O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Russo, Silvana da Cunha
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
Escola de Ciências
Brasil
PUCRS
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Receptor Canabinoide
Desenho de Fármacos
Docking
Agonista Inverso
Proteína de Membrana
GPCR
Cannabinoid Receptor
Drug Design
Inverse Agonist
Membrane Protein
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
Link de acesso: http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/9393
Resumo: O Receptor Canabinoide 1 (CB1) é uma proteína de membrana prevalente no Sistema Nervoso Central (SNC), e teve sua estrutura cristalográfica foi recentemente resolvida e disponibilizada. Mais estudos são necessários na investigação da estrutura tridimensional dos complexos de CB1 com seus ligantes, para auxiliar no desenvolvimento de novos fármacos. Nosso objetivo aqui foi realizar simulações computacionais do CB1, focando nas suas interações com ligantes potenciais. Nós começamos com uma revisão de literatura e então descrevemos os estudos recentes sobre a estrutura cristalográfica do CB1. Nós reportamos o desenvolvimento de um novo protocolo de docking molecular para investigar ligantes em potencial contra o CB1. Nós usamos a informação estrutural para descrever as interações intermoleculares de complexos CB1-ligantes. Nós também descrevemos a metodologia de docking molecular para simular as interações do CB1 com agonistas inversos, e também com agonistas. A análise da estrutura cristalográfica e os resultados de docking molecular revelaram os resíduos responsáveis pela especificidade dos agonistas inversos e3 dos agonistas pelo CB1. A maioria das interações intermoleculares envolve resíduos hidrofóbicos, e algumas ligações de hidrogênio intermoleculares destacando a importância da exploração das interações intermoleculares no desenvolvimento de novos agonistas inversos.
id P_RS_30db9b7aab5a00054fd65a0a1b9b3d46
oai_identifier_str oai:tede2.pucrs.br:tede/9393
network_acronym_str P_RS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
repository_id_str
spelling O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformáticaReceptor CanabinoideDesenho de FármacosDockingAgonista InversoProteína de MembranaGPCRCannabinoid ReceptorDrug DesignDockingInverse AgonistMembrane ProteinGPCRCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALO Receptor Canabinoide 1 (CB1) é uma proteína de membrana prevalente no Sistema Nervoso Central (SNC), e teve sua estrutura cristalográfica foi recentemente resolvida e disponibilizada. Mais estudos são necessários na investigação da estrutura tridimensional dos complexos de CB1 com seus ligantes, para auxiliar no desenvolvimento de novos fármacos. Nosso objetivo aqui foi realizar simulações computacionais do CB1, focando nas suas interações com ligantes potenciais. Nós começamos com uma revisão de literatura e então descrevemos os estudos recentes sobre a estrutura cristalográfica do CB1. Nós reportamos o desenvolvimento de um novo protocolo de docking molecular para investigar ligantes em potencial contra o CB1. Nós usamos a informação estrutural para descrever as interações intermoleculares de complexos CB1-ligantes. Nós também descrevemos a metodologia de docking molecular para simular as interações do CB1 com agonistas inversos, e também com agonistas. A análise da estrutura cristalográfica e os resultados de docking molecular revelaram os resíduos responsáveis pela especificidade dos agonistas inversos e3 dos agonistas pelo CB1. A maioria das interações intermoleculares envolve resíduos hidrofóbicos, e algumas ligações de hidrogênio intermoleculares destacando a importância da exploração das interações intermoleculares no desenvolvimento de novos agonistas inversos.Cannabinoid Receptor 1 (CB1) is a membrane protein prevalent in the Central Nervous System (SNC), whose crystallographic structure has recently been solved. Studies will be needed to investigate CB1 complexes with its ligands and its role in the development of new drugs. Our goal here was to carry out computational simulations of CB1, with focus on its interations with potential ligands. We start with a literature review, and then we describe recent studies on CB1 crystallographic structure. We report the development of a docking protocol to investigate potential ligands against CB1. We use this structural information to depict CB1-ligand interactions. We also describe the molecular docking method to obtain complex structures of CB1 with inverse agonists, and also with agonists. Analisis of the crystallographic structure and docking results revealed the residues responsible for the specificity of the inverse agonists and agonists for CB1. Most of the intermolecular interactions involve hydrophobic residues, and some intermolecular hydrogen bonds highlighting the importance of the exploration of intermolecular interactions in the development of novel inverse agonists.