Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2013
Autor(a) principal: Saranholi, Bruno Henrique
Orientador(a): Galetti Júnior, Pedro Manoel
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de São Carlos
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
Departamento: Não Informado pela instituição
País: BR
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5512
Resumo: The loss and fragmentation of habitat due to intensive human intervention are the main threats to natural populations. Species with low density and large home range, like felids, are the most threatened species by these changes. In an attempt to minimize this impact, detection of population density and genetic characterization are necessary to propose conservation measures. Thus, the main objective of this study was to characterize the populations of two species of felines, cougars (Puma concolor) and ocelots (Leopardus pardalis) of Caetetus Ecological Station (EEC - SP, one of the last remnants of Atlantic Forest within the state of São Paulo), about their demographic and genetic characteristics from non-invasive samples (feces and hairs).We collected the samples on EEC tracks and identified the species, individualized each sample, sexed each individual and calculated the genetic diversity of the population using molecular markers. Abundance was estimated from the capture-recapture historic, with opened and closed population models. We identified 17 samples of feces cougar and 12 of ocelot. Of these samples, six individuals were individualized as cougar and five as ocelot, these numbers represent the minimum population sizes for the entire sample period (18 months). The values of abundance and density estimated using the model of closed population was more similar to that found in genetic individualization, five individuals for each species and densities of 4.92/100 km2 (P. concolor) and 19.51/100 km2 (L. pardalis). The genetic diversity of the two species was lower than that from other studies, probably due the landscape´s fragmentation, which reduces the gene flow with others populations. Also, the genetic diversity for L. pardalis was lower than P. concolor, which is possibly related to the ocelot behavior of avoid opened and disturbed areas, which can reduce the potential for gene flow. Furthermore, we also observed structure of P. concolor from EEC with populations from other locations, but we also identified gene flow, including relatedness. Thus, the results of genetic diversity and demographics demonstrate the importance of the Ecological Station Caetetus for these species and also underscores the importance of establishing measures to enable the viability of its populations over long term, as facilitating gene flow with individuals from others locations.
id SCAR_179dc3526e325d8d0a2437b2585d1dae
oai_identifier_str oai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/5512
network_acronym_str SCAR
network_name_str Repositório Institucional da UFSCAR
repository_id_str
spelling Saranholi, Bruno HenriqueGaletti Júnior, Pedro Manoelhttp://lattes.cnpq.br/75011552111832883e45e068-1938-49a1-92db-c1b3a934b6572016-06-02T20:21:30Z2013-04-182016-06-02T20:21:30Z2013-02-28SARANHOLI, Bruno Henrique. Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos. 2013. 67 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2013.https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5512The loss and fragmentation of habitat due to intensive human intervention are the main threats to natural populations. Species with low density and large home range, like felids, are the most threatened species by these changes. In an attempt to minimize this impact, detection of population density and genetic characterization are necessary to propose conservation measures. Thus, the main objective of this study was to characterize the populations of two species of felines, cougars (Puma concolor) and ocelots (Leopardus pardalis) of Caetetus Ecological Station (EEC - SP, one of the last remnants of Atlantic Forest within the state of São Paulo), about their demographic and genetic characteristics from non-invasive samples (feces and hairs).We collected the samples on EEC tracks and identified the species, individualized each sample, sexed each individual and calculated the genetic diversity of the population using molecular markers. Abundance was estimated from the capture-recapture historic, with opened and closed population models. We identified 17 samples of feces cougar and 12 of ocelot. Of these samples, six individuals were individualized as cougar and five as ocelot, these numbers represent the minimum population sizes for the entire sample period (18 months). The values of abundance and density estimated using the model of closed population was more similar to that found in genetic individualization, five individuals for each species and densities of 4.92/100 km2 (P. concolor) and 19.51/100 km2 (L. pardalis). The genetic diversity of the two species was lower than that from other studies, probably due the landscape´s fragmentation, which reduces the gene flow with others populations. Also, the genetic diversity for L. pardalis was lower than P. concolor, which is possibly related to the ocelot behavior of