemia de esporotricose, causada principalmente por Sporothrix brasiliensis. Espécies clínicas de S. brasiliensis, produzem urease, porém pouco se avançou no conhecimento desta. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a urease, verificar a expressão de seu gene e começar a entender seu possível papel na virulência. Foram utilizadas 2 cepas de S. brasiliensis, uma delas considerada produtora de urease e outra considerada não produtora de urease. Fenotipicamente, foi observado que apenas a cepa considerada urease positiva foi capaz de crescer em meio de cultivo cujo a ureia era a única fonte de nitrogênio, e quando esta foi cultivada em meio com inibidor tioureia apresentou pouco crescimento. Após, o extrato proteico foi submetido a ressonância plasmômica de superfície (SPR) e western blot para caracterizar a enzima bioquimicamente. A expressão gênica da urease foi verificada por qPCR e a comparação, in silico, entre a urease de S. brasiliensis, a de outros 20 fungos e de Canavalia ensiformis. A técnica de western blot não demonstrou reatividade na cepa negativa, já na SPR esta foi evidenciada nas duas cepas. A partir disto, foram realizadas reações de qPCR para verificar a expressão gênica do gene codificador da urease nas duas cepas, e em ambas o RNA mensageiro para urease está presente. Foi comparada, através de ferramentas de bioinformática, as sequencias de urease de 21 fungos e de C. ensiformis, e a urease se mostrou uma enzima bem conservada entre as espécies analisadas, e parece ser, corroborando com os achados in vitro uma enzima que se localiza no citoplasma celular. Os achados nesta tese, indicam que a urease provavelmente é um gene constitutivo neste modelo fúngico, e muito importante para o crescimento celular do S. brasiliensis, pois em condições inibitórias da enzima o fungo foi incapaz de crescer normalmente. Esses dados, juntamente com a demonstração da alta preservação desta enzima nos fungos, sugerem que a urease é importante para a fisiologia do S. brasiliensis em parasitismo
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-10-03T18:42:18Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-10-03T18:42:18Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv OLIVEIRA, Luã Cardoso de. Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis. 2020. 99 f. Tese (Doutorado em Pesquisa Clínica em Doenças Infecciosas) - Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, RJ, 2020.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://arca.fiocruz.br/handle/icict/60677
identifier_str_mv OLIVEIRA, Luã Cardoso de. Caracterização molecular e funcional da enzima urease (URE) de Sporothrix brasiliensis. 2020. 99 f. Tese (Doutorado em Pesquisa Clínica em Doenças Infecciosas) - Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, RJ, 2020.
url https://arca.fiocruz.br/handle/icict/60677
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://arca.fiocruz.br/bitstreams/818b9c9a-b8d4-4bdd-b6e4-94f6e4ae1f8a/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/ec6fb8e3-8273-4d71-9edd-56936b5808d2/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/f801c262-ed66-4c40-a3b2-f325650b1adc/download
https://arca.fiocruz.br/bitstreams/5ed3e5c5-c8ba-4deb-942b-f4cd023488c1/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
f6145f1fc0e1b809700173dc12f5e3af
1f994410d710770a4d373b20550f2a12
4bfa876eaaf9acbdf22a71c231bd3d7a
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1839716774999752704