Análise dos mecanismos de manutenção do genoma: efeitos da radiação gama em células do sistema imunológico
| Ano de defesa: | 2021 |
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Mesquita, Daniele GonçalvesGoés, Evamberto Garcia2025-03-21T00:50:27Z2025-03-21T00:50:27Z2021MESQUITA, Daniele Gonçalves. Análise dos mecanismos de manutenção do genoma: efeitos da radiação gama em células do sistema imunológico. 2021. 55 f. Dissertação (Mestrado em Física) - Programa de Pós-graduação em Física, Instituto de Matemática, Estatística e Física, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, 2021.https://repositorio.furg.br/handle/123456789/12423Dissertação (Mestrado)A radiossensibilidade intrínseca de diferentes tipos de células cancerosas tem sido extensivamente estudada, mas os mecanismos subjacentes ao dano celular são poucos conhecidos. Estudos recentes indicam que a radioterapia recruta o sistema imunológico e isto pode aumentar a eficiência do tratamento radioterápico. Neste estudo, são analisadas amostras de transcriptomas associadas às células do sistema imunológico, disponibilizadas pelo banco de dados Gene Expression Omnibus (GEO), relacionados aos linfócitos T e linfócitos B isolados do sangue total e irradiadas com dose de 150, 300, 600 e 1000 cGy. O objetivo deste estudo é a determinação dos efeitos da radiação gama nas vias associadas aos mecanismos de conservação do genoma. A relação entre genes e vias foi estabelecido através do Banco de Dados Reactome. O comportamento dessas vias foi analisado através de cálculos associados à atividade e diversidade relativas, e o método bootstrap foi usado para testar os efeitos produzidos pela irradiação em relação ao controle. Essa análise foi realizada através do software ViaComplex. Foram investigadas 22 subvias que compõem 5 vias associadas aos mecanismos de manutenção do genoma. Observou-se que a irradiação modulou de forma positiva a ativação da resposta de 3 subvias para a dose de 150 cGy, 12 subvias para a dose de 300 cGy, 13 subvias para a dose de 600 cGy e 7 subvias para a dose de 1000 cGy. Portanto, as doses intermediárias de 300 e 600 cGy são mais relevantes para a ativação dos mecanismos de conservação do genoma em comparação as doses de 150 e 1000 cGy.The intrinsic radiosensitivity of different types of cancer cells has been extensively studied, however the mechanisms underlying cell damage are poorly understood. Recent studies indicate that radiotherapy recruits the immune system, and this can increase the efficiency of radiotherapy treatment. In this work, samples of transcriptomes associated with the cells of the immune system are analyzed, available by the Gene Expression Omnibus (GEO) database, related to T lymphocytes and B lymphocytes isolated from whole blood and irradiated with doses of 150, 300, 600 and 1000 cGy. The aim of this study is to determine the effects of gamma radiation on the pathways associated to genome maintenance mechanisms. The relationship between genes and pathways was established through the Reactome Database. The behavior of these pathways was analyzed using calculations associated with relative activity and diversity, and the bootstrap method was used to test the effects produced by irradiation in relation to the control. This analysis was performed using the ViaComplex software. In the present study 24 subpathways were analyzed which make up 5 pathways associated with the genome maintenance mechanisms. It was observed the irradiation positively modulated the activation of the response of 3 subpathways for dose of 150 cGy, while dose of 300 cGy activated 12 subpathways, dose 600 cGy activated 13 subpathways and the dose of 1000 cGy activated 7 subpathways. Therefore, the intermediate doses of 300 and 600 cGy are more relevant for the activation of the genome maintenance mechanisms in comparison to the doses of 150 and 1000 cGy.porFísicaRadiação ionizanteRadiação gamaLinfócitosManutenção do genomaPhysicsIonizing radiationGamma radiationLymphocytesGenome maintenanceAnálise dos mecanismos de manutenção do genoma: efeitos da radiação gama em células do sistema imunológicoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FURG (RI FURG)instname:Universidade Federal do Rio Grande (FURG)instacron:FURGLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.furg.br/bitstreams/bda475b2-bf62-4ca6-9ea1-c5c603a81db4/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52falseAnonymousREADORIGINALDaniele Gonçalves Mesquita.pdfDaniele Gonçalves Mesquita.pdfapplication/pdf847305https://repositorio.furg.br/bitstreams/06410436-b594-4333-bd33-73b17a2d26a0/download116e0388f80fdb5408448cf6b0d0f1a6MD51trueAnonymousREADTEXTDaniele Gonçalves Mesquita.pdf.txtDaniele Gonçalves Mesquita.pdf.txtExtracted texttext/plain102810https://repositorio.furg.br/bitstreams/60d631f1-b72d-4724-be08-39c8e881c93a/download2072a4cd3e5a88e0ebd84a5966f25bc6MD53falseAnonymousREADTHUMBNAILDaniele Gonçalves Mesquita.pdf.jpgDaniele Gonçalves Mesquita.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3098https://repositorio.furg.br/bitstreams/3c670eda-c81a-48e0-8919-3f3e42d71096/download436db83236904e93125d8f5f053478a4MD54falseAnonymousREAD123456789/124232025-12-10 01:25:40.825open.accessoai:repositorio.furg.br:123456789/12423https://repositorio.furg.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.furg.br/oai/request || http://200.19.254.174/oai/requestrepositorio@furg.br||sib.bdtd@furg.bropendoar:2025-12-10T04:25:40Repositório Institucional da FURG (RI FURG) - Universidade Federal do Rio Grande (FURG)falseTk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo= |
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