avoid opened and disturbed areas, which can reduce the potential for gene flow. Furthermore, we also observed structure of P. concolor from EEC with populations from other locations, but we also identified gene flow, including relatedness. Thus, the results of genetic diversity and demographics demonstrate the importance of the Ecological Station Caetetus for these species and also underscores the importance of establishing measures to enable the viability of its populations over long term, as facilitating gene flow with individuals from others locations.A perda e fragmentação do habitat, decorrentes da intensa intervenção antrópica, estão entre as principais ameaças às populações naturais. Espécies com baixa densidade e grandes áreas de vida, como os felinos, são ainda mais prejudicadas por essas mudanças. Na tentativa de minimizar esse impacto, a detecção da densidade populacional e a caracterização genética são necessárias para que medidas de conservação sejam propostas. Nesse sentido, o objetivo principal deste trabalho foi caracterizar populações de duas espécies de felinos, onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica dos Caetetus (EEC SP, um dos últimos remanescentes de Mata Atlântica no interior do estado de São Paulo), quanto às suas características demográficas e genéticas, a partir de amostras não invasivas (fezes e pelos). Coletamos as amostras nas trilhas da EEC, das quais pudemos identificar as espécies, individualizar, sexar cada indivíduo e calcular a diversidade genética da população utilizando marcadores moleculares. A abundância foi estimada a partir do histórico de captura-recaptura com modelos de população aberta e fechada. Identificamos geneticamente 17 amostras de fezes de onça-parda e 12 de jaguatirica. Dessas amostras, individualizamos seis indivíduos de onça-parda e cinco de jaguatirica, sendo esses os tamanhos populacionais mínimos para todo o período de amostragem (18 meses, entre dezembro de 2010 a maio de 2013). Os valores de estimativa de abundância e densidade utilizando o modelo de população fechada foram mais próximos ao encontrado na individualização genética, sendo cinco indivíduos para cada espécie e densidades de 4,92/100 km2 (P. concolor) e 19,51/100 km2 (L. pardalis). A diversidade genética encontrada para as duas espécies foi menor quando comparada com outros trabalhos, provavelmente ao menor fluxo gênico com outras populações devido à fragmentação da paisagem. Além disso, a diversidade genética encontrada para L. pardalis foi menor quando comparada a P. concolor, possivelmente relacionado ao hábito da espécie em evitar áreas mais abertas e antropizadas, o que pode reduzir o potencial de fluxo gênico. Já para P. concolor foi encontrada estruturação com populações de outras localidades, mas também identificamos fluxo gênico, inclusive com relações de parentesco. Dessa forma, os resultados obtidos de demografia e diversidade genética demostram a importância da Estação Ecológica dos Caetetus para essas espécies e também ressalta a importância da criação de medidas que permitam a viabilidade de suas populações a longo prazo, como as que facilitem fluxo gênico com indivíduos de outras localidades.Universidade Federal de Minas Geraisapplication/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarBRGenética de populaçõesGenética da conservaçãoDNA fecalAmostras não invasivasCarnívorosDensidadeFecal DNANoninvasive samplesConservationCarnivoresDensityCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICADemografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis21591697-d537-499e-8a95-46132103682einfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINAL5005.pdfapplication/pdf2296978https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/fe368484-0fd3-4cd5-9fa9-c36406e1117b/download77a669d7d6cbf4916130d05c32dc1e39MD51trueAnonymousREADTEXT5005.pdf.txt5005.pdf.txtExtracted texttext/plain0https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/8e1cf42f-9032-43af-b0e9-dbe06097f02e/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54falseAnonymousREADTHUMBNAIL5005.pdf.jpg5005.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6533https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/e02a78f5-1290-45ea-97e3-7ca039221349/download5f5a77eea8f646087cba33efde09f201MD55falseAnonymousREAD20.500.14289/55122025-02-06 04:14:47.339open.accessoai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/5512https://repositorio.ufscar.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestrepositorio.sibi@ufscar.bropendoar:43222025-02-06T07:14:47Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false
dc.title.por.fl_str_mv Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
title Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
spellingShingle Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
Saranholi, Bruno Henrique
Genética de populações
Genética da conservação
DNA fecal
Amostras não invasivas
Carnívoros
Densidade
Fecal DNA
Noninvasive samples
Conservation
Carnivores
Density
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
title_short Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
title_full Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
title_fullStr Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
