Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil
| Ano de defesa: | 2020 |
|---|---|
| Autor(a) principal: | |
| Orientador(a): | |
| Banca de defesa: | |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos |
| Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
|
| Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
| País: |
Não Informado pela instituição
|
| Palavras-chave em Português: | |
| Palavras-chave em Inglês: | |
| Área do conhecimento CNPq: | |
| Link de acesso: | https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12887 |
Resumo: | The giant armadillo, Priodontes maximus, is a neotropical mammal that belongs to the Xenarthra superorder. The species is widely distributed in nine countries in South America. Although its distribution is wide, it occurs in low densities in most areas. P. maximus is listed as "vulnerable" on the IUCN Red List of Threatened Species due to a recent population decline caused by anthropic actions. Knowledge of the population's genetic structure and diversity is an essential issue that must be considered when proposing conservation actions, however, those data are not available for this specie. Thus, the present study represents the first population genetic work and aims to investigate the distribution of the genetic diversity of P. maximus, in the Midwest region of Brazil, covering areas in the Pantanal and Cerrado biomes. We used 14 microsatellite markers selected by new generation sequencing and amplified in 41 samples of giant armadillos collected in the study area. The microsatellites developed in this work proved to be useful for the genetic studies carried out. The results of spatial Bayesian grouping indicated the presence of two clusters (K = 2) within the sample, separating individuals from Cerrado and Pantanal. We found moderate levels of heterozygosity expected in the two clusters, however, both groups showed low allelic diversity and effective allele number, which may reflect the recent population reduction described for the species. The development of these specific microsatellites opens the possibility for further population studies on P. maximus, including the populations found in the remnants of the Atlantic Forest, where the species is at great risk of local extinction. The data obtained in the present study also provide important information for understanding the ecology of these animals and can be used in species management plans. |
| id |
SCAR_5f7df60ccb027d1aeeb48f74a0787a57 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/12887 |
| network_acronym_str |
SCAR |
| network_name_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Rodrigues, Nayra TaveiraGaletti Júnior, Pedro Manoelhttp://lattes.cnpq.br/7398754661670478http://lattes.cnpq.br/7220999637124580aab306de-e435-491c-b895-62862177ad002020-06-09T09:19:20Z2020-06-09T09:19:20Z2020-03-30RODRIGUES, Nayra Taveira. Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil. 2020. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2020. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12887.https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12887The giant armadillo, Priodontes maximus, is a neotropical mammal that belongs to the Xenarthra superorder. The species is widely distributed in nine countries in South America. Although its distribution is wide, it occurs in low densities in most areas. P. maximus is listed as "vulnerable" on the IUCN Red List of Threatened Species due to a recent population decline caused by anthropic actions. Knowledge of the population's genetic structure and diversity is an essential issue that must be considered when proposing conservation actions, however, those data are not available for this specie. Thus, the present study represents the first population genetic work and aims to investigate the distribution of the genetic diversity of P. maximus, in the Midwest region of Brazil, covering areas in the Pantanal and Cerrado biomes. We used 14 microsatellite markers selected by new generation sequencing and amplified in 41 samples of giant armadillos collected in the study area. The microsatellites developed in this work proved to be useful for the genetic studies carried out. The results of spatial Bayesian grouping indicated the presence of two clusters (K = 2) within the sample, separating individuals from Cerrado and Pantanal. We found moderate levels of heterozygosity expected in the two clusters, however, both groups showed low allelic diversity and effective allele number, which may reflect the recent population reduction described for the species. The development of these specific microsatellites opens the possibility for further population studies on P. maximus, including the populations found in the remnants of the Atlantic Forest, where the species is at great risk of local extinction. The data obtained in the present study also provide important information for understanding the ecology of these animals and can be used in species management plans.O tatu-canastra, Priodontes maximus, é um mamífero neotropical que pertencente a super ordem dos Xenarthra. A espécie está amplamente distribuída por nove países da América do Sul. Embora sua distribuição seja ampla, ele ocorre em populações descontínuas e de baixa densidade na maioria das áreas. P. maximus está listado como "vulnerável" na Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas da IUCN devido a um recente declínio populacional causado, provavelmente, por ações antrópicas. Uma questão importante que deve ser considerada ao propor ações para conservação é o conhecimento da diversidade e da estrutura genética de populações naturais. Entretanto, esses