Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites
| Ano de defesa: | 2009 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Carlos
|
| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
BR
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Palavras-chave em Inglês: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5457 |
Resumo: | A preliminary genetic linkage map was constructed for the species Prochilodus argenteus, an endemic fish from the São Francisco river basin, using 23 microsatellite markers in a progeny with 95 individuals from a single cross by the pseudo-testcross strategy. The male and female parents were collected in different regions, downstream of the dam of the Três Marias (MG). Only 11 (52.4%) markers grouped in some linkage group and the the remaining was unlinked. Twenty-one (91.5%) markers appeared to segregate according to Mendelian inheritance, and only two (8.7%) showed segregation distortion. The map covered 297.58 cM of the genome, according to the Kosambi s function. The number of linkage groups (3) found in this study was much lower than expected for the species (equivalent to the haploid number of chromosomes, n = 27), demonstrating the importance of using a larger number of molecular markers in future studies. The data obtained in this work will be compiled with the marks obtained by AFLP by Rojas (2008) in order to obtain a denser genetic map. Although the number of linkage groups found have been lower than expected for the species, the results can be considered promising for the Brazillian Fish Genetics, since genetic mapping studies are virtually absent in Neotropical fish. |
| id |
SCAR_4caabdc87b3ce42724e0283655570e1c |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/5457 |
| network_acronym_str |
SCAR |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Bianchi, Beatriz CutilakHatanaka, Terumihttp://lattes.cnpq.br/1666878061867996http://lattes.cnpq.br/91369009244018844af46ba0-332e-448a-875f-3cba2e3a98872016-06-02T20:21:21Z2009-12-032016-06-02T20:21:21Z2009-08-28BIANCHI, Beatriz Cutilak. Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites. 2009. 60 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2009.https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5457A preliminary genetic linkage map was constructed for the species Prochilodus argenteus, an endemic fish from the São Francisco river basin, using 23 microsatellite markers in a progeny with 95 individuals from a single cross by the pseudo-testcross strategy. The male and female parents were collected in different regions, downstream of the dam of the Três Marias (MG). Only 11 (52.4%) markers grouped in some linkage group and the the remaining was unlinked. Twenty-one (91.5%) markers appeared to segregate according to Mendelian inheritance, and only two (8.7%) showed segregation distortion. The map covered 297.58 cM of the genome, according to the Kosambi s function. The number of linkage groups (3) found in this study was much lower than expected for the species (equivalent to the haploid number of chromosomes, n = 27), demonstrating the importance of using a larger number of molecular markers in future studies. The data obtained in this work will be compiled with the marks obtained by AFLP by Rojas (2008) in order to obtain a denser genetic map. Although the number of linkage groups found have been lower than expected for the species, the results can be considered promising for the Brazillian Fish Genetics, since genetic mapping studies are virtually absent in Neotropical fish.Um mapa genético preliminar foi construído para a espécie Prochilodus argenteus, um peixe endêmico da bacia hidrográfica do rio São Francisco, através de 23 marcadores moleculares microssatélites em uma progênie com 95 indivíduos provenientes de um único cruzamento através da estratégia pseudo-testcross . Os genitores masculino e feminino foram coletados em diferentes regiões, à jusante da barragem de Três Marias (MG). Apenas 11 (52.4%) marcadores foram alocados em algum grupo de ligação e os restantes não estavam ligados. Vinte e um (91.5%) marcadores segregaram de acordo com a herança mendeliana e apenas dois (8.7%) apresentaram distorção da segregação. O mapa cobriu 297.58 cM do genoma, de acordo com a função de Kosambi. O número de grupos de ligação (3) encontrado no presente trabalho foi muito inferior ao esperado para a espécie (equivalente ao número de cromossomos haplóides, n = 27), demonstrando a importância da utilização de um número maior de marcadores moleculares em estudos futuros. Os dados obtidos no presente trabalho serão compilados com as marcas AFLP obtidas por Rojas (2008), visando um mapa genético mais denso. Embora o número de grupos de ligação encontrado tenha sido inferior ao esperado para a espécie, os resultados podem ser considerados como promissores na área de Genética de Peixes do Brasil, já que estudos de mapeamento genético são praticamente inexistentes em peixes neotropicais.Financiadora de Estudos e Projetosapplication/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarBRGenéticaProchilodus argenteusMicrossatélitesPseudo-testcrossMapa genéticoMicrosatellitesLinkage mapCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAConstrução do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélitesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis-1-1beac922e-4a9d-4e48-8388-d139fe0f6c4finfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARTEXT2646.pdf.txt2646.pdf.txtExtracted texttext/plain102622https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/3f82aa98-01e6-4f65-a4fa-ed3e709dc1ac/downloadd7be9909693528231cda44c9135d7709MD53falseAnonymousREADORIGINAL2646.pdfapplication/pdf870244https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/bf651c42-781f-4d40-a45d-bbf1c749a8cb/downloadb88bf96aa8cafe0798c953895db021a7MD51trueAnonymousREADTHUMBNAIL2646.pdf.jpg2646.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6371https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/45a0b6d8-a2e8-4fec-b573-8400b03f0b4c/downloadfd4df8acbc6d57afaeb2752411a74f07MD52falseAnonymousREAD20.500.14289/54572025-02-05 15:12:54.727open.accessoai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/5457https://repositorio.ufscar.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestrepositorio.sibi@ufscar.bropendoar:43222025-02-05T18:12:54Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false |
