Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveis
| Ano de defesa: | 2010 |
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Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto
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Resumo: | Introduction. The diagnosis of paucibacillary forms of tuberculosis (TB), which mostly affects children, immunocompromised patients, transplanted and extra-pulmonary forms is limited by phenotypic techniques of smear and culture. Moreover, the diagnosis of mycobacteriosis, also has committed itself by the phenotypic methods. The polymerase chain reaction (PCR) and its variations, such as Nested-PCR (NPCR), has been described as promising techniques for rapid diagnosis of tuberculosis and mycobacteriosis. Objective. Evaluation of a NPCR protocol for detection of Mycobacterium tuberculosis in pulmonary and extrapulmonary anatomic sites of patients with clinical suspicion of TB. Subjects and Methods. Were included, prospectively, 24 pulmonary samples of 85 extrapulmonary, collected from 49 individuals HIV-seropositive and 28 HIV-seronegative and submitted to the gold standard method and NPCR targeting the transposon IS6110. Results. Tuberculosis was diagnosed in 11 patients (14,3%), with 54,5% of extrapulmonary forms and 45,5% pulmonary. The NPCR was positive in all, while the culture was positive in only seven of them. Smear positivity among the clinical specimens was 9,2%. The culture allowed the isolation of seven strains of M. tuberculosis and two M. avium complex (8,25%). The molecular positivity was described in 23,85% of samples. NPCR's performance against the culture, for pulmonary (n=22) and extrapulmonary samples (n = 83) was similar (100% sensitivity and specificity of approximately 83%). Positivity by NPCR was significantly greater than the isolation by culture among the extrapulmonary samples (p = 0,0042). Conclusions. The results suggest to perform further studies to corroborate the potential of NPCR-IS6110 for detection of mycobacterial genome in extrapulmonary TB, especially among immunocompromised. Furthermore, the detection of mycobacteria remains as diagnostic confirmation and the opportunity of investigation of the sensitivity profile, promoting effective treatment for any age and immune status. |
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The diagnosis of paucibacillary forms of tuberculosis (TB), which mostly affects children, immunocompromised patients, transplanted and extra-pulmonary forms is limited by phenotypic techniques of smear and culture. Moreover, the diagnosis of mycobacteriosis, also has committed itself by the phenotypic methods. The polymerase chain reaction (PCR) and its variations, such as Nested-PCR (NPCR), has been described as promising techniques for rapid diagnosis of tuberculosis and mycobacteriosis. Objective. Evaluation of a NPCR protocol for detection of Mycobacterium tuberculosis in pulmonary and extrapulmonary anatomic sites of patients with clinical suspicion of TB. Subjects and Methods. Were included, prospectively, 24 pulmonary samples of 85 extrapulmonary, collected from 49 individuals HIV-seropositive and 28 HIV-seronegative and submitted to the gold standard method and NPCR targeting the transposon IS6110. Results. Tuberculosis was diagnosed in 11 patients (14,3%), with 54,5% of extrapulmonary forms and 45,5% pulmonary. The NPCR was positive in all, while the culture was positive in only seven of them. Smear positivity among the clinical specimens was 9,2%. The culture allowed the isolation of seven strains of M. tuberculosis and two M. avium complex (8,25%). The molecular positivity was described in 23,85% of samples. NPCR's performance against the culture, for pulmonary (n=22) and extrapulmonary samples (n = 83) was similar (100% sensitivity and specificity of approximately 83%). Positivity by NPCR was significantly greater than the isolation by culture among the extrapulmonary samples (p = 0,0042). Conclusions. The results suggest to perform further studies to corroborate the potential of NPCR-IS6110 for detection of mycobacterial genome in extrapulmonary TB, especially among immunocompromised. Furthermore, the detection of mycobacteria remains as diagnostic confirmation and the opportunity of investigation of the sensitivity profile, promoting effective treatment for any age and immune status.Introdução. O diagnóstico das formas paucibacilares da tuberculose (TB), que acomete principalmente crianças, imunocomprometidos, transplantados e formas extrapulmonares é limitado pelas técnicas fenotípicas de baciloscopia e cultura. Ademais, o diagnóstico das micobacterioses, também apresenta-se comprometido pelos métodos fenotípicos. A reação da polymerase em cadeia (PCR) e suas variações, tais como a Nested-PCR (NPCR), tem sido descritas como técnicas promissoras para o rápido diagnóstico da tuberculose e micobacterioses. Objetivos. Avaliação de um protocolo de NPCR para detecção do complexo Mycobacterium tuberculosis em sítios anatômicos pulmonares e extrapulmonares de indivíduos com suspeita clínica de TB. Casuística e Método. Foram incluídas, prospectivamente, 24 amostras de sítios pulmonares e 85 extrapulmonares, coletadas a partir de 49 indivíduos soropositivos para o HIV e 28 soronegativos e submetidas ao método gold standard e a NPCR tendo como alvo o transposon IS6110. Resultados. A tuberculose foi diagnosticada em 11 pacientes (14,3%), com 54,5% de formas extrapulmonares e 45,5% pulmonares. A NPCR foi positiva em todos, enquanto a cultura em apenas cinco deles. A positividade da baciloscopia entre os espécimes clínicos foi de 9.2%. A cultura permitiu o isolamento de sete cepas de M. tuberculosis e duas do Complexo M. avium (8,25%). A positividade molecular foi descrita em 23,85% das amostras. O desempenho da NPCR frente a cultura, para amostras pulmonares (n=22) e extrapulmonares (n=83) foi similar (100% de sensibilidade e aproximadamente 83% de especificidade). A positividade pela NPCR foi significantemente maior que o isolamento por cultura entre as amostras extrapulmonares (p=0.0042). Conclusões. Os resultados obtidos sugerem a realização de estudos mais amplos que corroborem o potencial da NPCR-IS6110 para a detecção do genoma micobacteriano na TB extrapulmonar, em especial entre imunocomprometidos. Ademais, a detecção da micobactéria permanece como confirmação diagnóstica e a oportunidade de investigação do perfil de sensibilidade, favorecendo o tratamento efetivo para qualquer faixa etária e status imunológico.Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 adrianafurini_dissert.pdf: 2158923 bytes, checksum: d683b1dc320b2c811cfcf58d6d1c21ac (MD5) Previous issue date: 2010-11-18Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico::123123123123::600application/pdfporFaculdade de Medicina de São José do Rio PretoPrograma de Pós-Graduação em Ciências da Saúde::123123123123::600FAMERPBRMedicina Interna; Medicina e Ciências Correlatas::123123123123::600Molecular diagnosisMycobacterium tuberculosisNested PCRPaucibacillaryTransposon IS6110Pulmonary MedicineTuberculosisTuberculoseHIVNested-PCRMycobacterium spp.PneumologiaTuberculoseHIVNeumologíaVIHCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::MEDICINA::CLINICA MEDICA::PNEUMOLOGIA::123123123123::600Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERPinstname:Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)instacron:FAMERPORIGINALadrianafurini_dissert.pdfapplication/pdf2158923d683b1dc320b2c811cfcf58d6d1c21acMD51http://bdtd.famerp.br/bitstream/tede/135/1/adrianafurini_dissert.pdftede/1352019-02-04 11:06:04.233oai:localhost:tede/135Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.famerp.br/PUBhttps://bdtd.famerp.br/oai/requestsbdc@famerp.br||joao.junior@famerp.bropendoar:47112019-02-04T13:06:04Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)false |
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