dados não estão disponíveis para a espécie focal desse trabalho. Dessa forma, o presente estudo representa o primeiro trabalho genético populacional que visa investigar a distribuição da diversidade genética em P. maximus, na região Centro-Oeste brasileira, abrangendo áreas nos biomas Pantanal e Cerrado. Foram utilizados 14 marcadores microssatélites selecionados por sequenciamento de nova geração e amplificados em 41 amostras de tatus-canastra coletadas na área de estudo. Os microssatélites desenvolvidos neste trabalho mostraram-se bastante úteis para as análises genéticas realizadas. Os resultados de agrupamento bayesiano espacial indicaram a presença de dois clusters (K = 2) dentro da amostragem, separando os indivíduos do Cerrado e Pantanal. Encontramos níveis moderados de heterozigosidade esperada nos dois clusters, porém, ambos os grupos apresentaram diversidade alélica e número efetivo de alelos baixo, o que pode ser reflexo da recente redução populacional descrita para a espécie. O desenvolvimento desses microssatélites específicos abre a possibilidade para a realização de outros estudos populacionais em P. maximus, incluindo as populações encontradas nos remanescentes de Mata Atlântica, onde a espécie está com grande risco de extinção local. Os dados obtidos no presente estudo fornecem informações importantes também para entendimento da ecologia desses animais e poderão ser utilizados em planos de manejo da espécie.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)CAPES: Código de Financiamento 001porUniversidade Federal de São CarlosCâmpus São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessMicrossatélitesGenética da conservaçãoMicrosatellitesConservation geneticsCingulataXenarthraCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICACIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::ZOOLOGIA APLICADA::CONSERVACAO DAS ESPECIES ANIMAISDiversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do BrasilGenetic diversity and population structure of the giant armadillo (Priodontes maximus) in an area of Central-West Brazilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis60060021591697-d537-499e-8a95-46132103682ereponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINALDissertação Rodrigues, NT. Versão FINAL.pdfDissertação Rodrigues, NT. Versão FINAL.pdfDissertação completaapplication/pdf1693510https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/308eb69b-d1c5-4ac6-aed8-aec2489e6090/download6151832e2659d0f12aee94753893280fMD53trueAnonymousREAD2022-01-01Carta comrpovante versão final.pdfCarta comrpovante versão final.pdfcarta versão finalapplication/pdf90423https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/cf1c0021-3850-4ada-a589-c3b7b1558252/download9da42eb16c6fed10c0af06e53d284e4cMD54falseAnonymousREAD2022-01-01CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/3409cb0a-bcae-4565-bfaf-0d8c377a49d5/downloade39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD55falseAnonymousREAD2022-01-01TEXTDissertação Rodrigues, NT. Versão FINAL.pdf.txtDissertação Rodrigues, NT. Versão FINAL.pdf.txtExtracted texttext/plain131612https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/8aab0121-5286-4c27-a855-bcc04350e474/downloadcc8e32e7accf1ee0c693bfa3eb04af03MD510falseAnonymousREAD2022-01-01Carta comrpovante versão final.pdf.txtCarta comrpovante versão final.pdf.txtExtracted texttext/plain1315https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/2b435f2f-7e90-4358-9851-1533fe53d72c/download3f96a3e15d325e7ab5c8a0e3decf7160MD512falseAnonymousREAD2022-01-01THUMBNAILDissertação Rodrigues, NT. Versão FINAL.pdf.jpgDissertação Rodrigues, NT. Versão FINAL.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3697https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/2ae89347-52d7-473b-b4f4-ecefd801afda/downloadbee09e1ea07dac74a7f74c810cf1e5c5MD511falseAnonymousREAD2022-01-01Carta comrpovante versão final.pdf.jpgCarta comrpovante versão final.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg13541https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/671ad8d9-16ec-4216-a972-4437a71fed37/download084ed6f8fd076247f334b96efd5be893MD513falseAnonymousREAD2022-01-0120.500.14289/128872025-02-05 18:29:11.533http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilopen.accessoai:repositorio.ufscar.br:20.500.14289/12887https://repositorio.ufscar.brRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestrepositorio.sibi@ufscar.bropendoar:43222025-02-05T21:29:11Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false |
| dc.title.por.fl_str_mv |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil |
| dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
Genetic diversity and population structure of the giant armadillo (Priodontes maximus) in an area of Central-West Brazil |
| title |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil |
| spellingShingle |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil Rodrigues, Nayra Taveira Microssatélites Genética da conservação Microsatellites Conservation genetics Cingulata Xenarthra CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::ZOOLOGIA APLICADA::CONSERVACAO DAS ESPECIES ANIMAIS |
| title_short |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil |
| title_full |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil |
| title_fullStr |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil |
| title_full_unstemmed |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil |
| title_sort |
Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil |
| author |
Rodrigues, Nayra Taveira |
| author_facet |
Rodrigues, Nayra Taveira |
| author_role |
author |
| dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/7220999637124580 |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Rodrigues, Nayra Taveira |
| dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Galetti Júnior, Pedro Manoel |
| dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/7398754661670478 |
| dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
aab306de-e435-491c-b895-62862177ad00 |
| contributor_str_mv |
Galetti Júnior, Pedro Manoel |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Microssatélites Genética da conservação |
| topic |
Microssatélites Genética da conservação Microsatellites Conservation genetics Cingulata Xenarthra CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::ZOOLOGIA APLICADA::CONSERVACAO DAS ESPECIES ANIMAIS |
| dc.subject.eng.fl_str_mv |
Microsatellites Conservation genetics Cingulata Xenarthra |
| dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::ZOOLOGIA APLICADA::CONSERVACAO DAS ESPECIES ANIMAIS |
| description |
The giant armadillo, Priodontes maximus, is a neotropical mammal that belongs to the Xenarthra superorder. The species is widely distributed in nine countries in South America. Although its distribution is wide, it occurs in low densities in most areas. P. maximus is listed as "vulnerable" on the IUCN Red List of Threatened Species due to a recent population decline caused by anthropic actions. Knowledge of the population's genetic structure and diversity is an essential issue that must be considered when proposing conservation actions, however, those data are not available for this specie. Thus, the present study represents the first population genetic work and aims to investigate the distribution of the genetic diversity of P. maximus, in the Midwest region of Brazil, covering areas in the Pantanal and Cerrado biomes. We used 14 microsatellite markers selected by new generation sequencing and amplified in 41 samples of giant armadillos collected in the study area. The microsatellites developed in this work proved to be useful for the genetic studies carried out. The results of spatial Bayesian grouping indicated the presence of two clusters (K = 2) within the sample, separating individuals from Cerrado and Pantanal. We found moderate levels of heterozygosity expected in the two clusters, however, both groups showed low allelic diversity and effective allele number, which may reflect the recent population reduction described for the species. The development of these specific microsatellites opens the possibility for further population studies on P. maximus, including the populations found in the remnants of the Atlantic Forest, where the species is at great risk of local extinction. The data obtained in the present study also provide important information for understanding the ecology of these animals and can be used in species management plans. |
| publishDate |
2020 |
| dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2020-06-09T09:19:20Z |
| dc.date.available.fl_str_mv |
2020-06-09T09:19:20Z |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2020-03-30 |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.citation.fl_str_mv |
RODRIGUES, Nayra Taveira. Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil. 2020. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2020. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12887. |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12887 |
| identifier_str_mv |
RODRIGUES, Nayra Taveira. Diversidade genética e estruturação populacional do tatu-canastra (Priodontes maximus) em uma área do Centro-Oeste do Brasil. 2020. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2020. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12887. |
| url |
https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/12887 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
| language |
por |
| dc.relation.confidence.fl_str_mv |
600 600 |
| dc.relation.authority.fl_str_mv |
21591697-d537-499e-8a95-46132103682e |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos Câmpus São Carlos |
| dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv |
| dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFSCar |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos Câmpus São Carlos |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFSCAR instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) instacron:UFSCAR |
| instname_str |
Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| instacron_str |
UFSCAR |
| institution |
UFSCAR |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| collection |
Repositório Institucional da UFSCAR |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/308eb69b-d1c5-4ac6-aed8-aec2489e6090/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/cf1c0021-3850-4ada-a589-c3b7b1558252/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/3409cb0a-bcae-4565-bfaf-0d8c377a49d5/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/8aab0121-5286-4c27-a855-bcc04350e474/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/2b435f2f-7e90-4358-9851-1533fe53d72c/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/2ae89347-52d7-473b-b4f4-ecefd801afda/download https://repositorio.ufscar.br/bitstreams/671ad8d9-16ec-4216-a972-4437a71fed37/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
6151832e2659d0f12aee94753893280f 9da42eb16c6fed10c0af06e53d284e4c e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 cc8e32e7accf1ee0c693bfa3eb04af03 3f96a3e15d325e7ab5c8a0e3decf7160 bee09e1ea07dac74a7f74c810cf1e5c5 084ed6f8fd076247f334b96efd5be893 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.sibi@ufscar.br |
| _version_ |
1851688783028682752 |