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESPontifícia Universidade Católica do Rio Grande do SulEscola de CiênciasBrasilPUCRSPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularAzevedo Junior, Walter Filgueira dehttp://lattes.cnpq.br/4183276948524704Russo, Silvana da Cunha2020-11-16T18:47:27Z2020-09-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/9393porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RSinstname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)instacron:PUC_RS2020-11-16T22:00:28Zoai:tede2.pucrs.br:tede/9393Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucrs.br/tede2/PRIhttps://tede2.pucrs.br/oai/requestbiblioteca.central@pucrs.br||opendoar:2020-11-16T22:00:28Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)false
dc.title.none.fl_str_mv O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
title O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
spellingShingle O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
Russo, Silvana da Cunha
Receptor Canabinoide
Desenho de Fármacos
Docking
Agonista Inverso
Proteína de Membrana
GPCR
Cannabinoid Receptor
Drug Design
Docking
Inverse Agonist
Membrane Protein
GPCR
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
title_short O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
title_full O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
title_fullStr O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
title_full_unstemmed O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
title_sort O receptor Canabinoide 1 : desafios no desenho de fármacos com enfoque nas ferramentas da bioinformática
author Russo, Silvana da Cunha
author_facet Russo, Silvana da Cunha
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Azevedo Junior, Walter Filgueira de
http://lattes.cnpq.br/4183276948524704
dc.contributor.author.fl_str_mv Russo, Silvana da Cunha
dc.subject.por.fl_str_mv Receptor Canabinoide
Desenho de Fármacos
Docking
Agonista Inverso
Proteína de Membrana
GPCR
Cannabinoid Receptor
Drug Design
Docking
Inverse Agonist
Membrane Protein
GPCR
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
topic Receptor Canabinoide
Desenho de Fármacos
Docking
Agonista Inverso
Proteína de Membrana
GPCR
Cannabinoid Receptor
Drug Design
Docking
Inverse Agonist
Membrane Protein
GPCR
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
description O Receptor Canabinoide 1 (CB1) é uma proteína de membrana prevalente no Sistema Nervoso Central (SNC), e teve sua estrutura cristalográfica foi recentemente resolvida e disponibilizada. Mais estudos são necessários na investigação da estrutura tridimensional dos complexos de CB1 com seus ligantes, para auxiliar no desenvolvimento de novos fármacos. Nosso objetivo aqui foi realizar simulações computacionais do CB1, focando nas suas interações com ligantes potenciais. Nós começamos com uma revisão de literatura e então descrevemos os estudos recentes sobre a estrutura cristalográfica do CB1. Nós reportamos o desenvolvimento de um novo protocolo de docking molecular para investigar ligantes em potencial contra o CB1. Nós usamos a informação estrutural para descrever as interações intermoleculares de complexos CB1-ligantes. Nós também descrevemos a metodologia de docking molecular para simular as interações do CB1 com agonistas inversos, e também com agonistas. A análise da estrutura cristalográfica e os resultados de docking molecular revelaram os resíduos responsáveis pela especificidade dos agonistas inversos e3 dos agonistas pelo CB1. A maioria das interações intermoleculares envolve resíduos hidrofóbicos, e algumas ligações de hidrogênio intermoleculares destacando a importância da exploração das interações intermoleculares no desenvolvimento de novos agonistas inversos.
publishDate 2020
dc.date.none.fl_str_mv 2020-11-16T18:47:27Z
2020-09-17
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/9393
url http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/9393
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
Escola de Ciências
Brasil
PUCRS
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
publisher.none.fl_str_mv Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
Escola de Ciências
Brasil
PUCRS
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
instacron:PUC_RS
instname_str Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
instacron_str PUC_RS
institution PUC_RS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
repository.mail.fl_str_mv biblioteca.central@pucrs.br||
_version_ 1850041300971159552

Registros relacionados