Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt
| Ano de defesa: | 2003 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Carlos
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
BR
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5513 |
Resumo: | The evaluation of genetic relationships among broodstocks is a useful tool for culture management programs. In the present work, the relationships amongst four broodstocks of the marine shrimp Litopenaeus vannamei were established based on sequencing of 16S rRNA and COI regions from mtDNA. Farfantepenaeus subtilis was used as outgoup in mtDNA analysis. No divergence was found when sequences of the 16S rRNA gene were compared, likely due to the conservativeness of such region. Otherwise, at the dendrogram obtained from COI gene sequencing, clustering between Aqua-044 and Aqua-045 broodstocks and between Aqua-046 and Aqua-051 broodstocks was observed. The formation of these groupings may be related to the origin of the broodstocks as well as to the effects of genetic drift suffered by the founder populations. The results obtained in the present work may constitute a very useful tool for the delineation of more appropriate management programs for the analyzed broodstocks. |
| id |
SCAR_21d8a9838fade77b4e9bd96047a8c553 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/5513 |
| network_acronym_str |
SCAR |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Francisco, Ana Karina deGaletti Júnior, Pedro Manoelhttp://lattes.cnpq.br/7398754661670478e31550b7-a929-4826-a147-65e6548713c82016-06-02T20:21:31Z2004-08-142016-06-02T20:21:31Z2003-08-22FRANCISCO, Ana Karina de. Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt. 2003. 73 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2003.https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5513The evaluation of genetic relationships among broodstocks is a useful tool for culture management programs. In the present work, the relationships amongst four broodstocks of the marine shrimp Litopenaeus vannamei were established based on sequencing of 16S rRNA and COI regions from mtDNA. Farfantepenaeus subtilis was used as outgoup in mtDNA analysis. No divergence was found when sequences of the 16S rRNA gene were compared, likely due to the conservativeness of such region. Otherwise, at the dendrogram obtained from COI gene sequencing, clustering between Aqua-044 and Aqua-045 broodstocks and between Aqua-046 and Aqua-051 broodstocks was observed. The formation of these groupings may be related to the origin of the broodstocks as well as to the effects of genetic drift suffered by the founder populations. The results obtained in the present work may constitute a very useful tool for the delineation of more appropriate management programs for the analyzed broodstocks.O estudo das relações genéticas entre estoques constitui-se em uma ferramenta de grande utilidade em programas de cultivo. No presente trabalho foram estabelecidas as relações entre cinco plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, com base no seqüenciamento das regiões RNAr 16S e COI do DNAmt. A espécie Farfantepenaeus subtilis foi utilizada como grupo externo. Não foram encontradas divergências genéticas entre as seqüências do gene 16S RNAr, possivelmente, devido ao fato de se tratar de uma região conservada. Já no dendrograma obtido a partir do seqüenciamento do gene COI pôde-se observar a formação de dois agrupamentos, um deles envolvendo os plantéis Aqua-044 e Aqua-045, e o outro, os plantéis Aqua-046 e Aqua-051. A formação desses agrupamentos pode estar relacionada à origem dos plantéis, bem como aos efeitos de deriva genética sofridos pelas populações fundadoras. Os resultados obtidos no presente trabalho podem constituir-se numa ferramenta de grande utilidade para o delineamento de programas de manejo mais adequados para os plantéis estudados.Financiadora de Estudos e Projetosapplication/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarBRGenéticaCamarãoDistância genéticaDNAMitocondrialCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICARelações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmtinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis21591697-d537-499e-8a95-46132103682einfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARTEXTDissAKF.pdf.txtDissAKF.pdf.txtExtracted texttext/plain87561https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/52963076-1252-4a99-8879-6ae4bb6e6229/download64b3b32911669910f1e6c492c29acad7MD53falseAnonymousREADORIGINALDissAKF.pdfapplication/pdf1115886https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/65f906bb-976e-454b-b5e7-c121f5f6d1fc/download522e86b0776e4eba05d6b4ea1822d056MD51trueAnonymousREADTHUMBNAILDissAKF.pdf.jpgDissAKF.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7112https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/7c731b2e-b58e-4dfe-92ae-5889c63033f1/downloaddf76a3498926eeb68bdb501713fd5fcdMD52falseAnonymousREAD20.500.14289/55132025-02-05 22:13:43.969open.accessoai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/5513https://repositorio.ufscar.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestrepositorio.sibi@ufscar.bropendoar:43222025-02-06T01:13:43Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false |
| dc.title.por.fl_str_mv |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt |
| title |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt |
| spellingShingle |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt Francisco, Ana Karina de Genética Camarão Distância genética DNA Mitocondrial CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| title_short |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt |
| title_full |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt |
| title_fullStr |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt |
| title_full_unstemmed |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt |
| title_sort |
Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt |
| author |
Francisco, Ana Karina de |
| author_facet |
Francisco, Ana Karina de |
| author_role |
author |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Francisco, Ana Karina de |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Galetti Júnior, Pedro Manoel |
| dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/7398754661670478 |
| dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
e31550b7-a929-4826-a147-65e6548713c8 |
| contributor_str_mv |
Galetti Júnior, Pedro Manoel |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Genética Camarão Distância genética DNA Mitocondrial |
| topic |
Genética Camarão Distância genética DNA Mitocondrial CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| description |
The evaluation of genetic relationships among broodstocks is a useful tool for culture management programs. In the present work, the relationships amongst four broodstocks of the marine shrimp Litopenaeus vannamei were established based on sequencing of 16S rRNA and COI regions from mtDNA. Farfantepenaeus subtilis was used as outgoup in mtDNA analysis. No divergence was found when sequences of the 16S rRNA gene were compared, likely due to the conservativeness of such region. Otherwise, at the dendrogram obtained from COI gene sequencing, clustering between Aqua-044 and Aqua-045 broodstocks and between Aqua-046 and Aqua-051 broodstocks was observed. The formation of these groupings may be related to the origin of the broodstocks as well as to the effects of genetic drift suffered by the founder populations. The results obtained in the present work may constitute a very useful tool for the delineation of more appropriate management programs for the analyzed broodstocks. |
| publishDate |
2003 |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2003-08-22 |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2004-08-14 2016-06-02T20:21:31Z |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2016-06-02T20:21:31Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
FRANCISCO, Ana Karina de. Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt. 2003. 73 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2003. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5513 |
| identifier_str_mv |
FRANCISCO, Ana Karina de. Relações genéticas entre plantéis de reprodutores do camarão marinho Litopenaeus vannamei, através do seqüenciamento dos genes RNAr 16S e COI do DNAmt. 2003. 73 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2003. |
| url |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5513 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.authority.fl_str_mv |
21591697-d537-499e-8a95-46132103682e |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
| dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv |
| dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFSCar |
| dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFSCAR instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) instacron:UFSCAR |
| instname_str |
Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| instacron_str |
UFSCAR |
| institution |
UFSCAR |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| collection |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/52963076-1252-4a99-8879-6ae4bb6e6229/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/65f906bb-976e-454b-b5e7-c121f5f6d1fc/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/7c731b2e-b58e-4dfe-92ae-5889c63033f1/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
64b3b32911669910f1e6c492c29acad7 522e86b0776e4eba05d6b4ea1822d056 df76a3498926eeb68bdb501713fd5fcd |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.sibi@ufscar.br |
| _version_ |
1851688814578237440 |