| dc.title.por.fl_str_mv |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites |
| title |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites |
| spellingShingle |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites Bianchi, Beatriz Cutilak Genética Prochilodus argenteus Microssatélites Pseudo-testcross Mapa genético Microsatellites Linkage map CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| title_short |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites |
| title_full |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites |
| title_fullStr |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites |
| title_full_unstemmed |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites |
| title_sort |
Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites |
| author |
Bianchi, Beatriz Cutilak |
| author_facet |
Bianchi, Beatriz Cutilak |
| author_role |
author |
| dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/9136900924401884 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Bianchi, Beatriz Cutilak |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Hatanaka, Terumi |
| dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/1666878061867996 |
| dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
4af46ba0-332e-448a-875f-3cba2e3a9887 |
| contributor_str_mv |
Hatanaka, Terumi |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Genética Prochilodus argenteus Microssatélites Pseudo-testcross Mapa genético |
| topic |
Genética Prochilodus argenteus Microssatélites Pseudo-testcross Mapa genético Microsatellites Linkage map CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| dc.subject.eng.fl_str_mv |
Microsatellites Linkage map |
| dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
| description |
A preliminary genetic linkage map was constructed for the species Prochilodus argenteus, an endemic fish from the São Francisco river basin, using 23 microsatellite markers in a progeny with 95 individuals from a single cross by the pseudo-testcross strategy. The male and female parents were collected in different regions, downstream of the dam of the Três Marias (MG). Only 11 (52.4%) markers grouped in some linkage group and the the remaining was unlinked. Twenty-one (91.5%) markers appeared to segregate according to Mendelian inheritance, and only two (8.7%) showed segregation distortion. The map covered 297.58 cM of the genome, according to the Kosambi s function. The number of linkage groups (3) found in this study was much lower than expected for the species (equivalent to the haploid number of chromosomes, n = 27), demonstrating the importance of using a larger number of molecular markers in future studies. The data obtained in this work will be compiled with the marks obtained by AFLP by Rojas (2008) in order to obtain a denser genetic map. Although the number of linkage groups found have been lower than expected for the species, the results can be considered promising for the Brazillian Fish Genetics, since genetic mapping studies are virtually absent in Neotropical fish. |
| publishDate |
2009 |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2009-12-03 2016-06-02T20:21:21Z |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2009-08-28 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2016-06-02T20:21:21Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
BIANCHI, Beatriz Cutilak. Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites. 2009. 60 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2009. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5457 |
| identifier_str_mv |
BIANCHI, Beatriz Cutilak. Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites. 2009. 60 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2009. |
| url |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/5457 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.confidence.fl_str_mv |
-1 -1 |
| dc.relation.authority.fl_str_mv |
beac922e-4a9d-4e48-8388-d139fe0f6c4f |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
| dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv |
| dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFSCar |
| dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFSCAR instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) instacron:UFSCAR |
| instname_str |
Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| instacron_str |
UFSCAR |
| institution |
UFSCAR |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| collection |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/3f82aa98-01e6-4f65-a4fa-ed3e709dc1ac/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/bf651c42-781f-4d40-a45d-bbf1c749a8cb/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/45a0b6d8-a2e8-4fec-b573-8400b03f0b4c/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
d7be9909693528231cda44c9135d7709 b88bf96aa8cafe0798c953895db021a7 fd4df8acbc6d57afaeb2752411a74f07 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.sibi@ufscar.br |
| _version_ |
1851688797550411776 |