title_full_unstemmed Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
title_sort Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos
author Saranholi, Bruno Henrique
author_facet Saranholi, Bruno Henrique
author_role author
dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7501155211183288
dc.contributor.author.fl_str_mv Saranholi, Bruno Henrique
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Galetti Júnior, Pedro Manoel
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 3e45e068-1938-49a1-92db-c1b3a934b657
contributor_str_mv Galetti Júnior, Pedro Manoel
dc.subject.por.fl_str_mv Genética de populações
Genética da conservação
DNA fecal
Amostras não invasivas
Carnívoros
Densidade
topic Genética de populações
Genética da conservação
DNA fecal
Amostras não invasivas
Carnívoros
Densidade
Fecal DNA
Noninvasive samples
Conservation
Carnivores
Density
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
dc.subject.eng.fl_str_mv Fecal DNA
Noninvasive samples
Conservation
Carnivores
Density
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
description The loss and fragmentation of habitat due to intensive human intervention are the main threats to natural populations. Species with low density and large home range, like felids, are the most threatened species by these changes. In an attempt to minimize this impact, detection of population density and genetic characterization are necessary to propose conservation measures. Thus, the main objective of this study was to characterize the populations of two species of felines, cougars (Puma concolor) and ocelots (Leopardus pardalis) of Caetetus Ecological Station (EEC - SP, one of the last remnants of Atlantic Forest within the state of São Paulo), about their demographic and genetic characteristics from non-invasive samples (feces and hairs).We collected the samples on EEC tracks and identified the species, individualized each sample, sexed each individual and calculated the genetic diversity of the population using molecular markers. Abundance was estimated from the capture-recapture historic, with opened and closed population models. We identified 17 samples of feces cougar and 12 of ocelot. Of these samples, six individuals were individualized as cougar and five as ocelot, these numbers represent the minimum population sizes for the entire sample period (18 months). The values of abundance and density estimated using the model of closed population was more similar to that found in genetic individualization, five individuals for each species and densities of 4.92/100 km2 (P. concolor) and 19.51/100 km2 (L. pardalis). The genetic diversity of the two species was lower than that from other studies, probably due the landscape´s fragmentation, which reduces the gene flow with others populations. Also, the genetic diversity for L. pardalis was lower than P. concolor, which is possibly related to the ocelot behavior of avoid opened and disturbed areas, which can reduce the potential for gene flow. Furthermore, we also observed structure of P. concolor from EEC with populations from other locations, but we also identified gene flow, including relatedness. Thus, the results of genetic diversity and demographics demonstrate the importance of the Ecological Station Caetetus for these species and also underscores the importance of establishing measures to enable the viability of its populations over long term, as facilitating gene flow with individuals from others locations.
publishDate 2013
dc.date.available.fl_str_mv 2013-04-18
2016-06-02T20:21:30Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2013-02-28
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-06-02T20:21:30Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SARANHOLI, Bruno Henrique. Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos. 2013. 67 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2013.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5512
identifier_str_mv SARANHOLI, Bruno Henrique. Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos. 2013. 67 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2013.
url https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5512
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.authority.fl_str_mv 21591697-d537-499e-8a95-46132103682e
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFSCar
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSCAR
instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron:UFSCAR
instname_str Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron_str UFSCAR
institution UFSCAR
reponame_str Repositório Institucional da UFSCAR
collection Repositório Institucional da UFSCAR
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/fe368484-0fd3-4cd5-9fa9-c36406e1117b/download
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/8e1cf42f-9032-43af-b0e9-dbe06097f02e/download
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/e02a78f5-1290-45ea-97e3-7ca039221349/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 77a669d7d6cbf4916130d05c32dc1e39
d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e
5f5a77eea8f646087cba33efde09f201
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.sibi@ufscar.br
_version_ 1851688924038037504